149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2000 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2000  cupin 4 family protein  100 
 
 		 381 aa  783    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2408  cupin 4 family protein  73.09 
 
 		 380 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0501658  hitchhiker  0.000275258 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2199  cupin 4 family protein  74.93 
 
 		 381 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00219592  hitchhiker  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2354  cupin 4 family protein  72.11 
 
 		 385 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2343  cupin 4 family protein  72.11 
 
 		 385 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2459  cupin 4 family protein  72.11 
 
 		 385 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2004  Cupin 4 family protein  71.84 
 
 		 385 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.367195  hitchhiker  0.0000511749 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1908  cupin 4 family protein  70 
 
 		 386 aa  570  1e-161  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2133  hypothetical protein  51.32 
 
 		 383 aa  424  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.764598  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1285  Cupin 4 family protein  44.88 
 
 		 373 aa  346  4e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2988  cupin family protein  43.16 
 
 		 373 aa  343  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3067  cupin 4 family protein  43.16 
 
 		 373 aa  343  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0473  Cupin 4 family protein  43.42 
 
 		 373 aa  340  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0392  Cupin 4 family protein  42.89 
 
 		 373 aa  338  9e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0502  cupin 4 family protein  43.31 
 
 		 373 aa  337  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1408  Cupin 4 family protein  42.63 
 
 		 374 aa  335  7e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0491  cupin 4 family protein  42.11 
 
 		 373 aa  330  3e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1641  cupin 4 family protein  42.82 
 
 		 373 aa  330  4e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1937  Cupin 4 family protein  43.4 
 
 		 373 aa  328  7e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1346  cupin family protein  42.66 
 
 		 373 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.986526 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2137  cupin family protein  42.39 
 
 		 373 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0624468 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1308  cupin family protein  42.39 
 
 		 373 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.579202  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0960  cupin 4 family protein  44.71 
 
 		 375 aa  326  4.0000000000000003e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1330  cupin family protein  42.39 
 
 		 373 aa  326  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.233449  normal  0.341936 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1955  cupin family protein  42.39 
 
 		 373 aa  326  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.280047  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1864  Cupin 4 family protein  42.32 
 
 		 373 aa  324  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2011  cupin 4 family protein  40.92 
 
 		 373 aa  324  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0220075 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2519  Cupin 4 family protein  42.12 
 
 		 373 aa  322  5e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0666495  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1569  cupin family protein  42.12 
 
 		 373 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486119  hitchhiker  0.00000357486 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01126  hypothetical protein  42.12 
 
 		 373 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01134  hypothetical protein  42.12 
 
 		 373 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1306  cupin family protein  42.12 
 
 		 373 aa  322  9.999999999999999e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1248  cupin family protein  42.12 
 
 		 373 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1291  cupin family protein  42.12 
 
 		 373 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2475  cupin 4 family protein  42.12 
 
 		 373 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1997  cupin family protein  42.12 
 
 		 373 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.446284 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2149  Cupin 4 family protein  41.78 
 
 		 373 aa  320  3e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2068  Cupin 4 family protein  42.05 
 
 		 373 aa  318  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1606  cupin family protein  41.73 
 
 		 373 aa  315  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1713  cupin 4 family protein  42.01 
 
 		 373 aa  314  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2857  hypothetical protein  41.73 
 
 		 373 aa  313  1.9999999999999998e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1952  hypothetical protein  42.2 
 
 		 390 aa  312  5.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2263  cupin 4 family protein  41.6 
 
 		 380 aa  300  3e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2541  cupin 4 family protein  41.08 
 
 		 376 aa  297  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2236  cupin 4 family protein  40.32 
 
 		 379 aa  288  7e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.817609  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2474  cupin 4 family protein  40.32 
 
 		 379 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030086  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1870  Cupin 4 family protein  39.78 
 
 		 379 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000786372  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1825  cupin 4  40.58 
 
 		 376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2481  cupin 4 family protein  39.78 
 
 		 379 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2594  cupin 4 family protein  39.78 
 
 		 379 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46128  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1744  cupin 4 family protein  40.32 
 
 		 379 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2636  hypothetical protein  40.05 
 
 		 380 aa  281  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1600  cupin 4 family protein  40.05 
 
 		 379 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1675  cupin 4 family protein  39.78 
 
 		 379 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2708  cupin 4 family protein  38.98 
 
 		 374 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.112259 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1557  cupin 4 family protein  43.65 
 
 		 386 aa  262  6e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02373  putative enzyme with RmlC-like domain  37.04 
 
 		 388 aa  253  5.000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.965281  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2065  cupin 4  37.3 
 
 		 372 aa  252  6e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.439804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1765  cupin 4 family protein  37.53 
 
 		 383 aa  246  4.9999999999999997e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0255627  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0838  cupin 4  38.7 
 
 		 392 aa  241  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000238733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0982  cupin 4  38.7 
 
 		 392 aa  241  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000496862  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2447  cupin 4  43.42 
 
 		 397 aa  239  5e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30100  hypothetical protein  38.42 
 
 		 389 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3269  cupin 4 family protein  38.55 
 
 		 400 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540912 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1143  cupin region  37.24 
 
 		 415 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000830013  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2383  cupin 4  35.06 
 
 		 389 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2577  hypothetical protein  37.5 
 
 		 389 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0294442  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2403  cupin 4 family protein  35.49 
 
 		 388 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.969826  normal  0.0823577 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28390  clavaminate synthase-like superfamily protein  35.89 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3421  cupin 4 family protein  33.86 
 
 		 388 aa  222  8e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3599  transcription factor jumonji, jmjC  35.16 
 
 		 391 aa  220  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.404465  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3361  hypothetical protein  35.16 
 
 		 388 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.036154  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3193  transcription factor jumonji, jmjC  34.9 
 
 		 388 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.021443 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3622  cupin 4 family protein  33.6 
 
 		 388 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4017  cupin 4 family protein  33.6 
 
 		 390 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593926  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1816  cupin 4 family protein  33.6 
 
 		 388 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal  0.222085 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0585  hypothetical protein  35.9 
 
 		 377 aa  215  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.269935  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0038  Cupin 4 family protein  34.66 
 
 		 392 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1274  Cupin 4 family protein  38.19 
 
 		 385 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1850  Cupin 4 family protein  36.59 
 
 		 397 aa  209  7e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.469672  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1404  Cupin 4 family protein  34.08 
 
 		 397 aa  200  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1874  hypothetical protein  34.69 
 
 		 395 aa  199  6e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1332  cupin 4 family protein  35.6 
 
 		 378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2628  Cupin 4 family protein  32.64 
 
 		 471 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.229429  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1132  transcription factor jumonji, jmjC  33.25 
 
 		 401 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1865  hypothetical protein  34.42 
 
 		 395 aa  195  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5397  cupin domain-containing protein  36.36 
 
 		 406 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705727  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5986  cupin 4  35.77 
 
 		 406 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.143009  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2091  cupin 4 family protein  35.77 
 
 		 406 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0444344  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1674  hypothetical protein  35.61 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0958  cupin 4 family protein  32.9 
 
 		 391 aa  189  7e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0589089  hitchhiker  0.00146846 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1148  hypothetical protein  33.85 
 
 		 409 aa  189  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2644  cupin 4  32.29 
 
 		 384 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2694  cupin superfamily protein family  34.53 
 
 		 422 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183857  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2562  cupin domain-containing protein  34.53 
 
 		 395 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245241  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1910  hypothetical protein  32.75 
 
 		 422 aa  187  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507646  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2177  hypothetical protein  34.53 
 
 		 395 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0429596  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3141  hypothetical protein  34.53 
 
 		 407 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1450  hypothetical protein  34.53 
 
 		 395 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.90536  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1247  hypothetical protein  31.65 
 
 		 390 aa  186  5e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000169648  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>