285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2586 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2586  histidine ammonia-lyase  100 
 
 		 504 aa  999    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206795  normal  0.158772 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5104  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  62.32 
 
 		 534 aa  560  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.0115263 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1825  histidine ammonia-lyase  61.19 
 
 		 549 aa  556  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.26483 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5619  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  62.66 
 
 		 497 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75216  normal  0.2633 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5747  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  62.45 
 
 		 497 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6593  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  62.66 
 
 		 497 aa  548  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.783722  normal  0.178286 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5836  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  62.98 
 
 		 497 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6111  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  62.45 
 
 		 497 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4838  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  61.4 
 
 		 549 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132188 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6911  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  57.91 
 
 		 495 aa  528  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5918  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  57.7 
 
 		 497 aa  523  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18522 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0506  histidine ammonia-lyase  58.93 
 
 		 495 aa  519  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5274  histidine ammonia-lyase  48.96 
 
 		 513 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4832  histidine ammonia-lyase  49.17 
 
 		 513 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1260  histidine ammonia-lyase  51.03 
 
 		 523 aa  431  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5827  putative histidine/phenylalanine ammonia-lyase  51.88 
 
 		 510 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67260  putative histidine/phenylalanine ammonia-lyase  51.02 
 
 		 510 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2648  histidine ammonia-lyase  50.21 
 
 		 500 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186623  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0365  histidine ammonia-lyase  48.55 
 
 		 507 aa  413  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851279 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0799  histidine ammonia-lyase  47.83 
 
 		 507 aa  404  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.873754 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  41.99 
 
 		 507 aa  358  9.999999999999999e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  38.14 
 
 		 516 aa  345  1e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  43.86 
 
 		 509 aa  342  1e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  39.59 
 
 		 508 aa  330  3e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  40.79 
 
 		 507 aa  321  1.9999999999999998e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  43.86 
 
 		 506 aa  317  4e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  40.33 
 
 		 511 aa  311  2e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  43.72 
 
 		 506 aa  309  8e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  44.68 
 
 		 499 aa  304  3.0000000000000004e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  45.06 
 
 		 508 aa  300  6e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  44.64 
 
 		 508 aa  296  8e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  44.64 
 
 		 508 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  39.15 
 
 		 508 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  36.08 
 
 		 505 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  36.46 
 
 		 506 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  37.42 
 
 		 505 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  35.86 
 
 		 505 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  36.98 
 
 		 505 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  36.8 
 
 		 505 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  35.86 
 
 		 505 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  36.98 
 
 		 505 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  42.51 
 
 		 509 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  36.25 
 
 		 505 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  36.46 
 
 		 505 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0008  histidine ammonia-lyase  34.33 
 
 		 504 aa  282  9e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0008  histidine ammonia-lyase  34.33 
 
 		 504 aa  282  9e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  38.03 
 
 		 498 aa  282  9e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  40.3 
 
 		 526 aa  282  9e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  36.46 
 
 		 505 aa  282  9e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  40.28 
 
 		 520 aa  280  4e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0908  histidine ammonia-lyase  40.9 
 
 		 497 aa  279  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3837  histidine ammonia-lyase  38.77 
 
 		 536 aa  277  4e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.783362  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  42.38 
 
 		 514 aa  273  7e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  38.66 
 
 		 504 aa  272  9e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0058  histidine ammonia-lyase  39.37 
 
 		 511 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6152  Histidine ammonia-lyase  39.59 
 
 		 515 aa  269  7e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526934 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1747  histidine ammonia-lyase  41.21 
 
 		 508 aa  268  1e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000510266  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  37.76 
 
 		 513 aa  268  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  34.39 
 
 		 523 aa  267  2.9999999999999995e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  38.3 
 
 		 507 aa  266  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  38.45 
 
 		 514 aa  266  8e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3001  histidine ammonia-lyase  41.46 
 
 		 534 aa  265  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.463238  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  36.92 
 
 		 489 aa  265  1e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0324  histidine ammonia-lyase  36.96 
 
 		 497 aa  265  2e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1335  histidine ammonia-lyase  36.48 
 
 		 506 aa  263  4e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1603  histidine ammonia-lyase  38.68 
 
 		 507 aa  263  4e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.329412  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1331  histidine ammonia-lyase  36.69 
 
 		 506 aa  263  4.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  38.06 
 
 		 513 aa  263  4.999999999999999e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  38.61 
 
 		 514 aa  263  6e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  38.81 
 
 		 518 aa  262  8e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  34.76 
 
 		 505 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1631  histidine ammonia-lyase  36 
 
 		 497 aa  262  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104747  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03126  histidine ammonia-lyase  37.39 
 
 		 538 aa  261  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.840651  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  36.8 
 
 		 510 aa  261  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11158  histidine ammonia-lyase  34.84 
 
 		 503 aa  261  3e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.926565  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  37.65 
 
 		 511 aa  260  5.0000000000000005e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0996  histidine ammonia-lyase  41.52 
 
 		 512 aa  259  8e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4629  histidine ammonia-lyase  38.43 
 
 		 528 aa  258  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1837  histidine ammonia-lyase  40.92 
 
 		 526 aa  258  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0180395 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  37.82 
 
 		 513 aa  258  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  37.82 
 
 		 513 aa  258  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  37.82 
 
 		 513 aa  258  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  35.61 
 
 		 511 aa  258  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  39.38 
 
 		 515 aa  258  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  36.97 
 
 		 512 aa  257  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2646  histidine ammonia-lyase  40.75 
 
 		 518 aa  256  5e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0281382  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4632  histidine ammonia-lyase  40 
 
 		 509 aa  256  5e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  40.13 
 
 		 516 aa  256  7e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  36.78 
 
 		 510 aa  256  7e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  38.18 
 
 		 513 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4453  histidine ammonia-lyase  39.63 
 
 		 514 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.365428  normal  0.898913 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0918  histidine ammonia-lyase  37.6 
 
 		 506 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0886  histidine ammonia-lyase  37.6 
 
 		 506 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1038  histidine ammonia-lyase  39.96 
 
 		 515 aa  254  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116739  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0941  histidine ammonia-lyase  39.08 
 
 		 506 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0855  histidine ammonia-lyase  39.08 
 
 		 506 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1106  histidine ammonia-lyase  40.22 
 
 		 512 aa  254  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2088  histidine ammonia-lyase  38.4 
 
 		 507 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1098  histidine ammonia-lyase  38.72 
 
 		 506 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4040  histidine ammonia-lyase  37.88 
 
 		 524 aa  253  5.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>