More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_7057 on replicon NC_013737
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013737  Slin_7057  response regulator receiver protein  100 
 
 		 142 aa  292  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5264  response regulator receiver protein  45.08 
 
 		 142 aa  117  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5579  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  33.07 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  33.07 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2600  response regulator receiver protein  30.47 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1161  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  30 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5174  response regulator receiver protein  32.54 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2463  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.71 
 
 		 301 aa  70.5  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0507  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4953  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0356206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  31.01 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4908  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100675  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 		 939 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1527  response regulator receiver protein, CheY  29.82 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.439374 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  28.08 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0043  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 144 aa  67  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.304768 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2644  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 		 1303 aa  66.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229306  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  31.16 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3821  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305029  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  28.06 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0186  histidine kinase  31.15 
 
 		 810 aa  66.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2650  response regulator receiver protein  32.46 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  31.62 
 
 		 919 aa  65.5  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  34.38 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  27.48 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4099  histidine kinase  30 
 
 		 600 aa  64.7  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  decreased coverage  0.000691518 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  38.1 
 
 		 355 aa  64.3  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2541  nitrogen regulation protein NR(I)  29.92 
 
 		 470 aa  64.3  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0008  PAS  30.77 
 
 		 1439 aa  64.3  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130257  normal  0.0574671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 935 aa  64.3  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4883  nitrogen regulation protein NR(I)  34.55 
 
 		 470 aa  64.3  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.177074  hitchhiker  0.0000322182 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1989  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 		 1937 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1671  histidine kinase  32.2 
 
 		 1937 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 		 945 aa  63.5  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3210  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 		 1936 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  29.82 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1095  response regulator receiver domain-containing protein  29.46 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117755  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2383  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.2 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665942 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  29.92 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  29.23 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2076  response regulator receiver protein  43.01 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0497  response regulator receiver protein  29.69 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.41839  hitchhiker  0.0000227207 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  27.35 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 137 aa  62  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  26.92 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3583  response regulator receiver protein  30.1 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3740  response regulator receiver protein  30.84 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  29.25 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0449  response regulator receiver protein  27.2 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00411  chemotaxis protein CheY  29.66 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0144  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 		 1119 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4394  nitrogen regulation protein NR(I)  33.64 
 
 		 469 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4237  nitrogen regulation protein NR(I)  33.64 
 
 		 469 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4216  nitrogen regulation protein NR(I)  33.64 
 
 		 469 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.295301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1751  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.46 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4333  nitrogen regulation protein NR(I)  33.64 
 
 		 469 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1223  response regulator receiver protein  30 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1155  response regulator receiver protein  30 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4505  nitrogen regulation protein NR(I)  32.73 
 
 		 470 aa  61.6  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1570  response regulator receiver protein  30 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.945276 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4287  nitrogen regulation protein NR(I)  33.64 
 
 		 469 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0756679  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03753  fused DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with GlnL: response regulator/sigma54 interaction protein  33.64 
 
 		 469 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4118  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  33.64 
 
 		 469 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4222  nitrogen regulation protein NR(I)  32.73 
 
 		 470 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.327829  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0517  response regulator receiver protein  29.71 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2427  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3962  nitrogen regulation protein NR(I)  32.73 
 
 		 470 aa  61.2  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03702  hypothetical protein  33.64 
 
 		 469 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4390  nitrogen regulation protein NR(I)  33.64 
 
 		 469 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.127215  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  26.77 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4095  nitrogen regulation protein NR(I)  33.64 
 
 		 469 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4159  nitrogen regulation protein NR(I)  32.73 
 
 		 470 aa  61.2  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.086406  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1268  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.19 
 
 		 229 aa  61.2  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4148  nitrogen regulation protein NR(I)  33.64 
 
 		 469 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4344  nitrogen regulation protein NR(I)  33.64 
 
 		 469 aa  61.6  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4253  nitrogen regulation protein NR(I)  33.64 
 
 		 472 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.177692  normal  0.167125 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5314  nitrogen regulation protein NR(I)  33.64 
 
 		 472 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.111299  normal  0.738695 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2710  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.86 
 
 		 704 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325078 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0775  response regulator receiver protein  30.36 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0246849 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1537  response regulator receiver protein  32.65 
 
 		 311 aa  61.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.376192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  31.2 
 
 		 403 aa  60.8  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2294  two component transcriptional regulator  37.72 
 
 		 226 aa  61.2  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000876575  normal  0.575243 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0452  response regulator receiver protein  30.19 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4282  two component LuxR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 217 aa  60.8  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  32.63 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 		 1559 aa  60.8  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0648  response regulator receiver protein  33.8 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 1964 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.370442 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1098  PAS:GGDEF  33.33 
 
 		 705 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  31.03 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0186  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.91 
 
 		 657 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00908915 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  27.2 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 702 aa  60.5  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1506  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.86 
 
 		 704 aa  60.5  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 231 aa  60.1  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0435  response regulator receiver protein  30.7 
 
 		 383 aa  60.1  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>