More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0168 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 296 aa  610  1e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  78.45 
 
 		 300 aa  496  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0885  alpha/beta hydrolase fold  72.3 
 
 		 301 aa  445  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1007  haloalkane dehalogenase  72.3 
 
 		 301 aa  444  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0490132  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  54.12 
 
 		 301 aa  329  3e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  53.15 
 
 		 297 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  54.45 
 
 		 295 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  55.16 
 
 		 308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  53.76 
 
 		 297 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  53.02 
 
 		 339 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  53.02 
 
 		 339 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  52.46 
 
 		 318 aa  317  1e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  53.02 
 
 		 320 aa  317  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  53.93 
 
 		 293 aa  316  3e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  53.26 
 
 		 290 aa  315  4e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1183  alpha/beta fold family hydrolase  53.5 
 
 		 310 aa  315  4e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  53.05 
 
 		 291 aa  315  6e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  52.67 
 
 		 302 aa  315  7e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  52.67 
 
 		 302 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  52.67 
 
 		 302 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  52.67 
 
 		 302 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  51.96 
 
 		 303 aa  308  8e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  53.07 
 
 		 294 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  52.71 
 
 		 296 aa  301  8.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  51.62 
 
 		 298 aa  300  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  51.99 
 
 		 300 aa  297  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  52.55 
 
 		 300 aa  296  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  48.62 
 
 		 294 aa  286  4e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  47.64 
 
 		 296 aa  279  4e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  46.35 
 
 		 294 aa  242  5e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  42.12 
 
 		 299 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  35.42 
 
 		 314 aa  172  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2462  AMP-dependent synthetase and ligase  37.74 
 
 		 861 aa  162  7e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0447  AMP-dependent synthetase and ligase  38.55 
 
 		 927 aa  161  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4241  AMP-dependent synthetase and ligase  34.55 
 
 		 875 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.727325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  36.22 
 
 		 922 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0417779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36600  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.33 
 
 		 922 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.478291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13240  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.33 
 
 		 978 aa  128  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  31.19 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  31.46 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  31.19 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2384  haloalkane dehalogenase  31.68 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00566343 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1915  haloalkane dehalogenase  30.74 
 
 		 306 aa  123  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0008  haloalkane dehalogenase  34.72 
 
 		 304 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.717639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17450  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.74 
 
 		 899 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12319  haloalkane dehalogenase  33.9 
 
 		 300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  30.96 
 
 		 289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3680  haloalkane dehalogenase  30.16 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2428  haloalkane dehalogenase  33.05 
 
 		 299 aa  109  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1777  alpha/beta hydrolase fold  29.87 
 
 		 324 aa  109  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 		 323 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  31.47 
 
 		 915 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0151795  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3197  haloalkane dehalogenase  30.77 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2056  haloalkane dehalogenase  31.14 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0257  alpha/beta hydrolase fold protein  31.5 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  25.8 
 
 		 293 aa  102  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  25.8 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  26.99 
 
 		 324 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  30.77 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1253  haloalkane dehalogenase  28.85 
 
 		 303 aa  99  8e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7423  alpha/beta hydrolase fold protein  29.7 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 		 323 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  26.62 
 
 		 286 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0901  haloalkane dehalogenase  30.42 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817656 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  28.72 
 
 		 329 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1907  alpha/beta hydrolase fold protein  27.07 
 
 		 299 aa  97.4  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0956  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 		 337 aa  97.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1611  haloalkane dehalogenase  33.01 
 
 		 301 aa  97.4  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2475  alpha/beta hydrolase fold protein  28.92 
 
 		 287 aa  97.4  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2671  haloalkane dehalogenase  29.71 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.731283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2620  haloalkane dehalogenase  28.82 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3743  Alpha/beta hydrolase  25.56 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0220967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4949  haloalkane dehalogenase  28.89 
 
 		 304 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00300745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5037  haloalkane dehalogenase  28.89 
 
 		 304 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5330  haloalkane dehalogenase  28.89 
 
 		 304 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 		 290 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 		 293 aa  89.7  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0534  alpha/beta hydrolase fold protein  34.3 
 
 		 298 aa  89.4  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  25.25 
 
 		 311 aa  89  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  25.52 
 
 		 303 aa  87.4  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  28.29 
 
 		 300 aa  87  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1240  alpha/beta hydrolase fold protein  29.29 
 
 		 295 aa  86.3  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  25.34 
 
 		 306 aa  86.7  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 301 aa  86.3  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12599  haloalkane dehalogenase  31.92 
 
 		 300 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.365341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5038  Alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 		 282 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  27.78 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4733  alpha/beta hydrolase fold  25.35 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  28.72 
 
 		 461 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4004  haloalkane dehalogenase  45.05 
 
 		 118 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0342025 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2917  alpha/beta hydrolase  26.85 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  27.78 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2769  alpha/beta hydrolase fold protein  27.59 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 		 311 aa  82.4  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>