More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4863 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3503  FAD dependent oxidoreductase  75.32 
 
 		 466 aa  746    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1829  putative FAD-dependent oxidoreductase  71.43 
 
 		 464 aa  687    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.226522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4863  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 466 aa  962    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3750  FAD dependent oxidoreductase  61.51 
 
 		 479 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0139  FAD dependent oxidoreductase  63.32 
 
 		 464 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6224  FAD dependent oxidoreductase  63.11 
 
 		 473 aa  601  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1643  FAD dependent oxidoreductase  66.52 
 
 		 463 aa  601  1e-170  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0685  putative taurine dehydrogenase, large subunit  62.89 
 
 		 472 aa  598  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0118  FAD dependent oxidoreductase  63.86 
 
 		 464 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2019  FAD dependent oxidoreductase  62.07 
 
 		 473 aa  597  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4363  FAD dependent oxidoreductase  60.17 
 
 		 471 aa  593  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4012  FAD dependent oxidoreductase  66.3 
 
 		 462 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2003  FAD dependent oxidoreductase  62 
 
 		 471 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4526  FAD dependent oxidoreductase  62.22 
 
 		 469 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.719592  normal  0.292372 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4759  FAD dependent oxidoreductase  61.27 
 
 		 462 aa  549  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3850  FAD dependent oxidoreductase  55.08 
 
 		 482 aa  536  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.885926  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4289  FAD dependent oxidoreductase  56.37 
 
 		 499 aa  536  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0106855  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1461  putative oxidoreductase  41.36 
 
 		 454 aa  360  2e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2235  FAD dependent oxidoreductase  37.25 
 
 		 447 aa  293  4e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.622258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2389  FAD dependent oxidoreductase  35.86 
 
 		 446 aa  291  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.986344 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3398  FAD dependent oxidoreductase  37.75 
 
 		 442 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2458  FAD dependent oxidoreductase  35.91 
 
 		 442 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2005  FAD dependent oxidoreductase  36.38 
 
 		 443 aa  276  6e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.343798  normal  0.360324 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01621  putative oxidoreductase  36.34 
 
 		 452 aa  271  2.9999999999999997e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0489  FAD dependent oxidoreductase  34.81 
 
 		 446 aa  267  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0954  FAD dependent oxidoreductase  35.63 
 
 		 445 aa  213  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.650756  normal  0.921941 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 432 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  32.35 
 
 		 430 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  30.07 
 
 		 437 aa  170  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  32.13 
 
 		 430 aa  170  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 		 427 aa  169  9e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 		 436 aa  169  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  33.01 
 
 		 428 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  34.25 
 
 		 423 aa  169  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  32.09 
 
 		 435 aa  168  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  32.07 
 
 		 428 aa  167  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 		 449 aa  167  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6592  FAD dependent oxidoreductase  31.8 
 
 		 424 aa  167  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  32.07 
 
 		 428 aa  167  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  31.65 
 
 		 428 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  32.27 
 
 		 427 aa  166  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 		 425 aa  166  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 440 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 		 433 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  32.66 
 
 		 435 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  32.13 
 
 		 428 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2980  FAD dependent oxidoreductase  32.52 
 
 		 435 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.104228  normal  0.569064 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  31.76 
 
 		 426 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 		 426 aa  164  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  31.76 
 
 		 426 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.76 
 
 		 426 aa  164  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  31.23 
 
 		 427 aa  164  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  32.78 
 
 		 428 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 434 aa  163  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.53 
 
 		 426 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  31.53 
 
 		 426 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.53 
 
 		 426 aa  162  9e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 		 428 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.76 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  30.5 
 
 		 440 aa  162  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.31 
 
 		 426 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  31.34 
 
 		 428 aa  160  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 		 428 aa  159  7e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 		 428 aa  159  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6091  FAD dependent oxidoreductase  31.23 
 
 		 424 aa  159  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 		 425 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  31.14 
 
 		 427 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  30.1 
 
 		 444 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 		 428 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  28.9 
 
 		 425 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  31.29 
 
 		 428 aa  159  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  31.14 
 
 		 427 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4840  FAD dependent oxidoreductase  32.48 
 
 		 445 aa  158  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1494  FAD dependent oxidoreductase  31.23 
 
 		 424 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250769  hitchhiker  0.00298171 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  30.38 
 
 		 428 aa  158  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 		 428 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  30.1 
 
 		 444 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  30.24 
 
 		 426 aa  158  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3075  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 		 425 aa  157  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.769709  normal  0.0446875 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 433 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  30.1 
 
 		 425 aa  156  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  29.33 
 
 		 430 aa  156  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  27.63 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  30.03 
 
 		 424 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  30.27 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4421  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 		 425 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  29.77 
 
 		 427 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 		 435 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  27.36 
 
 		 435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 		 433 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 		 436 aa  154  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 		 435 aa  154  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  28.6 
 
 		 439 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  28.51 
 
 		 437 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  28.98 
 
 		 439 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  29.47 
 
 		 438 aa  153  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 		 444 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>