More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3011 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3011  Peptidase M23  100 
 
 		 223 aa  450  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0127254 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02339  M23 peptidase domain protein  57.94 
 
 		 238 aa  248  7e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.213861  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3584  peptidase M23B  68.84 
 
 		 174 aa  196  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3804  peptidase M23B  55.29 
 
 		 199 aa  180  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.019155 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0146  Peptidase M23  42.34 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3409  Peptidase M23  39.57 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1921  metallopeptidase peptidase  40.48 
 
 		 196 aa  97.1  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318807 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2227  peptidase M23B  40.31 
 
 		 172 aa  97.1  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2214  peptidase M23B  40.48 
 
 		 198 aa  96.7  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.250038 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0489  peptidase M23B  39.31 
 
 		 194 aa  94  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01987  peptidase  35.81 
 
 		 204 aa  87.8  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1360  Peptidase M23  37.78 
 
 		 348 aa  85.1  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.119813  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  40.16 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6234  Peptidase M23  37.29 
 
 		 446 aa  78.6  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  47.31 
 
 		 503 aa  76.3  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2717  Peptidase M23  34.75 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000153286  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  35.34 
 
 		 477 aa  72.8  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  37.84 
 
 		 464 aa  72.8  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  38.3 
 
 		 477 aa  72.4  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01485  peptidase  31.67 
 
 		 377 aa  71.6  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  39.36 
 
 		 441 aa  71.6  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  39.83 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3990  peptidase M23B  36.36 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  35.82 
 
 		 385 aa  69.3  0.00000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4508  Peptidase M23  32.74 
 
 		 392 aa  68.9  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.487012 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  39.32 
 
 		 412 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  33.58 
 
 		 325 aa  68.9  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  36.08 
 
 		 475 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  38.14 
 
 		 438 aa  68.6  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  36.13 
 
 		 325 aa  68.6  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  36.08 
 
 		 473 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  33.63 
 
 		 741 aa  68.6  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3052  Peptidase M23  35.34 
 
 		 329 aa  68.2  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0435  Peptidase M23  35.54 
 
 		 178 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  36.08 
 
 		 473 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  36.61 
 
 		 569 aa  67.8  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0367  tagE protein  33.33 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0247  M24/M37 family peptidase  38.46 
 
 		 449 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  36.51 
 
 		 453 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2617  peptidase M23B  29.24 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  41.94 
 
 		 425 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2289  peptidase M23B  29.38 
 
 		 457 aa  67  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000911471  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0464  peptidase M23B  42.55 
 
 		 484 aa  67  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0884  Peptidase M23  36.36 
 
 		 345 aa  67  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00022367  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  38.46 
 
 		 270 aa  67  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  42.55 
 
 		 400 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.91 
 
 		 547 aa  67  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.83 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  42.55 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  43.01 
 
 		 421 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  41.94 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  43.01 
 
 		 421 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  38.14 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  33.33 
 
 		 490 aa  66.6  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  36.08 
 
 		 472 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  34.33 
 
 		 527 aa  66.6  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  29.26 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  37.82 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  33.85 
 
 		 490 aa  66.6  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  37.07 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  33.06 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  31.21 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5572  Peptidase M23  34.97 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  33.86 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  37.74 
 
 		 465 aa  65.9  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2907  Peptidase M23  33.83 
 
 		 330 aa  65.9  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  44.94 
 
 		 464 aa  65.9  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  34.75 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0199  peptidase M23B  33.94 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  39.39 
 
 		 475 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  33.07 
 
 		 271 aa  65.1  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  38.95 
 
 		 333 aa  65.1  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  38.38 
 
 		 646 aa  65.1  0.0000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1351  Peptidase M23  40.21 
 
 		 467 aa  65.1  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.749113  hitchhiker  0.00315116 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  38.28 
 
 		 523 aa  65.1  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  39.32 
 
 		 319 aa  65.1  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  39.39 
 
 		 474 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  38.33 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.75 
 
 		 554 aa  64.7  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0813  peptidase M23B  30 
 
 		 548 aa  64.7  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31424  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  36.08 
 
 		 468 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  37.62 
 
 		 479 aa  64.3  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  37.11 
 
 		 503 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  35.25 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  37.11 
 
 		 656 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  36.17 
 
 		 533 aa  64.3  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0038  peptidase M23B  36.69 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  36.36 
 
 		 386 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0227  peptidase M23B  29.53 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0890169  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  34.42 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0123  peptidase, M23/M37 family  33.79 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0859179  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  36.36 
 
 		 386 aa  63.5  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0203  enterotoxin, putative  28.29 
 
 		 603 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4699  M24/M37 family peptidase  33.79 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0776348  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  40.45 
 
 		 464 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  29.68 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  43.16 
 
 		 468 aa  63.2  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0263  peptidase, M23/M37 family  28.29 
 
 		 603 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  36.08 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  33.61 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>