More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4273 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 421 aa  853    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3496  adenylate/guanylate cyclase  70.71 
 
 		 407 aa  584  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3791  adenylate/guanylate cyclase  69.72 
 
 		 410 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5435  hypothetical protein  61.54 
 
 		 404 aa  494  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.185404 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1213  adenylate/guanylate cyclase  40.1 
 
 		 399 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.782915  normal  0.51515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1395  adenylate/guanylate cyclase  40.74 
 
 		 399 aa  259  8e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0858263  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2471  adenylate/guanylate cyclase  38.46 
 
 		 391 aa  247  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0574  adenylate/guanylate cyclase  39.74 
 
 		 396 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3188  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  39.48 
 
 		 411 aa  231  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0854  adenylate/guanylate cyclase  36.32 
 
 		 464 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0617  adenylate/guanylate cyclase  37.47 
 
 		 424 aa  227  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654981  normal  0.11859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0606  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.56 
 
 		 466 aa  226  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.387711  normal  0.106969 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3512  adenylate/guanylate cyclase  39.22 
 
 		 411 aa  226  6e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.617288 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0836  adenylate/guanylate cyclase  37.63 
 
 		 401 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0773  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.78 
 
 		 465 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0582  adenylate/guanylate cyclase  37.23 
 
 		 425 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0247859  hitchhiker  0.00751197 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7122  putative adenylate/guanylate cyclase  33.93 
 
 		 447 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.526481  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4590  putative adenylate/guanylate cyclase  33.76 
 
 		 494 aa  219  7e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0480836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5969  putative adenylate/guanylate cyclase  33.42 
 
 		 447 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.552237  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0956  adenylate/guanylate cyclase  37.17 
 
 		 401 aa  216  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  35.94 
 
 		 517 aa  216  8e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5605  adenylate cyclase  33.51 
 
 		 450 aa  216  8e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3384  adenylate/guanylate cyclase  39.95 
 
 		 427 aa  216  8e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0986  adenylate/guanylate cyclase  37.11 
 
 		 400 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0675159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7519  adenylate/guanylate cyclase  37.01 
 
 		 426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156263  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6772  adenylate/guanylate cyclase  36.34 
 
 		 416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3993  putative adenylate/guanylate cyclase  33.94 
 
 		 388 aa  192  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2375  adenylate/guanylate cyclase  36.31 
 
 		 348 aa  190  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.165554  decreased coverage  0.00302475 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2619  adenylate/guanylate cyclase  32.18 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.556471 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5268  adenylate/guanylate cyclase  36.18 
 
 		 379 aa  180  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0287319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0018  adenylate/guanylate cyclase  31.93 
 
 		 420 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0171686 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4896  putative adenylate/guanylate cyclase  32.38 
 
 		 401 aa  176  9e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549571 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4661  putative adenylate/guanylate cyclase  32.16 
 
 		 424 aa  170  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3770  adenylate/guanylate cyclase  32.03 
 
 		 405 aa  169  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154148  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2359  adenylate/guanylate cyclase  32.73 
 
 		 370 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071599  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3482  adenylate/guanylate cyclase  32.64 
 
 		 405 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285449  normal  0.641305 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2756  putative adenylate/guanylate cyclase  31.25 
 
 		 406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2682  adenylate/guanylate cyclase  31.89 
 
 		 367 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3875  putative adenylate/guanylate cyclase  33.25 
 
 		 367 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3196  adenylate/guanylate cyclase  30.69 
 
 		 406 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  33.77 
 
 		 858 aa  129  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  31.4 
 
 		 614 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  34.08 
 
 		 483 aa  127  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  37.35 
 
 		 585 aa  126  9e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  38.43 
 
 		 632 aa  125  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1795  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  39.42 
 
 		 440 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000135307  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  31.17 
 
 		 859 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3665  adenylate/guanylate cyclase  38.28 
 
 		 439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.715111 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  36.77 
 
 		 641 aa  116  6.9999999999999995e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  31.22 
 
 		 638 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2648  adenylate/guanylate cyclase  34.7 
 
 		 464 aa  112  9e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  35.81 
 
 		 645 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  30.09 
 
 		 903 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  36.27 
 
 		 864 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  29.65 
 
 		 441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  39.57 
 
 		 500 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  36.77 
 
 		 358 aa  111  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  35.12 
 
 		 561 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  29.24 
 
 		 911 aa  111  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  37.29 
 
 		 364 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  29.2 
 
 		 431 aa  109  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  32.92 
 
 		 971 aa  109  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  39.34 
 
 		 586 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  37.36 
 
 		 577 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  39.74 
 
 		 558 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  32.8 
 
 		 643 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  29.52 
 
 		 735 aa  106  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.94 
 
 		 672 aa  106  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.99 
 
 		 701 aa  106  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.41 
 
 		 656 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  35.12 
 
 		 740 aa  105  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.96 
 
 		 652 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  39.2 
 
 		 969 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  33.49 
 
 		 632 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.69 
 
 		 611 aa  104  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  27.35 
 
 		 860 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.24 
 
 		 650 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  29.59 
 
 		 643 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  24.68 
 
 		 861 aa  103  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5302  putative adenylate cyclase  34.3 
 
 		 431 aa  103  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.45 
 
 		 757 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1802  adenylate/guanylate cyclase  35.32 
 
 		 591 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  32.22 
 
 		 483 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  32.22 
 
 		 483 aa  101  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.91 
 
 		 737 aa  101  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  32.24 
 
 		 284 aa  101  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  35.91 
 
 		 571 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  27.62 
 
 		 744 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  31.52 
 
 		 465 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  34.84 
 
 		 699 aa  100  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  28.19 
 
 		 641 aa  99.8  7e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  31.7 
 
 		 469 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  30.11 
 
 		 637 aa  100  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  31.86 
 
 		 665 aa  99.8  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  31.36 
 
 		 607 aa  99.8  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  31.02 
 
 		 729 aa  99.8  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  30.48 
 
 		 515 aa  99.8  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  31.2 
 
 		 518 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  32.13 
 
 		 667 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  27.67 
 
 		 701 aa  97.4  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>