53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4557 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4557  von Willebrand factor type A  100 
 
 
425 aa  862    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54416  normal  0.659076 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0183  von Willebrand factor type A  45.81 
 
 
432 aa  343  4e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2163  von Willebrand factor type A  44.01 
 
 
440 aa  323  4e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.820546  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4403  von Willebrand factor type A  44.52 
 
 
450 aa  320  3e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4946  von Willebrand factor type A  44.88 
 
 
431 aa  301  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0264631  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0368  von Willebrand factor type A  41.03 
 
 
428 aa  295  9e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00177271  decreased coverage  0.000715031 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3066  von Willebrand factor type A  42.15 
 
 
425 aa  294  2e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000574906 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2461  von Willebrand factor type A  36.1 
 
 
432 aa  240  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0207463  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0400  von Willebrand factor type A  36.38 
 
 
476 aa  238  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2532  von Willebrand factor type A  36.88 
 
 
464 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.177592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1137  serine/threonine protein kinase  34.89 
 
 
962 aa  195  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4249  hypothetical protein  43.45 
 
 
145 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.832481  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  26.45 
 
 
420 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  25.57 
 
 
412 aa  81.3  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  26.67 
 
 
419 aa  79.7  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  26.9 
 
 
419 aa  74.3  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  26.16 
 
 
418 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  23.94 
 
 
412 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  23.64 
 
 
418 aa  59.7  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  24.56 
 
 
423 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1492  von Willebrand factor, type A  28.3 
 
 
383 aa  58.9  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  24.88 
 
 
421 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  26.09 
 
 
425 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  24.67 
 
 
426 aa  53.5  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  24.72 
 
 
427 aa  53.9  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2868  von Willebrand factor type A  25.61 
 
 
467 aa  53.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566184 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  26.19 
 
 
425 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  29.5 
 
 
903 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2065  von Willebrand factor type A  25.57 
 
 
380 aa  51.2  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  23.61 
 
 
418 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  23.61 
 
 
418 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  24.7 
 
 
418 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.11 
 
 
755 aa  50.4  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  29.59 
 
 
393 aa  50.4  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0004  von Willebrand factor, type A  30.06 
 
 
464 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.74 
 
 
755 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.04 
 
 
722 aa  47.8  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  23.32 
 
 
757 aa  47.4  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1710  von Willebrand factor type A  37.21 
 
 
840 aa  47.4  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  30.67 
 
 
412 aa  47  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  25.43 
 
 
412 aa  47  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.74 
 
 
751 aa  46.6  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  30 
 
 
753 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  24.9 
 
 
415 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  31.69 
 
 
791 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2129  von Willebrand factor type A  48.98 
 
 
833 aa  44.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  25.78 
 
 
412 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  30.07 
 
 
459 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.1 
 
 
759 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.56 
 
 
442 aa  43.5  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  24.08 
 
 
819 aa  43.5  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  29.58 
 
 
794 aa  43.5  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  28.37 
 
 
418 aa  43.1  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.802956 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>