224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3668 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3668  peptidase M56 BlaR1  100 
 
 
509 aa  984    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0579  peptidase M56, BlaR1  33.27 
 
 
541 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1881  peptidase M56, BlaR1  32.03 
 
 
556 aa  144  6e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.553745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2929  peptidase M56 BlaR1  35.63 
 
 
590 aa  137  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3297  peptidase M56, BlaR1  31.72 
 
 
423 aa  99.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2876  peptidase M56 BlaR1  31.14 
 
 
465 aa  91.7  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5187  peptidase M56 BlaR1  33.33 
 
 
750 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336784  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3787  peptidase M56 BlaR1  27.93 
 
 
617 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.536626  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2520  methicillin-resistance regulatory protein MecR1  19.66 
 
 
585 aa  77.8  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00119182  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0030  Beta-lactamase  19.66 
 
 
585 aa  77.8  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0030  Beta-lactamase  19.66 
 
 
585 aa  77.8  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  26.46 
 
 
858 aa  77  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  37.62 
 
 
405 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1934  peptidase M56 BlaR1  24.54 
 
 
647 aa  73.9  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  35.85 
 
 
1156 aa  72.8  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1140  peptidase M56 BlaR1  31.11 
 
 
598 aa  72.4  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  27.63 
 
 
404 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  30.54 
 
 
417 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  29.03 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  37.01 
 
 
404 aa  68.2  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  35.42 
 
 
762 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2408  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  33.04 
 
 
619 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2615  cell wall hydrolase/autolysin  23.32 
 
 
562 aa  66.6  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3722  peptidase M56 BlaR1  25.99 
 
 
631 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.616369  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  34.15 
 
 
403 aa  65.5  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0471  Ankyrin  33.06 
 
 
249 aa  65.1  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  35.36 
 
 
395 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  31.25 
 
 
1030 aa  62.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  40.4 
 
 
382 aa  63.2  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1810  peptidase M56, BlaR1  22.19 
 
 
750 aa  62.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0994  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  24.45 
 
 
632 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2388  ankyrin  33.33 
 
 
217 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.751385 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3653  ankyrin repeat-containing protein  41.76 
 
 
195 aa  61.6  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1581  hypothetical protein  33.33 
 
 
157 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  32.92 
 
 
1585 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  36.09 
 
 
447 aa  61.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4715  peptidase M56 BlaR1  35.85 
 
 
465 aa  61.2  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0923928  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  38.52 
 
 
494 aa  60.8  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2662  ankyrin  38.81 
 
 
756 aa  60.5  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1071  ankyrin  34.59 
 
 
342 aa  60.1  0.00000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1007  hypothetical protein  25.16 
 
 
629 aa  60.1  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1079  hypothetical protein  25.16 
 
 
629 aa  60.1  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1663  FOG: Ankyrin repeat protein  38.1 
 
 
285 aa  60.1  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.10004 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  39.02 
 
 
490 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08085  conserved hypothetical protein  34.46 
 
 
1021 aa  59.3  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130443  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6205  peptidase M56 BlaR1  22.91 
 
 
671 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.86421 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1176  hypothetical protein  24.84 
 
 
640 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0911  hypothetical protein  36.18 
 
 
931 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0380613 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2498  ankyrin  31.87 
 
 
479 aa  58.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  40 
 
 
870 aa  58.9  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0418  Ankyrin  35.43 
 
 
544 aa  59.3  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03543  conserved hypothetical protein  35.62 
 
 
1622 aa  58.2  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.088624  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08300  conserved hypothetical protein  29.63 
 
 
1977 aa  58.5  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000214418 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1111  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  25.81 
 
 
589 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  30.65 
 
 
1061 aa  58.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0229  Ankyrin  33.62 
 
 
715 aa  58.5  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000140183  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0209  peptidase M56, BlaR1  26.82 
 
 
660 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3351  Beta-lactamase  24.14 
 
 
596 aa  58.2  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2753  peptidase M56 BlaR1  26.64 
 
 
581 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.395295 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03267  conserved hypothetical protein  35.42 
 
 
766 aa  57.8  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.104781  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  34.75 
 
 
821 aa  57.8  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2068  peptidase M56 BlaR1  21.94 
 
 
632 aa  57.4  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.999712  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3883  peptidase M56 BlaR1  36.71 
 
 
299 aa  57.4  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.155666  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0288  peptidase M56 BlaR1  25 
 
 
651 aa  57.4  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139173  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08304  conserved hypothetical protein  30.94 
 
 
1198 aa  56.6  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000526329 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3146  peptidase M56, BlaR1  27.74 
 
 
728 aa  56.2  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5199  peptidase M56 BlaR1  22.98 
 
 
477 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0015  ankyrin  35.77 
 
 
194 aa  56.2  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.189305  hitchhiker  0.00296993 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2693  ankyrin repeat-containing protein  37.72 
 
 
933 aa  55.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.82952  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3421  Ankyrin  36.99 
 
 
197 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175263  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0824  ankyrin  31.05 
 
 
266 aa  55.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  29.68 
 
 
462 aa  55.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  30.58 
 
 
855 aa  55.1  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1590  peptidase M56, BlaR1  23.96 
 
 
754 aa  55.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1958  Ankyrin  27.22 
 
 
234 aa  54.7  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02323  peptidase, M56 family protein  31.43 
 
 
361 aa  54.7  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.321617  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2488  Ankyrin  37.5 
 
 
196 aa  53.9  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2666  ankyrin  36.69 
 
 
237 aa  53.9  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.931958  hitchhiker  0.000000569803 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3255  ankyrin  31.85 
 
 
395 aa  53.5  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3561  Ankyrin  31.14 
 
 
331 aa  53.5  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.466152  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  34.82 
 
 
2171 aa  53.5  0.000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0382  ankyrin repeat protein  36.36 
 
 
891 aa  52.8  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2318  Ankyrin  32.43 
 
 
217 aa  53.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3768  hypothetical protein  36.23 
 
 
279 aa  53.5  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0499  hypothetical protein  34.53 
 
 
282 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  31.2 
 
 
731 aa  53.1  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3471  peptidase M56 BlaR1  34.04 
 
 
322 aa  53.5  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1797  ankyrin repeat-containing protein  36.36 
 
 
483 aa  53.1  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0550  ankyrin repeat-containing protein  27.68 
 
 
329 aa  52.4  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  24.74 
 
 
467 aa  52.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2634  ankyrin  34.59 
 
 
269 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366745  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2423  peptidase M56, BlaR1  29.82 
 
 
380 aa  52.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.906062  normal  0.563265 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32350  hypothetical protein  31.97 
 
 
210 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.234736  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  28.57 
 
 
2413 aa  52.4  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02994  conserved hypothetical protein  32.35 
 
 
1133 aa  52  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6702  Ankyrin repeat-domain-containing protein-like protein  42.16 
 
 
482 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.142315  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0162  ankyrin  34.78 
 
 
141 aa  51.6  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3006  ankyrin  33.33 
 
 
222 aa  51.6  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14960  Ankyrin  28 
 
 
483 aa  52  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388228  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  35.44 
 
 
413 aa  51.6  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>