40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3766 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3766  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 428 aa  859    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3661  TPR repeat-containing protein  38.91 
 
 		 447 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0562  TPR repeat-containing protein  41.94 
 
 		 396 aa  281  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0468  TPR repeat-containing protein  38.51 
 
 		 441 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3484  TPR repeat-containing protein  38.21 
 
 		 441 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.317992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0507  TPR repeat-containing protein  38.08 
 
 		 451 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4110  MSHA biogenesis protein MshN, putative  41.36 
 
 		 429 aa  273  6e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0486  TPR repeat-containing protein  37.78 
 
 		 445 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0510  TPR repeat-containing protein  36.42 
 
 		 450 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3833  TPR repeat-containing protein  36.63 
 
 		 446 aa  253  6e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117065  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0546  TPR repeat-containing protein  39.36 
 
 		 413 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4415  TPR repeat-containing protein  37.35 
 
 		 397 aa  247  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3749  TPR repeat-containing protein  32.42 
 
 		 425 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.541109  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0391  TPR repeat-containing protein  35.84 
 
 		 386 aa  195  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0456  MSHA biogenesis protein MshN, putative  32.01 
 
 		 399 aa  176  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3345  tetratricopeptide TPR_2  30.09 
 
 		 419 aa  160  6e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.138271  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2822  MSHA biogenesis protein MshN  36.08 
 
 		 389 aa  103  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0471  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHN)  31.15 
 
 		 357 aa  103  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03696  hypothetical protein  32.21 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002370  MSHA biogenesis protein MshN  26.45 
 
 		 364 aa  95.9  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4574  putative MSHA biogenesis protein MshN  22.32 
 
 		 403 aa  79.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00253  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshN (pilus type IV)  29.83 
 
 		 418 aa  72  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1946  hypothetical protein  27.61 
 
 		 491 aa  67.8  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0172  hypothetical protein  28.57 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.356715  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0576  hypothetical protein  40.94 
 
 		 996 aa  63.9  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0895  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 		 354 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.643748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0387  putative MshA biogenesis protein, MshN-like  28.06 
 
 		 481 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00107124  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2286  hypothetical protein  32.74 
 
 		 456 aa  56.6  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0766  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 		 369 aa  54.7  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0146573  normal  0.0797434 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0027  hypothetical protein  39.02 
 
 		 273 aa  47.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.41 
 
 		 2240 aa  47.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3272  hypothetical protein  27.92 
 
 		 461 aa  47.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2460  hypothetical protein  32.5 
 
 		 381 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.152252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2937  TonB family protein  32.06 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2292  hypothetical protein  33.33 
 
 		 336 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.281162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  23.02 
 
 		 319 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04898  hypothetical protein  26.7 
 
 		 677 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.963674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5736  hypothetical protein  37.84 
 
 		 431 aa  43.9  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1428  sporulation domain-containing protein  40 
 
 		 274 aa  43.9  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  22.78 
 
 		 361 aa  43.1  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>