More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2919 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  299  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  72.48 
 
 		 153 aa  216  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3713  AsnC family transcriptional regulator  61.43 
 
 		 142 aa  166  9e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  60 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  56.64 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0596  AsnC family transcriptional regulator  59.29 
 
 		 149 aa  163  6.9999999999999995e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4327  AsnC family transcriptional regulator  55.47 
 
 		 143 aa  144  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  50.36 
 
 		 153 aa  140  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  50.36 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  50.36 
 
 		 153 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1123  AsnC family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  hitchhiker  0.00138165 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0270  AsnC family transcriptional regulator  50.36 
 
 		 169 aa  138  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1937  AsnC family transcriptional regulator  51.75 
 
 		 143 aa  136  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4819  AsnC family transcriptional regulator  49.64 
 
 		 153 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 151 aa  131  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  48.99 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  49.64 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  48.32 
 
 		 152 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 142 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0519  transcriptional regulator, AsnC family  48.18 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  45.39 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5153  AsnC family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 153 aa  124  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 153 aa  124  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 143 aa  123  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1990  AsnC family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 193 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 193 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0700  AsnC family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2305  AsnC family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 295 aa  121  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 152 aa  121  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1845  transcriptional regulator, AsnC family  49.61 
 
 		 148 aa  120  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2036  AsnC family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 150 aa  120  5e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5594  transcriptional regulator, AsnC family  43.06 
 
 		 153 aa  120  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3209  AsnC family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2322  AsnC family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.810886  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3052  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 152 aa  114  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430481  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4332  AsnC family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0119  AsnC family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 142 aa  107  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 142 aa  107  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2578  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 156 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522022  normal  0.412871 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3892  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4079  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 154 aa  96.3  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0593  transcriptional regulator, AsnC family  42.22 
 
 		 143 aa  94.4  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1252  AsnC family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 146 aa  94  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244343  normal  0.0514931 
 
 
-
 
NC_003296  RS00360  transcription regulator protein  36.3 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 175 aa  92.8  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1326  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 142 aa  92.8  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.323445 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4681  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 140 aa  91.3  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2673  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 140 aa  90.9  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 143 aa  90.5  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 143 aa  90.5  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 143 aa  90.5  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2393  AsnC family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1796  AsnC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4365  AsnC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 153 aa  87.8  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1050  AsnC family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 143 aa  87.4  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.751551  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3029  transcriptional regulator, AsnC family  37.31 
 
 		 141 aa  87.4  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.698744 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2801  AsnC/Lrp family regulatory protein  37.31 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1172  AsnC family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 152 aa  86.7  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  35.42 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3916  transcriptional regulator, AsnC family  35.97 
 
 		 145 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.94143 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3628  transcriptional regulator, AsnC family  36.69 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.568388  normal  0.0860677 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3532  AsnC family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 145 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2241  AsnC family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 140 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2925  transcriptional regulator, AsnC family  35.25 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0901  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 145 aa  84.3  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1166  AsnC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 143 aa  84  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0224688 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  34.03 
 
 		 150 aa  84  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0844  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.837242  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1404  AsnC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0614  AsnC family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0892  AsnC family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3882  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5976  transcriptional regulator AsnC family  37.5 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3362  AsnC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.672026  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2396  AsnC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373992  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0951  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1469  AsnC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2600  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 162 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.932324  normal  0.0676602 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0278  AsnC family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 141 aa  80.1  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421168 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2890  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  37.04 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  34.03 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>