More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0192 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0192  KpsF/GutQ family protein  100 
 
 		 334 aa  662    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4997  KpsF/GutQ family protein  95.78 
 
 		 333 aa  630  1e-179  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0692534 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5015  KpsF/GutQ family protein  72.27 
 
 		 329 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.336764 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0931  sugar isomerase, KpsF/GutQ family protein  54.91 
 
 		 325 aa  366  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1995  KpsF/GutQ family protein  58.1 
 
 		 338 aa  360  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0928427  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0864  KpsF/GutQ family protein  54.92 
 
 		 336 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3413  KpsF/GutQ family protein  53.68 
 
 		 325 aa  360  2e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.285872  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4539  KpsF/GutQ family protein  54.6 
 
 		 336 aa  358  8e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0769  KpsF/GutQ family protein  53.29 
 
 		 337 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0947  KpsF/GutQ family protein  53.65 
 
 		 337 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2737  KpsF/GutQ family protein  56.76 
 
 		 331 aa  350  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.182131  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1252  KpsF/GutQ family protein  56.51 
 
 		 338 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465409  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1901  KpsF/GutQ family protein  54.86 
 
 		 329 aa  339  4e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4326  KpsF/GutQ family protein  55.36 
 
 		 341 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1895  KpsF/GutQ family protein  53.82 
 
 		 338 aa  332  6e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0258547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0068  sugar isomerase, KpsF/GutQ  50.76 
 
 		 359 aa  331  8e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.695575  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0073  sugar isomerase, KpsF/GutQ  50.76 
 
 		 333 aa  331  1e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1362  arabinose 5-phosphate isomerase  54.06 
 
 		 333 aa  330  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.0702904 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3899  KpsF/GutQ family protein  52.68 
 
 		 340 aa  328  6e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0335  KpsF/GutQ family sugar isomerase  50.79 
 
 		 330 aa  328  8e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3607  KpsF/GutQ family protein  52.68 
 
 		 340 aa  328  8e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4285  KpsF/GutQ family protein  52.37 
 
 		 341 aa  328  9e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.746781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2608  KpsF/GutQ family protein  52.04 
 
 		 315 aa  323  4e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3854  KpsF/GutQ family protein  56.36 
 
 		 323 aa  320  9.999999999999999e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3722  capsule expression protein  51.75 
 
 		 331 aa  321  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3307  KpsF/GutQ family protein  51.86 
 
 		 331 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0014  KpsF/GutQ  53.74 
 
 		 366 aa  319  5e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3588  arabinose-5-phosphate isomerase  52.94 
 
 		 320 aa  318  6e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4269  KpsF/GutQ family protein  51.07 
 
 		 354 aa  315  6e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2774  KpsF/GutQ family protein  53.48 
 
 		 321 aa  315  9e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3609  KpsF/GutQ family protein  49.85 
 
 		 331 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2497  KpsF/GutQ family protein  50.78 
 
 		 322 aa  312  4.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1208  KpsF/GutQ family protein  55.52 
 
 		 323 aa  311  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.905604 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0334  KpsF/GutQ family protein  54.45 
 
 		 353 aa  309  4e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.139935  normal  0.203565 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2814  KpsF/GutQ family protein  53.48 
 
 		 321 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1153  sugar phosphate isomerase  55.29 
 
 		 307 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1670  KpsF/GutQ family protein  53.58 
 
 		 340 aa  300  3e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.225758  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2580  KpsF/GutQ family protein  50.17 
 
 		 339 aa  289  4e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.597133  unclonable  0.0000162693 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  48.12 
 
 		 326 aa  280  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  47.69 
 
 		 320 aa  279  5e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  47.92 
 
 		 320 aa  276  5e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  47.92 
 
 		 320 aa  276  5e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  47.46 
 
 		 339 aa  275  6e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  46.2 
 
 		 324 aa  275  6e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  46.35 
 
 		 324 aa  275  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  47.99 
 
 		 324 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  47.99 
 
 		 324 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  46.63 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0073  KpsF/GutQ family protein  50.61 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  50 
 
 		 322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  47.68 
 
 		 324 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0166  KpsF/GutQ family protein  41.49 
 
 		 319 aa  269  4e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  50.17 
 
 		 324 aa  269  5e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3105  KpsF/GutQ family protein  44.48 
 
 		 324 aa  268  8e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.345406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  44.41 
 
 		 315 aa  268  8.999999999999999e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  50.17 
 
 		 326 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  46.01 
 
 		 321 aa  268  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  44.79 
 
 		 321 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3965  KpsF/GutQ family protein  44.52 
 
 		 330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  45.2 
 
 		 324 aa  265  7e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  45.71 
 
 		 321 aa  265  7e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  49.31 
 
 		 329 aa  265  8.999999999999999e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  47.37 
 
 		 324 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  46.56 
 
 		 322 aa  263  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  44.58 
 
 		 324 aa  263  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  46.89 
 
 		 322 aa  263  4e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  45.03 
 
 		 323 aa  261  8.999999999999999e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  46.18 
 
 		 321 aa  261  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  46.98 
 
 		 323 aa  261  2e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1612  KpsF/GutQ family protein  47.96 
 
 		 330 aa  259  4e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  44.27 
 
 		 324 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4477  KpsF/GutQ family protein  45.45 
 
 		 334 aa  258  8e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382175  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  47.94 
 
 		 330 aa  257  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  48.96 
 
 		 327 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0563  KpsF/GutQ family protein  44.1 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57393  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  42.24 
 
 		 326 aa  256  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  47.77 
 
 		 333 aa  256  4e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  45.65 
 
 		 344 aa  256  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  47.99 
 
 		 333 aa  256  5e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  43.96 
 
 		 324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0438  KpsF/GutQ family protein  44.44 
 
 		 326 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.181851 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  48.26 
 
 		 327 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.98 
 
 		 328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2638  KpsF/GutQ family protein  48.97 
 
 		 328 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.545154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3507  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.4 
 
 		 328 aa  252  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3030  sugar isomerase, KpsF/GutQ family  48.97 
 
 		 328 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3674  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.64 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  0.0549633 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3576  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.64 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4235  KpsF/GutQ family protein  42.46 
 
 		 325 aa  251  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000366362 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3490  KpsF/GutQ family protein  48.8 
 
 		 333 aa  251  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3612  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.64 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.164557 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0731  arabinose-5-phosphate isomerase  45.49 
 
 		 325 aa  250  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  43.03 
 
 		 331 aa  251  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0137  KpsF/GutQ family protein  46.59 
 
 		 335 aa  250  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0678  KpsF/GutQ family protein  43.94 
 
 		 325 aa  250  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.732488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3344  KpsF/GutQ family protein  44.29 
 
 		 325 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2225  KpsF/GutQ family protein  47.74 
 
 		 341 aa  251  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.574714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  46.06 
 
 		 333 aa  250  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4132  KpsF/GutQ family protein  50.18 
 
 		 333 aa  250  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0494  KpsF/GutQ family protein  43.54 
 
 		 325 aa  249  4e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0102894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>