More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1080 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1080  conserved hypothetical protein, putative multidrug resistance efflux protein  100 
 
 
113 aa  209  1e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.644229  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1307  SMR family multidrug efflux pump  80.91 
 
 
113 aa  157  4e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0556  SMR family multidrug efflux pump  80.91 
 
 
113 aa  157  4e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1188  SMR family multidrug efflux pump  80 
 
 
113 aa  156  9e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2305  small multidrug resistance protein  42.34 
 
 
117 aa  94.7  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.148395  normal  0.149185 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00509  cation transporter  47.71 
 
 
125 aa  92  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001962  spermidine export protein mdtJ  47.62 
 
 
134 aa  88.6  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1360  small multidrug resistance protein  38.89 
 
 
114 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24792  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3466  small multidrug resistance protein  40.78 
 
 
110 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1911  multidrug efflux system protein MdtJ  39.05 
 
 
120 aa  73.9  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2766  small multidrug resistance protein  33.94 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131803  normal  0.0168064 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0063  small multidrug resistance protein  33.9 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2409  multidrug resistance protein MdtJ  34.86 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00258719  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0657  small multidrug resistance protein  35.85 
 
 
113 aa  72  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2131  small multidrug resistance protein  34.86 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2020  multidrug resistance protein MdtJ  34.86 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.993103  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1812  small multidrug resistance protein  33.93 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0871  small multidrug resistance protein  38.68 
 
 
114 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1651  multidrug efflux system protein MdtJ  36.19 
 
 
120 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1691  multidrug efflux system protein MdtJ  36.19 
 
 
120 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.190656  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1592  multidrug efflux system protein MdtJ  36.19 
 
 
120 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.999303 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1858  multidrug efflux system protein MdtJ  36.19 
 
 
120 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.636253  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1583  multidrug efflux system protein MdtJ  36.19 
 
 
120 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.159233 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  35.29 
 
 
106 aa  67  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0718  small multidrug resistance protein  32.04 
 
 
123 aa  67  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3791  putative drug efflux transporter  35.51 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.773212  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44520  putative drug efflux transporter  35.92 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.44142 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  36.17 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2030  multidrug efflux system protein MdtJ  37.04 
 
 
121 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712996  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01569  multidrug efflux system transporter  37.04 
 
 
121 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2043  small multidrug resistance protein  37.04 
 
 
121 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.899542  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1674  multidrug efflux system protein MdtJ  37.04 
 
 
121 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1599  multidrug efflux system protein MdtJ  37.04 
 
 
121 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.62917  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1786  multidrug efflux system protein MdtJ  37.04 
 
 
121 aa  64.3  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2310  multidrug efflux system protein MdtJ  37.04 
 
 
121 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01559  hypothetical protein  37.04 
 
 
121 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1807  multidrug efflux system protein MdtJ  37.04 
 
 
121 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  32.08 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  33.02 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  32.08 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2060  small multidrug resistance protein  32.41 
 
 
135 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  37.76 
 
 
111 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  33.98 
 
 
110 aa  62  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  36 
 
 
108 aa  62.8  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1319  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 
106 aa  62.4  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0145783  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  32.08 
 
 
120 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  37.11 
 
 
113 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  32.08 
 
 
120 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0986  small multidrug resistance protein  32.14 
 
 
291 aa  61.6  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  32.08 
 
 
120 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  34 
 
 
109 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  34 
 
 
109 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3259  small multidrug resistance protein  37.11 
 
 
113 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3077  small multidrug resistance protein  38 
 
 
106 aa  60.8  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2350  putative methyl viologen/ethidium resistance transmembrane protein  37.23 
 
 
114 aa  60.8  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000392235  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3289  small multidrug resistance protein  34.31 
 
 
126 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0798  SMR family multidrug efflux transporter  34.29 
 
 
108 aa  60.5  0.000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.621925  normal  0.0234862 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1884  small multidrug resistance protein  34.65 
 
 
107 aa  60.5  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1088  small multidrug resistance protein  32 
 
 
109 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  36.89 
 
 
109 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  33.66 
 
 
110 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1481  small multidrug resistance protein  33.66 
 
 
112 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545995  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2505  SMR family multidrug efflux pump  33.66 
 
 
112 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1196  small multidrug resistance protein  32.46 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  36.63 
 
 
116 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3008  small multidrug resistance protein  36.08 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1673  small multidrug resistance protein  35.64 
 
 
112 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.107144 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1460  small multidrug resistance protein  33.66 
 
 
112 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2083  small multidrug resistance protein  34.58 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000894022  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1730  SMR family multidrug efflux pump  31.91 
 
 
112 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1245  SMR family multidrug efflux pump  31.91 
 
 
112 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0731  small multidrug efflux pump  33.02 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1984  SMR family multidrug efflux pump  31.91 
 
 
112 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  35 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1815  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  31.91 
 
 
112 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.701999  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4527  small multidrug resistance protein  33.65 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0388  SMR family multidrug efflux pump  31.91 
 
 
112 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1832  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  31.91 
 
 
112 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.935098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0774  SMR family multidrug efflux pump  31.91 
 
 
112 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15362  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1719  small multidrug resistance protein  33 
 
 
116 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241026 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2406  SMR family multidrug efflux pump  30.43 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.374447  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0307  small multidrug resistance protein  37.86 
 
 
107 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1762  small multidrug resistance protein  33.65 
 
 
108 aa  57.4  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0339  small multidrug resistance protein  33.01 
 
 
111 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2887  small multidrug resistance protein  37.97 
 
 
110 aa  57.4  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.014423 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  32.67 
 
 
110 aa  57.4  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  30.19 
 
 
110 aa  57  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2988  small multidrug resistance protein  31.78 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282135  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1535  small multidrug resistance protein  34.65 
 
 
112 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  33 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  33 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3009  small multidrug resistance protein  31.37 
 
 
109 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1079  small multidrug resistance protein  34.65 
 
 
112 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1559  small multidrug resistance protein  34.65 
 
 
112 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219332  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4701  small multidrug resistance protein  32.67 
 
 
112 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3071  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 
107 aa  56.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.425013  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2987  small multidrug resistance protein  30.56 
 
 
115 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112994  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  32 
 
 
109 aa  55.5  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3321  small multidrug resistance protein  36.27 
 
 
111 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00184251  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4585  small multidrug resistance protein  41.77 
 
 
110 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.631388  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>