More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0193 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0193  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
1054 aa  2078    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  0.268919 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  33.19 
 
 
1574 aa  434  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  34.91 
 
 
2604 aa  422  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12949  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsE  33.4 
 
 
1488 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.892857  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  34.98 
 
 
3093 aa  413  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3962  Beta-ketoacyl synthase  33.23 
 
 
1582 aa  407  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3732  beta-ketoacyl synthase  36.35 
 
 
1535 aa  409  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0148321  normal  0.340666 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7309  polyketide synthase  33.97 
 
 
1486 aa  406  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4055  Beta-ketoacyl synthase  32.75 
 
 
974 aa  402  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.285495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  32.94 
 
 
1470 aa  399  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  34.84 
 
 
4646 aa  399  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7000  Beta-ketoacyl synthase  33.16 
 
 
4647 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1161  polyketide synthase  29.24 
 
 
1612 aa  382  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0834  polyketide synthase  29.24 
 
 
1612 aa  382  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399353  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  30.07 
 
 
1354 aa  372  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  29.24 
 
 
2551 aa  370  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  38.43 
 
 
1408 aa  355  2.9999999999999997e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2400  beta-ketoacyl synthase  41.37 
 
 
2150 aa  350  7e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.586894  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  30.57 
 
 
1587 aa  343  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  29.65 
 
 
1337 aa  342  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  36.83 
 
 
1909 aa  342  2e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  42.32 
 
 
2498 aa  338  1.9999999999999998e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2416  Beta-ketoacyl synthase  39.88 
 
 
1302 aa  338  2.9999999999999997e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7299  polyketide synthetase  39.55 
 
 
1466 aa  338  2.9999999999999997e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.18 
 
 
2551 aa  337  5e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3745  KR domain protein  41.13 
 
 
1520 aa  337  5e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2600  yersiniabactin polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  43.5 
 
 
3173 aa  337  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  28.38 
 
 
2762 aa  337  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1966  erythronolide synthase  42.17 
 
 
1911 aa  336  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0640418 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  38.17 
 
 
1424 aa  335  3e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0138  TubD protein  44.63 
 
 
1353 aa  334  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  39.84 
 
 
1653 aa  335  4e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1647  polyketide synthase, type I  44.63 
 
 
1329 aa  334  5e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.052108  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0836  beta-ketoacyl synthase  40.86 
 
 
2093 aa  334  5e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  28.13 
 
 
1087 aa  334  5e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1566  polyketide synthase, type I  44.63 
 
 
1329 aa  334  6e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  41.13 
 
 
3089 aa  333  7.000000000000001e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  27.4 
 
 
1559 aa  332  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3963  Beta-ketoacyl synthase  40.55 
 
 
3090 aa  332  3e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1235  JamP  43.93 
 
 
1370 aa  329  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4755  Beta-ketoacyl synthase  40 
 
 
1560 aa  328  4.0000000000000003e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173311  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  31.32 
 
 
3702 aa  326  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  27.4 
 
 
1559 aa  327  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  38.04 
 
 
1646 aa  325  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1978  beta-ketoacyl synthase  41.99 
 
 
926 aa  325  3e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.690285  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6994  Beta-ketoacyl synthase  41.03 
 
 
1276 aa  324  4e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1810  polyketide synthase protein  42.63 
 
 
2380 aa  324  5e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362155  normal  0.526323 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1021  thiotemplate mechanism natural product synthetase  42.01 
 
 
3133 aa  324  5e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  31.21 
 
 
3693 aa  324  5e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  31.21 
 
 
3693 aa  324  5e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0298  thiotemplate mechanism natural product synthetase  42.01 
 
 
3127 aa  324  7e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1709  non-ribosomal peptide synthase  42.01 
 
 
4265 aa  323  8e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1795  syringomycin synthetase  41.75 
 
 
4265 aa  323  8e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  42.01 
 
 
4239 aa  323  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  30.49 
 
 
2230 aa  323  9.000000000000001e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  40.61 
 
 
2684 aa  321  5e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  32.48 
 
 
7210 aa  320  1e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  31.12 
 
 
2225 aa  318  3e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  39.96 
 
 
1795 aa  318  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2097  yersiniabactin synthetase, HMWP1 component  42.17 
 
 
3163 aa  317  9e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3096  Beta-ketoacyl synthase  36.65 
 
 
995 aa  316  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  28.56 
 
 
2462 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2330  Beta-ketoacyl synthase  34.99 
 
 
1000 aa  316  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1860  Beta-ketoacyl synthase  37.35 
 
 
1416 aa  314  4.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.699288  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3025  Beta-ketoacyl synthase  36.25 
 
 
995 aa  314  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  38.99 
 
 
3335 aa  314  5.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  36.47 
 
 
3235 aa  313  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2363  polyketide synthase  44.68 
 
 
1525 aa  312  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  33.12 
 
 
4080 aa  312  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  35.34 
 
 
4186 aa  311  4e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  40.92 
 
 
3194 aa  309  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3682  KR domain protein  41.39 
 
 
1497 aa  306  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.631324  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  32.9 
 
 
3158 aa  305  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0573  KR domain protein  37.96 
 
 
1833 aa  304  6.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.94 
 
 
1874 aa  303  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1334  amino acid adenylation domain protein  39.64 
 
 
2896 aa  303  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4911  Beta-ketoacyl synthase  39.71 
 
 
1466 aa  302  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000703058  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1395  putative polyketide synthase PksJ  39.81 
 
 
5021 aa  302  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1480  putative polyketide synthase PksJ  39.81 
 
 
5023 aa  302  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0001  polyketide synthase  39.81 
 
 
4874 aa  302  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0167  putative polyketide synthase PksJ  39.81 
 
 
3818 aa  301  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  35.26 
 
 
2710 aa  301  4e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  38.6 
 
 
3275 aa  301  6e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  31.36 
 
 
5154 aa  300  1e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3035  beta-ketoacyl synthase  41.49 
 
 
2257 aa  300  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.744051  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0494  Acyl transferase  30.64 
 
 
2666 aa  300  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  39.41 
 
 
3130 aa  299  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2072  Beta-ketoacyl synthase  40.19 
 
 
2243 aa  298  3e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  39.22 
 
 
3424 aa  298  4e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1024  beta-ketoacyl synthase  30.03 
 
 
2053 aa  297  7e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  32.07 
 
 
3408 aa  297  7e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  30.88 
 
 
2108 aa  297  8e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2654  beta-ketoacyl synthase  40.7 
 
 
2226 aa  296  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.261151  normal  0.360138 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  26.22 
 
 
3099 aa  295  3e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  31.05 
 
 
3508 aa  292  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3070  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.58 
 
 
1208 aa  291  5.0000000000000004e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  33.46 
 
 
2316 aa  291  5.0000000000000004e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  36.85 
 
 
2679 aa  290  7e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  31.5 
 
 
1789 aa  290  8e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.3 
 
 
1126 aa  290  8e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>