More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3363 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3363  hypothetical protein  100 
 
 		 433 aa  889    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4071  hypothetical protein  70.44 
 
 		 433 aa  655    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3721  hypothetical protein  72.52 
 
 		 433 aa  617  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.232567  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0864  hypothetical protein  65.21 
 
 		 434 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3158  hypothetical protein  65.44 
 
 		 434 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3259  hypothetical protein  65.21 
 
 		 434 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1032  hypothetical protein  64.45 
 
 		 436 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0999  hypothetical protein  64.45 
 
 		 436 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3340  hypothetical protein  64.91 
 
 		 436 aa  558  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0724  hypothetical protein  62.84 
 
 		 436 aa  556  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2990  hypothetical protein  64.68 
 
 		 436 aa  555  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1020  protein of unknown function DUF214  64.91 
 
 		 436 aa  558  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2849  hypothetical protein  62.16 
 
 		 436 aa  529  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0899  hypothetical protein  59.73 
 
 		 437 aa  520  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.811824  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2863  hypothetical protein  57.47 
 
 		 435 aa  509  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2407  hypothetical protein  40.32 
 
 		 438 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2240  hypothetical protein  37.27 
 
 		 435 aa  295  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3502  protein of unknown function DUF214  39.45 
 
 		 432 aa  283  5.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.592439  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0574  putative ABC transporter, permease protein  32.41 
 
 		 432 aa  206  5e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3929  protein of unknown function DUF214  24.88 
 
 		 432 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.06 
 
 		 805 aa  101  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.51 
 
 		 805 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5612  protein of unknown function DUF214  20 
 
 		 414 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4840  protein of unknown function DUF214  24.34 
 
 		 810 aa  94.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0958  protein of unknown function DUF214  24.66 
 
 		 797 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00075656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4844  protein of unknown function DUF214  21.77 
 
 		 793 aa  87.4  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357668  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2349  protein of unknown function DUF214  20.67 
 
 		 415 aa  86.7  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.55 
 
 		 412 aa  86.3  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.34 
 
 		 822 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0281  ABC transporter, permease protein, putative  22.25 
 
 		 458 aa  85.1  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  23.67 
 
 		 805 aa  85.1  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.92 
 
 		 807 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  23.84 
 
 		 808 aa  84.3  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  22.97 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  22.7 
 
 		 802 aa  81.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  22.29 
 
 		 808 aa  81.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3314  protein of unknown function DUF214  23.92 
 
 		 806 aa  81.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.58 
 
 		 808 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  24.6 
 
 		 865 aa  81.6  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4619  protein of unknown function DUF214  25.77 
 
 		 817 aa  81.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  22.59 
 
 		 805 aa  80.9  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  22.97 
 
 		 770 aa  80.1  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  24.44 
 
 		 795 aa  80.1  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4610  protein of unknown function DUF214  25.61 
 
 		 798 aa  80.1  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.22275 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  23.16 
 
 		 409 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4700  ABC transporter, permease protein  24.45 
 
 		 836 aa  79.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  24.2 
 
 		 406 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2084  protein of unknown function DUF214  23.46 
 
 		 801 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.326443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.85 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5675  protein of unknown function DUF214  22.67 
 
 		 789 aa  77.4  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0935  protein of unknown function DUF214  21.74 
 
 		 785 aa  77.8  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4848  protein of unknown function DUF214  22.55 
 
 		 804 aa  77.8  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00205753  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  23.01 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  23.72 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  22.3 
 
 		 805 aa  76.6  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  23.31 
 
 		 802 aa  76.6  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  23.56 
 
 		 805 aa  76.3  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.92 
 
 		 844 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0948  protein of unknown function DUF214  22.08 
 
 		 797 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  24.53 
 
 		 797 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  22 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4598  protein of unknown function DUF214  22.54 
 
 		 784 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.84 
 
 		 813 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.42 
 
 		 882 aa  75.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  22.72 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  22.12 
 
 		 845 aa  75.1  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0603  protein of unknown function DUF214  25.06 
 
 		 809 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.237353 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  22.74 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  23.98 
 
 		 653 aa  74.7  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  24.31 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2744  protein of unknown function DUF214  22.54 
 
 		 799 aa  73.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  24.02 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4857  protein of unknown function DUF214  23.06 
 
 		 793 aa  73.6  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.586648  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  20.74 
 
 		 443 aa  73.6  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  22.27 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  23.39 
 
 		 798 aa  73.2  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  20.62 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1804  protein of unknown function DUF214  26.26 
 
 		 802 aa  73.2  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5545  protein of unknown function DUF214  22.89 
 
 		 788 aa  73.2  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.366096  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  20.73 
 
 		 401 aa  72.8  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3505  ABC transporter, permease protein  22.7 
 
 		 804 aa  72.4  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.084112  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  22.32 
 
 		 409 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  23.4 
 
 		 400 aa  72.8  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  23.15 
 
 		 809 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  23.17 
 
 		 384 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  25.07 
 
 		 803 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4859  protein of unknown function DUF214  21.95 
 
 		 792 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0508357 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  23.59 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3764  protein of unknown function DUF214  22.12 
 
 		 714 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0658  protein of unknown function DUF214  21.9 
 
 		 793 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442095  normal  0.737711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4368  protein of unknown function DUF214  22.05 
 
 		 800 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.129517 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  24.09 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  20.9 
 
 		 656 aa  71.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3433  protein of unknown function DUF214  22.29 
 
 		 809 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4616  protein of unknown function DUF214  23.29 
 
 		 807 aa  71.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.413807 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  20.95 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4618  protein of unknown function DUF214  21.44 
 
 		 808 aa  70.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.154299 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  23.18 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  22.3 
 
 		 663 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  23.18 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>