226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5187 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5187  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  730    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.503723 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4043  protein of unknown function UPF0118  46.3 
 
 		 385 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0862  hypothetical protein  41.47 
 
 		 360 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3036  protein of unknown function UPF0118  41.49 
 
 		 363 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3084  protein of unknown function UPF0118  41.49 
 
 		 363 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0593  hypothetical protein  34.82 
 
 		 376 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.356961  normal  0.748294 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2741  hypothetical protein  33.81 
 
 		 369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2819  hypothetical protein  33.83 
 
 		 369 aa  199  7e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2910  hypothetical protein  33.52 
 
 		 369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0691  hypothetical protein  33.43 
 
 		 377 aa  192  6e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.627447 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1843  hypothetical protein  32.13 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06643  hypothetical protein  33.72 
 
 		 365 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4608  hypothetical protein  33.81 
 
 		 370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0120  hypothetical protein  33.92 
 
 		 370 aa  182  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2900  hypothetical protein  33.24 
 
 		 379 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001141  hypothetical protein  32.77 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2169  hypothetical protein  34.32 
 
 		 354 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6456  hypothetical protein  33.43 
 
 		 367 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.267604 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44170  hypothetical protein  35.8 
 
 		 368 aa  179  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  34.04 
 
 		 348 aa  179  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3486  hypothetical protein  34.83 
 
 		 375 aa  176  9e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0748  hypothetical protein  34.23 
 
 		 365 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0752  hypothetical protein  35.14 
 
 		 365 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0379564  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2221  lipoprotein, putative  33.73 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0102435  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  33.23 
 
 		 346 aa  170  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0714  permease  34.23 
 
 		 365 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0333328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4469  hypothetical protein  35.44 
 
 		 365 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0580151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1020  membrane protein  32.63 
 
 		 355 aa  167  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  30.9 
 
 		 367 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  33.86 
 
 		 350 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2676  hypothetical protein  32.42 
 
 		 388 aa  162  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1709  hypothetical protein  33.05 
 
 		 388 aa  162  9e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.615575  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4162  hypothetical protein  34.48 
 
 		 350 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1705  hypothetical protein  34.48 
 
 		 349 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3487  hypothetical protein  34.16 
 
 		 354 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1906  membrane protein  31.29 
 
 		 353 aa  159  8e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0890459  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1658  putative inner membrane protein  31.89 
 
 		 364 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2633  hypothetical protein  30.79 
 
 		 365 aa  153  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2756  putative inner membrane protein  32.52 
 
 		 369 aa  152  8.999999999999999e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2454  putative inner membrane protein  30.2 
 
 		 395 aa  149  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.272244  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1844  putative inner membrane protein  32 
 
 		 367 aa  149  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1738  putative inner membrane protein  32 
 
 		 367 aa  149  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3398  hypothetical protein  29.19 
 
 		 360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1690  putative inner membrane protein  32.54 
 
 		 370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4349  hypothetical protein  32.43 
 
 		 368 aa  146  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.287718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2597  putative inner membrane protein  32 
 
 		 365 aa  146  7.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0405  hypothetical protein  29.82 
 
 		 374 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1746  putative inner membrane protein  29.75 
 
 		 371 aa  143  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422506 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2175  hypothetical protein  29.97 
 
 		 366 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0131226 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01657  predicted inner membrane protein  29.97 
 
 		 370 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1954  protein of unknown function UPF0118  29.97 
 
 		 370 aa  139  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133227  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1904  putative inner membrane protein  29.97 
 
 		 370 aa  139  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1889  putative inner membrane protein  29.97 
 
 		 370 aa  139  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2403  putative inner membrane protein  29.97 
 
 		 370 aa  139  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0340493 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1769  putative inner membrane protein  29.97 
 
 		 370 aa  139  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1943  putative inner membrane protein  29.97 
 
 		 370 aa  139  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987664 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1508  putative inner membrane protein  29.97 
 
 		 370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188442 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2457  hypothetical protein  31.02 
 
 		 362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10160  hypothetical protein  31.55 
 
 		 364 aa  133  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.406243  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1381  protein of unknown function UPF0118  29.43 
 
 		 371 aa  133  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.0000000171014  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43510  hypothetical protein  32.92 
 
 		 355 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3648  hypothetical protein  31.6 
 
 		 354 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.505772  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1973  hypothetical protein  29.91 
 
 		 382 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000012652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3174  hypothetical protein  29.53 
 
 		 371 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169461  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1808  putative inner membrane protein  30.89 
 
 		 372 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1979  putative inner membrane protein  30.89 
 
 		 372 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  hitchhiker  0.00000561887 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1495  putative inner membrane protein  30.89 
 
 		 372 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1460  putative inner membrane protein  30.89 
 
 		 372 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539422  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1476  putative inner membrane protein  30.89 
 
 		 372 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.655079  hitchhiker  0.000276 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1686  hypothetical protein  30.89 
 
 		 390 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5665  hypothetical protein  32.51 
 
 		 362 aa  116  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1229  permease  27.7 
 
 		 366 aa  115  8.999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.632798 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4061  hypothetical protein  28.77 
 
 		 351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  27.83 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  26.18 
 
 		 362 aa  101  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  29.29 
 
 		 351 aa  99.4  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  29.29 
 
 		 351 aa  99.4  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0192  protein of unknown function UPF0118  26.81 
 
 		 358 aa  96.7  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.146754  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  24.92 
 
 		 373 aa  96.3  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0297  hypothetical protein  27.89 
 
 		 379 aa  92  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  28.12 
 
 		 352 aa  86.3  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  25.94 
 
 		 373 aa  82.8  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0271  hypothetical protein  27.27 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2209  hypothetical protein  27.02 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2098  hypothetical protein  28.41 
 
 		 368 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3280  hypothetical protein  24.52 
 
 		 361 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3243  hypothetical protein  25.48 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.654322 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  25.79 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1067  hypothetical protein  26.58 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0013  hypothetical protein  26.54 
 
 		 363 aa  76.3  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00247664 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  24.01 
 
 		 369 aa  76.3  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0767  hypothetical protein  25.79 
 
 		 350 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  23.87 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1401  hypothetical protein  26.03 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1735  hypothetical protein  25.2 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4274  hypothetical protein  24.93 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.444788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0518  hypothetical protein  26.03 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0130  hypothetical protein  26.03 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0984  hypothetical protein  26.58 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1484  hypothetical protein  26.03 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>