More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1106 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1106  ABC transporter related protein  100 
 
 
573 aa  1132    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.79 
 
 
586 aa  323  6e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  33.85 
 
 
586 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  33.11 
 
 
584 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  33.62 
 
 
586 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.62 
 
 
586 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.68 
 
 
586 aa  319  7e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0809  ABC transporter ATP-binding/permease  33.62 
 
 
586 aa  319  9e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00766142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0852  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.62 
 
 
586 aa  319  9e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.45 
 
 
586 aa  317  3e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  33.56 
 
 
586 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4432  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.06 
 
 
548 aa  306  7e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000325117  normal  0.0473884 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  30.86 
 
 
589 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.6 
 
 
583 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.42 
 
 
583 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  30.41 
 
 
583 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  30.41 
 
 
583 aa  281  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  30.41 
 
 
583 aa  281  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.41 
 
 
583 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  31.47 
 
 
583 aa  281  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.41 
 
 
583 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2849  ABC transporter related  32.15 
 
 
595 aa  280  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104844  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  30.89 
 
 
583 aa  278  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1657  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.29 
 
 
555 aa  276  5e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3715  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.25 
 
 
583 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000980876  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  32.42 
 
 
585 aa  275  2.0000000000000002e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0460  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.02 
 
 
581 aa  273  7e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3720  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.08 
 
 
583 aa  273  7e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2810  ABC transporter related protein  33.96 
 
 
584 aa  272  1e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000027505  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0922  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.01 
 
 
597 aa  269  1e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000416921  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  30.35 
 
 
579 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  32.37 
 
 
593 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0484  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  26.57 
 
 
590 aa  264  3e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  31.49 
 
 
582 aa  264  4e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.09 
 
 
593 aa  263  4.999999999999999e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00400  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  26.57 
 
 
590 aa  263  6e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00404  hypothetical protein  26.57 
 
 
590 aa  263  6e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0833  ABC transporter related  29.13 
 
 
612 aa  263  6.999999999999999e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0369945  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0525  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  26.4 
 
 
590 aa  262  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0536  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  26.4 
 
 
590 aa  262  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.772204 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3167  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  26.4 
 
 
590 aa  262  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.564857  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0491  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  26.66 
 
 
590 aa  262  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.961143  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1058  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  26.87 
 
 
588 aa  261  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.61208  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3161  ABC transporter related protein  26.96 
 
 
590 aa  260  4e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3253  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  26.86 
 
 
589 aa  259  6e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.052561  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1515  ABC transporter related  29.53 
 
 
577 aa  254  3e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  32.4 
 
 
600 aa  254  3e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0916  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  26.12 
 
 
590 aa  253  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  31.1 
 
 
598 aa  249  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  30.15 
 
 
593 aa  248  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0503  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  26.34 
 
 
590 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0500  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  26.39 
 
 
590 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.863518  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003564  ATP-binding component of a transport system  27.65 
 
 
579 aa  248  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0563  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  26.31 
 
 
590 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0509  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  26.22 
 
 
590 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.726436 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0519  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  26.22 
 
 
590 aa  247  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1564  ABC transporter related  29.35 
 
 
577 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02524  hypothetical protein  27.46 
 
 
579 aa  246  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0442  ABC transporter related  29.52 
 
 
618 aa  244  3.9999999999999997e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000293437  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1304  ABC transporter related  34.17 
 
 
602 aa  244  5e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1107  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  26.81 
 
 
591 aa  243  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349072  hitchhiker  0.00000399844 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  33.26 
 
 
606 aa  243  7e-63  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2867  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  26.89 
 
 
607 aa  241  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  32.94 
 
 
588 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  31.94 
 
 
581 aa  240  5.999999999999999e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  31.18 
 
 
556 aa  238  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3222  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  26.47 
 
 
588 aa  236  7e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3059  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  25.91 
 
 
588 aa  236  9e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3812  ABC transporter related protein  29.76 
 
 
650 aa  236  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.882245  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  32.38 
 
 
598 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3080  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  26.47 
 
 
588 aa  235  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3041  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  26.47 
 
 
588 aa  234  4.0000000000000004e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  28.74 
 
 
596 aa  233  7.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  31.26 
 
 
589 aa  233  9e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  30.43 
 
 
594 aa  232  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2255  ABC transporter related  28 
 
 
580 aa  232  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.870645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  30.66 
 
 
581 aa  232  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  31.1 
 
 
591 aa  231  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  28.57 
 
 
611 aa  231  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  29.25 
 
 
541 aa  230  5e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  33.2 
 
 
592 aa  229  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0149  ABC transporter related  28.72 
 
 
584 aa  228  2e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29338  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  32.51 
 
 
580 aa  228  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0371  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  25.51 
 
 
553 aa  228  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1501  ABC transporter, transmembrane region  32.28 
 
 
578 aa  226  6e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.014393  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  29.62 
 
 
588 aa  226  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  30.1 
 
 
578 aa  224  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  30.1 
 
 
578 aa  224  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0134  ABC transporter related  30.89 
 
 
574 aa  224  4e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  27.29 
 
 
600 aa  223  7e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  27.51 
 
 
768 aa  223  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  29.89 
 
 
572 aa  223  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  26.61 
 
 
596 aa  223  9e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  28.13 
 
 
567 aa  223  9e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  29.89 
 
 
572 aa  222  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.92 
 
 
573 aa  223  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0124  ABC transporter related  29.57 
 
 
573 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.89 
 
 
572 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  28.13 
 
 
567 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  32.39 
 
 
577 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>