More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5902 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1307  isopropylmalate isomerase large subunit  79.65 
 
 		 464 aa  781    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5902  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  100 
 
 		 470 aa  977    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3675  isopropylmalate isomerase large subunit  82.21 
 
 		 467 aa  800    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17427 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3742  isopropylmalate isomerase large subunit  63.15 
 
 		 466 aa  634    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3425  isopropylmalate isomerase large subunit  78.88 
 
 		 470 aa  764    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.508475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1982  isopropylmalate isomerase large subunit  65.44 
 
 		 465 aa  624  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.211248  normal  0.733676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1549  isopropylmalate isomerase large subunit  56.1 
 
 		 472 aa  545  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269438  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1961  isopropylmalate isomerase large subunit  55.98 
 
 		 474 aa  544  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4441  isopropylmalate isomerase large subunit  53.52 
 
 		 471 aa  511  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0861  isopropylmalate isomerase large subunit  53.66 
 
 		 471 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1898  isopropylmalate isomerase large subunit  53.28 
 
 		 480 aa  502  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3463  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.86 
 
 		 465 aa  502  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0762821  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2591  isopropylmalate isomerase large subunit  53.23 
 
 		 471 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00933091  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1245  isopropylmalate isomerase large subunit  54.76 
 
 		 477 aa  501  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1983  isopropylmalate isomerase large subunit  53.07 
 
 		 480 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11100  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.92 
 
 		 479 aa  499  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8049  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.53 
 
 		 468 aa  499  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03087  isopropylmalate isomerase large subunit  54.01 
 
 		 466 aa  495  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3334  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.77 
 
 		 472 aa  496  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4707  isopropylmalate isomerase large subunit  53.49 
 
 		 479 aa  497  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0630  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.35 
 
 		 466 aa  496  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1980  isopropylmalate isomerase large subunit  52.65 
 
 		 480 aa  498  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1170  isopropylmalate isomerase large subunit  53.16 
 
 		 478 aa  496  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.910867  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3280  isopropylmalate isomerase large subunit  51.72 
 
 		 467 aa  494  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0626  isopropylmalate isomerase large subunit  52.7 
 
 		 465 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0387  isopropylmalate isomerase large subunit  53.32 
 
 		 468 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0388  isopropylmalate isomerase large subunit  53.1 
 
 		 468 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0795  isopropylmalate isomerase large subunit  51.59 
 
 		 474 aa  493  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0413  isopropylmalate isomerase large subunit  53.32 
 
 		 468 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000169798 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1189  isopropylmalate isomerase large subunit  50.74 
 
 		 472 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4053  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  51.61 
 
 		 474 aa  492  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2149  isopropylmalate isomerase large subunit  51.3 
 
 		 466 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.754808  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0399  isopropylmalate isomerase large subunit  53.32 
 
 		 468 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573464 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3586  isopropylmalate isomerase large subunit  53.66 
 
 		 474 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0194  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.25 
 
 		 469 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3826  isopropylmalate isomerase large subunit  53.36 
 
 		 466 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00074  isopropylmalate isomerase large subunit  52.92 
 
 		 466 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3526  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.92 
 
 		 466 aa  489  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0077  isopropylmalate isomerase large subunit  52.7 
 
 		 466 aa  488  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2316  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.84 
 
 		 487 aa  489  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114053 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3585  isopropylmalate isomerase large subunit  52.7 
 
 		 466 aa  488  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000478946 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0077  isopropylmalate isomerase large subunit  52.92 
 
 		 466 aa  489  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.387894 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0079  isopropylmalate isomerase large subunit  52.92 
 
 		 466 aa  488  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2785  isopropylmalate isomerase large subunit  52.47 
 
 		 468 aa  490  1e-137  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00815  isopropylmalate isomerase large subunit  52.92 
 
 		 466 aa  488  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0066  isopropylmalate isomerase large subunit  52.92 
 
 		 466 aa  489  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1245  isopropylmalate isomerase large subunit  51.6 
 
 		 470 aa  489  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.923179  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1423  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  51.82 
 
 		 473 aa  488  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00073  hypothetical protein  52.92 
 
 		 466 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2938  isopropylmalate isomerase large subunit  52.79 
 
 		 476 aa  491  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0473  isopropylmalate isomerase large subunit  53.36 
 
 		 474 aa  490  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3537  isopropylmalate isomerase large subunit  52.79 
 
 		 476 aa  491  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2129  isopropylmalate isomerase large subunit  54.32 
 
 		 476 aa  488  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4999  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  52.59 
 
 		 470 aa  488  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.653294  normal  0.386887 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3759  isopropylmalate isomerase large subunit  53.45 
 
 		 474 aa  489  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.134544 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3407  isopropylmalate isomerase large subunit  52.79 
 
 		 476 aa  491  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4234  isopropylmalate isomerase large subunit  53.68 
 
 		 474 aa  488  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1573  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.62 
 
 		 493 aa  485  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0240  isopropylmalate isomerase large subunit  51.72 
 
 		 469 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1936  isopropylmalate isomerase large subunit  50.74 
 
 		 478 aa  485  1e-136  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.962808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0075  isopropylmalate isomerase large subunit  52.7 
 
 		 466 aa  485  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0375  isopropylmalate isomerase large subunit  51.81 
 
 		 471 aa  486  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0285  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.5 
 
 		 481 aa  487  1e-136  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0292162  normal  0.428024 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001658  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  52.48 
 
 		 466 aa  486  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3298  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.78 
 
 		 471 aa  486  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405916  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0592  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.27 
 
 		 466 aa  483  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2357  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.29 
 
 		 517 aa  483  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1705  isopropylmalate isomerase large subunit  51.07 
 
 		 468 aa  482  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0785429  hitchhiker  0.00273209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0363  isopropylmalate isomerase large subunit  51.61 
 
 		 468 aa  482  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.271446  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0370  isopropylmalate isomerase large subunit  53.59 
 
 		 474 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0395  isopropylmalate isomerase large subunit  51.63 
 
 		 466 aa  482  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243407 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0185  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.48 
 
 		 468 aa  483  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.08009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3470  isopropylmalate isomerase large subunit  51.63 
 
 		 466 aa  483  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  0.406012 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2225  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.78 
 
 		 471 aa  483  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.918253  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4210  isopropylmalate isomerase large subunit  51.83 
 
 		 471 aa  479  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1887  isopropylmalate isomerase large subunit  49.89 
 
 		 468 aa  479  1e-134  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.574068  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1906  isopropylmalate isomerase large subunit  51.29 
 
 		 469 aa  480  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276241  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09060  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  51.08 
 
 		 471 aa  480  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.918212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1834  isopropylmalate isomerase large subunit  51.29 
 
 		 469 aa  480  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.538456  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4355  isopropylmalate isomerase large subunit  52.26 
 
 		 480 aa  481  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0120  isopropylmalate isomerase large subunit  52.27 
 
 		 466 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0348  isopropylmalate isomerase large subunit  50.86 
 
 		 470 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0214  isopropylmalate isomerase large subunit  52.7 
 
 		 468 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00986239  hitchhiker  0.0021568 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28677  predicted protein  51.29 
 
 		 722 aa  479  1e-134  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0127  isopropylmalate isomerase large subunit  52.27 
 
 		 466 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.03719 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4757  isopropylmalate isomerase large subunit  52.26 
 
 		 469 aa  481  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0504  isopropylmalate isomerase large subunit  50.65 
 
 		 470 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3584  isopropylmalate isomerase large subunit  51.61 
 
 		 468 aa  479  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.931395  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18560  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  51.4 
 
 		 479 aa  481  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.242112  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3797  isopropylmalate isomerase large subunit  51.4 
 
 		 466 aa  481  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0127  isopropylmalate isomerase large subunit  52.27 
 
 		 466 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1228  isopropylmalate isomerase large subunit  51.51 
 
 		 469 aa  479  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896395 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3609  isopropylmalate isomerase large subunit  51.62 
 
 		 466 aa  478  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0849  isopropylmalate isomerase large subunit  52.16 
 
 		 467 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0217  isopropylmalate isomerase large subunit  52.7 
 
 		 468 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1565  isopropylmalate isomerase large subunit  51.39 
 
 		 472 aa  479  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3059  isopropylmalate isomerase large subunit  51.29 
 
 		 469 aa  478  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0123  isopropylmalate isomerase large subunit  52.05 
 
 		 466 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.713431 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0620  isopropylmalate isomerase large subunit  51.84 
 
 		 466 aa  475  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0227  isopropylmalate isomerase large subunit  50.65 
 
 		 473 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>