More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0476 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0476  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 106 aa  201  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.651583  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  45.1 
 
 		 155 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  45.1 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  45.1 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  45.1 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  45.1 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  45.1 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  45.1 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  45.1 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  45.1 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  44.12 
 
 		 105 aa  80.1  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  45.1 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  45.1 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2052  small multidrug resistance protein  42.45 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712643 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1298  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0613  hypothetical protein  37.62 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0595  hypothetical protein  37.62 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  40.2 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  43.4 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  40.57 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5837  quaternary ammonium compound-resistance protein sugE  42.57 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0853  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 105 aa  73.6  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2608  small multidrug resistance protein  39.62 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  40.57 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0415  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179992 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  38.68 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0996  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.762024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  43.14 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0685  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  40.57 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.177322 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2198  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2320  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3312  small multidrug resistance protein  39 
 
 		 106 aa  70.1  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0627719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1276  small multidrug resistance protein  38.61 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3195  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141243 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1950  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.498297  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  38.68 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2408  small multidrug resistance protein  39.39 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  41.18 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5609  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.329891  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4409  small multidrug resistance protein  40.57 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4254  small multidrug resistance protein  40.57 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2158  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2650  small multidrug resistance protein  45.19 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4387  small multidrug resistance protein  40.57 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1027  sugE protein  43.4 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2305  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1670  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2282  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0100  sugE protein  37.86 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1257  SMR family multidrug efflux pump  39.62 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303472  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1249  SMR family multidrug efflux pump  39.62 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0373  sugE protein  39.62 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1870  sugE protein  39.62 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.437905  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1399  suppresses groEL, may be chaperone  39.62 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0777  sugE protein  39.62 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590294  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1090  sugE protein  39.62 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1005  sugE protein  36.54 
 
 		 104 aa  67  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4068  small multidrug resistance protein  41.51 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  34.91 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  42.16 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40170  putative transporter  41.18 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0773  sugE protein  39.22 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.757365  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0796  small multidrug resistance protein  37.62 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0780  sugE protein  39.22 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0616  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.88639  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2478  small multidrug resistance protein  37.37 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0600  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  37.25 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8958  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  36.27 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4125  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2170  small multidrug resistance protein  35.64 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2430  small multidrug resistance protein  37.74 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5065  small multidrug resistance protein  37.14 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.929302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1352  small multidrug resistance protein  35.92 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0979  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2904  small multidrug resistance protein  38.61 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174839  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1397  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118337 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3646  small multidrug resistance protein  36.11 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1403  small multidrug resistance protein  36.27 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0526825  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1394  small multidrug resistance protein  36.89 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1672  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.737958  normal  0.915426 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1502  small multidrug resistance protein  38 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1392  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2515  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.686448  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0455  multidrug resistance protein SugE, putative  33.98 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>