227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1812 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1812  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 144 aa  286  8e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2406  SMR family multidrug efflux pump  56.8 
 
 		 136 aa  140  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.374447  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0063  small multidrug resistance protein  54.47 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2060  small multidrug resistance protein  42.11 
 
 		 135 aa  90.1  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3791  putative drug efflux transporter  46.02 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.773212  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1360  small multidrug resistance protein  45.95 
 
 		 114 aa  84.3  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44520  putative drug efflux transporter  41.61 
 
 		 122 aa  84  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.44142 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1691  multidrug efflux system protein MdtJ  38.52 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.190656  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1583  multidrug efflux system protein MdtJ  38.52 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.159233 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1858  multidrug efflux system protein MdtJ  37.7 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.636253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1651  multidrug efflux system protein MdtJ  37.7 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1592  multidrug efflux system protein MdtJ  37.7 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.999303 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001962  spermidine export protein mdtJ  37.82 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2020  multidrug resistance protein MdtJ  40.65 
 
 		 147 aa  76.6  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.993103  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2131  small multidrug resistance protein  40.65 
 
 		 147 aa  76.6  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2409  multidrug resistance protein MdtJ  40.65 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00258719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2766  small multidrug resistance protein  38.79 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131803  normal  0.0168064 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01569  multidrug efflux system transporter  37.01 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2043  small multidrug resistance protein  37.01 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.899542  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01559  hypothetical protein  37.01 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1786  multidrug efflux system protein MdtJ  37.01 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1599  multidrug efflux system protein MdtJ  37.01 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.62917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1674  multidrug efflux system protein MdtJ  37.01 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1807  multidrug efflux system protein MdtJ  37.01 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2030  multidrug efflux system protein MdtJ  37.01 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2310  multidrug efflux system protein MdtJ  37.01 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00509  cation transporter  35.48 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1911  multidrug efflux system protein MdtJ  33.07 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2305  small multidrug resistance protein  41.07 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.148395  normal  0.149185 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0556  SMR family multidrug efflux pump  37.14 
 
 		 113 aa  70.1  0.000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1188  SMR family multidrug efflux pump  38.1 
 
 		 113 aa  70.1  0.000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1307  SMR family multidrug efflux pump  37.14 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1863  small multidrug resistance protein  29.46 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0718  small multidrug resistance protein  35.96 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  30.89 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  31.48 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1080  conserved hypothetical protein, putative multidrug resistance efflux protein  37.65 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.644229  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  30.56 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  30.08 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  33.01 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  29.27 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  29.27 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  32.14 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  32.14 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  34 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  30.91 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1319  small multidrug resistance protein  37.61 
 
 		 106 aa  57  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0145783  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3545  small multidrug resistance protein  25.76 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3716  small multidrug resistance protein  25.76 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  28.57 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1102  small multidrug resistance protein  30.77 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  30.84 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1095  SMR drug efflux transporter  31.3 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.1863  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  30.1 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  30.48 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0536  small multidrug resistance protein  30.1 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568122  normal  0.0651219 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0657  small multidrug resistance protein  30 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  30.1 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3228  multidrug efflux protein  31.78 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0308245  hitchhiker  0.000780201 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  32 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38630  cation/cationic drug transporter  31.19 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  32.04 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0987  small multidrug resistance efflux protein  31 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25874  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1603  multidrug efflux protein  30.84 
 
 		 110 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352426 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  34.86 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0813  multidrug efflux protein  30.84 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.109831  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3466  small multidrug resistance protein  28.85 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2036  multidrug efflux protein  30.84 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  29.81 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1762  small multidrug resistance protein  31.58 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0986  small multidrug resistance protein  30.63 
 
 		 291 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1476  SMR drug efflux transporter  31.46 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0118  small multidrug resistance protein  28.7 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4979  small multidrug resistance protein  29.52 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.174415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  32.71 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3346  small multidrug resistance protein  33.04 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0550769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1584  multidrug efflux protein  32.17 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.339035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4802  small multidrug resistance protein  28.57 
 
 		 110 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.123188  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4930  small multidrug resistance protein  28.57 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.984602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0402  multidrug resistance protein, Smr family  28.71 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0151896  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0308  small multidrug resistance protein  28.71 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  28.87 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4527  small multidrug resistance protein  31.19 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3071  small multidrug resistance protein  31.07 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.425013  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0374  multidrug resistance protein, Smr family  28.71 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1638  efflux-multidrug resistance protein  29.91 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.381762  hitchhiker  0.000000419533 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0271  small multidrug resistance protein  29.36 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0150  quaternary ammonium compound-resistance protein QacEdelta1  32.17 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.928712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4946  multidrug resistance protein, Smr family  28.71 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0357  SMR family multidrug efflux pump  28.71 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  27.35 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3289  small multidrug resistance protein  25.58 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0313  SMR family multidrug efflux pump  28.71 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0296  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  28.71 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0300  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  28.71 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0328  SMR family multidrug efflux pump  28.71 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  34.62 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2083  small multidrug resistance protein  34.55 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000894022  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00493  multidrug efflux protein  28.97 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  29.63 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>