227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4975 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4975  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 122 aa  233  5.0000000000000005e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0590431 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4976  small multidrug resistance protein  60.75 
 
 		 109 aa  116  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0616597 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2866  small multidrug resistance protein  55.86 
 
 		 114 aa  110  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2910  small multidrug resistance protein  55.86 
 
 		 114 aa  110  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2896  small multidrug resistance protein  55.86 
 
 		 114 aa  110  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2988  small multidrug resistance protein  53.4 
 
 		 108 aa  97.8  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282135  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3346  small multidrug resistance protein  49.54 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0550769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2987  small multidrug resistance protein  48.21 
 
 		 115 aa  92.8  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112994  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3554  small multidrug resistance protein  50.93 
 
 		 107 aa  90.1  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3345  small multidrug resistance protein  49.06 
 
 		 106 aa  87  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0912633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12490  cation/cationic drug transporter  50.94 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0627  small multidrug resistance protein  40.74 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38630  cation/cationic drug transporter  39.81 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31080  cation/cationic drug transporter  49.56 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.234075  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2867  small multidrug resistance protein  50.57 
 
 		 107 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2911  small multidrug resistance protein  50.57 
 
 		 107 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2897  small multidrug resistance protein  50.57 
 
 		 107 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216047  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4527  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3074  small multidrug resistance protein  42.16 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219411  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0987  small multidrug resistance efflux protein  44.44 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25874  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  41.12 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  41.12 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2410  small multidrug resistance protein  41 
 
 		 111 aa  73.6  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  39.64 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1762  small multidrug resistance protein  41.67 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31070  cation/cationic drug transporter  48.51 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.438868  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2257  small multidrug resistance protein  39.25 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.709004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3553  small multidrug resistance protein  49.07 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1617  small multidrug resistance protein  39.25 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  38.89 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  40.19 
 
 		 116 aa  67  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  41.44 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  41.44 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2364  small multidrug resistance protein  38.74 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  40.54 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  35.78 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0536  small multidrug resistance protein  35.78 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568122  normal  0.0651219 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4979  multidrug resistance protein  31.19 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0488  small multidrug resistance protein  36.7 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0280081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2543  small multidrug resistance protein  36.36 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544067  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  40.57 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0541  small multidrug resistance protein  31.19 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.730216  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4478  quaternary ammonium compound-resistance protein  46.53 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.513  normal  0.735408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4930  small multidrug resistance protein  34.86 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.984602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  35.78 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  35.78 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4802  small multidrug resistance protein  34.86 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.123188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4979  small multidrug resistance protein  33.94 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.174415  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4263  small multidrug resistance protein  42.71 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5725  SMR multidrug efflux transporter  42.99 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  39.25 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4238  small multidrug resistance protein  39.39 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.644322  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0437  small multidrug resistance protein  36.27 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.453624  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1826  small multidrug resistance protein  36.19 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal  0.470725 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4701  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0986  small multidrug resistance protein  34.91 
 
 		 291 aa  60.5  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0828  small multidrug resistance protein  40.19 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.251219  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0450  small multidrug resistance protein  34.58 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6952  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1673  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107144 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65990  SMR multidrug efflux transporter  41.12 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00317706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0339  small multidrug resistance protein  33.02 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  37.84 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1884  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  35.78 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1481  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1460  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3071  small multidrug resistance protein  37.74 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.425013  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  37.96 
 
 		 108 aa  57  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1535  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1079  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1559  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219332  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2897  small multidrug resistance protein  36.36 
 
 		 104 aa  57  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.904986 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2603  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 110 aa  57  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2505  SMR family multidrug efflux pump  35.64 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4701  small multidrug resistance protein  38.61 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  32.43 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  35.19 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1804  multidrug resistance protein, SMR family protein  32.71 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2208  quaternary ammonium compound-resistance protein  32.71 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.831863  normal  0.342211 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1914  small multidrug resistance protein  32.71 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1973  small multidrug resistance protein  37.61 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1088  small multidrug resistance protein  37.14 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1670  small multidrug resistance protein  34.26 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.774613  hitchhiker  0.00381818 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1584  multidrug efflux protein  37.82 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.339035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0150  quaternary ammonium compound-resistance protein QacEdelta1  37.82 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.928712  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1245  SMR family multidrug efflux pump  33.66 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1984  SMR family multidrug efflux pump  33.66 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3321  small multidrug resistance protein  34.62 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00184251  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1730  SMR family multidrug efflux pump  33.66 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0388  SMR family multidrug efflux pump  33.66 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2205  small multidrug resistance protein  37.84 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1815  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  33.66 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.701999  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1832  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  33.66 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.935098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0774  SMR family multidrug efflux pump  33.66 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15362  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0613  small multidrug resistance protein  38.89 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.375677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1735  small multidrug resistance protein  35.51 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2072  small multidrug resistance protein  31.48 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  31.53 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1319  small multidrug resistance protein  42.16 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0145783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>