More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5887 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5887  PfkB domain protein  100 
 
 		 285 aa  592  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784103  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2548  PfkB domain protein  63.41 
 
 		 306 aa  369  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3268  PfkB domain protein  55.43 
 
 		 297 aa  332  6e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.266121 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0505  ribokinase-like domain-containing protein  29.67 
 
 		 285 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000868793  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0357  ribokinase-like domain-containing protein  28.97 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135899  normal  0.412728 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1657  PfkB domain protein  25.78 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.381316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2556  PfkB domain protein  25.78 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5568399999999999e-27 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  27.69 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1113  carbohydrate kinase  24.83 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.173432  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1121  PfkB domain protein  25.35 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000198612  normal  0.396183 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3082  PfkB domain protein  26.09 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.925823  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1357  PfkB domain protein  23.34 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368195  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1382  carbohydrate kinase  22.65 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2948  ribokinase-like domain-containing protein  28.29 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.64332 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2985  carbohydrate kinase, PfkB  25 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0222551  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0143  ribokinase-like domain-containing protein  26.12 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000113671  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3908  PfkB domain protein  25 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00598203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0962  PfkB domain protein  27.38 
 
 		 308 aa  72  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.319235  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1424  PfkB domain protein  26.83 
 
 		 285 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2140  PfkB domain protein  27.43 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  34.51 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1177  carbohydrate kinase  22.89 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0432  ribokinase-like domain-containing protein  23.96 
 
 		 305 aa  68.9  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0011312  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  29.05 
 
 		 403 aa  68.9  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2938  ribokinase-like domain-containing protein  24.73 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000021137  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03165  carbohydrate kinase, PfkB family protein  25.17 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3635  ribokinase-like domain-containing protein  30.83 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.151802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2683  PfkB  24.73 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000599884  normal  0.453356 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3183  PfkB domain protein  25.3 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.203833  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  26.86 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  24.92 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2067  Adenosine kinase  33.33 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0209  PfkB  36.89 
 
 		 311 aa  67  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  29.73 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2945  PfkB domain protein  30.83 
 
 		 298 aa  67  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2791  putative sugar kinase transferase protein  33.05 
 
 		 311 aa  67  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00725009  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1525  PfkB domain protein  21.6 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0913434  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  33.33 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0962  PfkB domain protein  23.23 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0173  PfkB domain protein  31.62 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00145747  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3606  PfkB domain protein  22.97 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  28.35 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  33.33 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0171  carbohydrate kinase  35.85 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.150341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4382  PfkB domain protein  24.74 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  23.59 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  38 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2626  PfkB domain protein  33.9 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000918  2-dehydro-3-deoxygluconate kinase  25.74 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  34.95 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  37.82 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0047  carbohydrate kinase  36 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  24.25 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0398  ribokinase-like domain-containing protein  23.91 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.688788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1084  ribokinase-like domain-containing protein  22.88 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000291332  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  28 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1080  PfkB domain protein  32.54 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  32.69 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1514  PfkB domain protein  26.21 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  34.34 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  29.46 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3036  PfkB domain protein  33.05 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1095  PfkB domain protein  23.66 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.840635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2548  carbohydrate kinase, PfkB  34.23 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.636589  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0279  carbohydrate kinase  23.18 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  30.47 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3963  ribokinase-like domain-containing protein  26.43 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312464 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0207  ribokinase-like domain-containing protein  31.78 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000760585  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0836  PfkB  28.57 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252584  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2782  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  27.91 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6387  ribokinase  31.43 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  29.57 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  29.57 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3450  PfkB domain protein  27.05 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0471  PfkB  38.67 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000138593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  28.21 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3699  PfkB domain protein  23.37 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0255551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0530  carbohydrate kinase, PfkB family  26.17 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00148509  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0688  PfkB domain protein  26.17 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000405539  hitchhiker  0.000110738 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2510  carbohydrate kinase, PfkB  37.21 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  28.21 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0034  PfkB domain protein  31.01 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0204225  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  29.84 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1200  PfkB domain protein  24.61 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.460127  normal  0.0167419 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  29.06 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  26.4 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  28.21 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  28.21 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  32.5 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  28.21 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  26.97 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0225  PfkB domain protein  29.91 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1131  ribokinase-like domain-containing protein  23.26 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4655  ribokinase  29.69 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.557505 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  26.45 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  29.35 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  35.71 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1493  ribokinase-like domain-containing protein  29.41 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  29.46 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>