100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1559 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1559  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  741    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2569  hypothetical protein  84.04 
 
 		 383 aa  617  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2471  major facilitator transporter  84.31 
 
 		 383 aa  619  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2754  hypothetical protein  68.77 
 
 		 382 aa  485  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4526  hypothetical protein  48.12 
 
 		 390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4033  hypothetical protein  47.85 
 
 		 386 aa  269  8e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253788 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1449  hypothetical protein  46.26 
 
 		 393 aa  260  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46180  hypothetical protein  47.62 
 
 		 397 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0113792 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3819  hypothetical protein  47.43 
 
 		 389 aa  255  7e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0125429  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3928  hypothetical protein  46.92 
 
 		 397 aa  247  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1384  hypothetical protein  46.74 
 
 		 390 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0951204  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1041  hypothetical protein  38.08 
 
 		 428 aa  179  5.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0856  hypothetical protein  36.16 
 
 		 412 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0821  protein of unknown function DUF1228  36.8 
 
 		 404 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal  0.29655 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0806  hypothetical protein  36.91 
 
 		 423 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0751  protein of unknown function DUF1228  36.19 
 
 		 404 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1488  hypothetical protein  36.12 
 
 		 417 aa  168  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6839  protein of unknown function DUF1228  34.67 
 
 		 408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0480421  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0805  hypothetical protein  36.89 
 
 		 409 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.703384  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0190  hypothetical protein  35.01 
 
 		 422 aa  150  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0209  protein of unknown function DUF1228  35.77 
 
 		 422 aa  150  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1291  hypothetical protein  32.37 
 
 		 408 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1611  hypothetical protein  32.57 
 
 		 409 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5539  hypothetical protein  33.71 
 
 		 402 aa  146  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.188295  normal  0.0555001 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1330  hypothetical protein  31.94 
 
 		 413 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1389  hypothetical protein  31.41 
 
 		 420 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290756 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4555  hypothetical protein  31.09 
 
 		 417 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2822  protein of unknown function DUF1228  31.42 
 
 		 421 aa  135  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2745  protein of unknown function DUF1228  32.25 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0929  hypothetical protein  30.49 
 
 		 420 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0697566  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1411  hypothetical protein  30.49 
 
 		 439 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1904  hypothetical protein  31.81 
 
 		 437 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.21993 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0279  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 398 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0484  hypothetical protein  32.46 
 
 		 400 aa  129  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0273  hypothetical protein  34.08 
 
 		 427 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3678  protein of unknown function DUF1228  34.38 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0122  protein of unknown function DUF1228  33.92 
 
 		 402 aa  125  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0072  hypothetical protein  33.24 
 
 		 400 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0485  hypothetical protein  33.33 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.626037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1160  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0149798 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1231  major facilitator superfamily tranporter  29.73 
 
 		 428 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2647  major facilitator transporter  32.95 
 
 		 385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.652327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0386  hypothetical protein  28.49 
 
 		 359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1651  hypothetical protein  31.98 
 
 		 388 aa  103  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0231704  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4896  hypothetical protein  25.13 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0235  sugar transporter  27.99 
 
 		 395 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.105559  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0169  major facilitator superfamily MFS_1  31.53 
 
 		 397 aa  100  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3120  protein of unknown function DUF1228  29.73 
 
 		 394 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.508963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0207  hypothetical protein  28.46 
 
 		 395 aa  97.8  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.49283  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2851  protein of unknown function DUF1228  29.04 
 
 		 394 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0859226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4560  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 392 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0733  hypothetical protein  29.97 
 
 		 388 aa  96.7  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.162418  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45070  hypothetical protein  30.36 
 
 		 401 aa  95.5  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4846  transporter, major facilitator family  30.2 
 
 		 394 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4918  major facilitator family transporter  30.2 
 
 		 394 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal  0.222303 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3732  hypothetical protein  28.33 
 
 		 392 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000100771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4509  hypothetical protein  30.05 
 
 		 392 aa  94  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4772  transporter major facilitator family  30.2 
 
 		 394 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0856  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 397 aa  93.6  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4773  transporter, major facilitator family  28.05 
 
 		 392 aa  93.6  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4870  major facilitator family protein  29.31 
 
 		 394 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.444375 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04164  hypothetical protein  28.02 
 
 		 392 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000012722  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3664  protein of unknown function DUF1228  28.02 
 
 		 392 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000330121  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04201  predicted inner membrane protein  28.02 
 
 		 392 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000208654  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4920  major facilitator family transporter  30.48 
 
 		 394 aa  90.1  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.177935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5844  transporter, major facilitator family  28.12 
 
 		 392 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.482212 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4877  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 392 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2649  major facilitator transporter  22.77 
 
 		 389 aa  89  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.189084 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4932  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 392 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3043  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 394 aa  87.8  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.890919 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0358  hypothetical protein  29.36 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.23836  unclonable  0.0000000671481 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2659  major facilitator transporter  36.65 
 
 		 540 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600208  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3310  MFS permease  28.96 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.641652  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4318  hypothetical protein  30.51 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0616031  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1313  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 504 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.776247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1662  major facilitator superfamily permease  36.02 
 
 		 546 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252981  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1639  major facilitator superfamily permease  36.02 
 
 		 537 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1818  hypothetical protein  35.4 
 
 		 525 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.628043  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1047  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0707  hypothetical protein  34.13 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.445459  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0453  hypothetical protein  34.13 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1425  hypothetical protein  34.13 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128087  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1585  major facilitator transporter  23.63 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3309  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4306  major facilitator superfamily transporter  31.88 
 
 		 413 aa  66.2  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0575629 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0445  major facilitator transporter  32.57 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1455  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 411 aa  62.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7234  major facilitator superfamily MFS_1  31.8 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1953  hypothetical protein  29.32 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6538  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0280  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 395 aa  57  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  21.49 
 
 		 398 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6744  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 405 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.713185 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1909  major facilitator family transporter  25.52 
 
 		 406 aa  53.5  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0634  protein of unknown function DUF1228  27.69 
 
 		 374 aa  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2826  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 		 380 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.160845 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33770  hypothetical protein  30.36 
 
 		 408 aa  51.6  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.756882  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0319  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 		 402 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0621236  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0706  major facilitator family transporter  25.19 
 
 		 428 aa  43.5  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233996  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0308  hypothetical protein  31.88 
 
 		 397 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>