More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4553 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4553  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 311 aa  631  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3125  PfkB domain protein  68.83 
 
 		 309 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3397  PfkB domain protein  68.98 
 
 		 309 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.125463 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2294  ribokinase-like domain-containing protein  44 
 
 		 317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0873  ribokinase-like domain-containing protein  33.67 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0140  PfkB domain protein  28.62 
 
 		 326 aa  113  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04860  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 		 823 aa  95.1  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3857  PfkB domain protein  30.67 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  27.24 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  33.33 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  28.92 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  32.03 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2767  putative carbohydrate kinase  28.87 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.634409  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  32.03 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  24.01 
 
 		 334 aa  72.4  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2897  ribokinase-like domain-containing protein  29.61 
 
 		 387 aa  72.8  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  30.96 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  29.89 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  27.04 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2376  kinase, PfkB family  27.12 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.15593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  34.58 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  25.47 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  28.62 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  25.47 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5796  PfkB domain protein  28.29 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4135  PfkB  28.78 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0867142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7479  ribokinase  28.34 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2287  kinase, PfkB family  26.8 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  29.08 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  29.41 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  27.76 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  29.41 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  29.1 
 
 		 315 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  28.21 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2607  PfkB domain protein  28.15 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000945109 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  27.52 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  22.96 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  29.41 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  28.66 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2331  kinase PfkB family  26.8 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  29.41 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2488  PfkB family kinase  26.8 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  28.76 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  28.76 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  28.72 
 
 		 331 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2380  kinase, PfkB family  26.8 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.511168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5137  PfkB domain protein  25.68 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  28.17 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  24.92 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2287  PfkB domain protein  29.59 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  28.34 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  30.18 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18020  sugar kinase, ribokinase  30.57 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  24.53 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  24.53 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  24.53 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  22.96 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  30.51 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  27.64 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  28.52 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  31.64 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1001  PfkB domain protein  27.36 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3309  PfkB domain protein  26.67 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  28.1 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  26.07 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  30.03 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  28.98 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  26.85 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  29.07 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2477  ribokinase-like domain-containing protein  27.18 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  30.55 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  27.68 
 
 		 309 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3008  PfkB domain protein  32.79 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.554278  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  27.78 
 
 		 329 aa  62  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  23.55 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  24.23 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  26.97 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6168  PfkB domain protein  27.8 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369146  hitchhiker  0.00391077 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  26.88 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  26.67 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  27.34 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  27.04 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  26.88 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5449  PfkB domain protein  27.96 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  27.02 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  28.03 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  26.1 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0544  PfkB domain protein  29.5 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  26.34 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  27.34 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  27.34 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  27.34 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2228  PfkB domain protein  36.43 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.657681  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  29.96 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2316  PfkB domain protein  36.43 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  28.72 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  28.08 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  29.9 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  29.96 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00870  sugar kinase, ribokinase  27.12 
 
 		 445 aa  59.3  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.454231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>