91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3666 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3666  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 284 aa  589  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0834  cyclase/dehydrase  50.7 
 
 		 269 aa  271  7e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.179759 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1350  cyclase/dehydrase  44.98 
 
 		 238 aa  185  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4497  cyclase/dehydrase  43.62 
 
 		 232 aa  181  8.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6283  cyclase/dehydrase  40.61 
 
 		 240 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000939789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0577  cyclase/dehydrase  39.66 
 
 		 241 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3009  cyclase/dehydrase  42.15 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000149284 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0140  cyclase/dehydrase  39.74 
 
 		 242 aa  168  9e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3430  cyclase/dehydrase  40.17 
 
 		 239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2623  cyclase/dehydrase  38.86 
 
 		 244 aa  165  8e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.502552 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0114  cyclase/dehydrase  45.45 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0413  hypothetical protein  36.61 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.239427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0042  cyclase/dehydrase  46.95 
 
 		 244 aa  155  6e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.64456 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3785  cyclase/dehydrase  37.78 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.720369  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0167  cyclase/dehydrase  46.71 
 
 		 169 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.22431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0123  cyclase/dehydrase  38.81 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.764786 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0307  cyclase/dehydrase  32.96 
 
 		 303 aa  147  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5444  cyclase/dehydrase  45.06 
 
 		 164 aa  145  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252579  normal  0.482853 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3684  cyclase/dehydrase  43.71 
 
 		 219 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0066  cyclase/dehydrase  38.24 
 
 		 198 aa  128  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.364974  normal  0.163087 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1322  cyclase/dehydrase  31.8 
 
 		 237 aa  125  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3397  Polyketide cyclase/dehydrase  32.52 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3664  hypothetical protein  40.67 
 
 		 214 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.321126 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5344  cyclase/dehydrase  39.74 
 
 		 187 aa  112  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3832  cyclase/dehydrase  34.83 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.341531 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3103  hypothetical protein  35.39 
 
 		 212 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1111  cyclase/dehydrase  34.67 
 
 		 162 aa  95.9  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0994  cyclase/dehydrase  35.33 
 
 		 164 aa  95.5  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.864114  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3216  cyclase/dehydrase  34.93 
 
 		 162 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1044  cyclase/dehydrase  34 
 
 		 272 aa  87.4  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.214991  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0978  cyclase/dehydrase  33.78 
 
 		 151 aa  87.8  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2639  cyclase/dehydrase  34.1 
 
 		 162 aa  85.9  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.697167  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4844  cyclase/dehydrase  30.11 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.327815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3967  cyclase/dehydrase  30.67 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3412  cyclase/dehydrase  29.61 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1407  cyclase/dehydrase  31.97 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0007  cyclase/dehydrase  32.21 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3678  cyclase/dehydrase  30.67 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3665  cyclase/dehydrase  30.2 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.961718 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0957  cyclase/dehydrase  29.33 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1015  cyclase/dehydrase  30.14 
 
 		 159 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0343567  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1801  cyclase/dehydrase  30.41 
 
 		 205 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0812  cyclase/dehydrase  31.13 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1003  cyclase/dehydrase  30.67 
 
 		 156 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109283  decreased coverage  0.00240737 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1527  cyclase/dehydrase  31.94 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.626943  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1018  cyclase/dehydrase  29.45 
 
 		 159 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.665706  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6247  hypothetical protein  32.09 
 
 		 131 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.69241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0103  cyclase/dehydrase  29.25 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1093  cyclase/dehydrase  29.22 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0659  cyclase/dehydrase  25.85 
 
 		 158 aa  60.8  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.913891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15860  polyketide cyclase / dehydrase family protein  34.41 
 
 		 156 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00215892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6540  cyclase/dehydrase  30.41 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472702  normal  0.0557794 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4854  cyclase/dehydrase  27.11 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7248  integral membrane protein-like protein  30.87 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1740  cyclase/dehydrase  27.4 
 
 		 153 aa  58.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.294422  decreased coverage  0.000862073 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0825  cyclase/dehydrase  29.33 
 
 		 152 aa  58.5  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.987427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1754  cyclase/dehydrase  28.57 
 
 		 153 aa  58.9  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1310  cyclase/dehydrase  28.67 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48096  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1483  putative integral membrane protein  30.5 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.77346  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2801  cyclase/dehydrase  30.82 
 
 		 145 aa  57  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0725635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01881  putative integral membrane protein  30.5 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.560201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0245  cyclase/dehydrase  30.43 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26201  putative integral membrane protein  30.2 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.52339 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2374  cyclase/dehydrase  30.7 
 
 		 336 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361241  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2380  cyclase/dehydrase  30.7 
 
 		 335 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0297  cyclase/dehydrase  29.68 
 
 		 210 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2333  cyclase/dehydrase  30.7 
 
 		 335 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.234929  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3433  cyclase/dehydrase  27.21 
 
 		 155 aa  53.1  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151513  hitchhiker  0.00285229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6854  integral membrane protein-like protein  30.17 
 
 		 394 aa  52.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4115  hypothetical protein  46.43 
 
 		 112 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3381  cyclase/dehydrase  29.63 
 
 		 416 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0790  hypothetical protein  37.29 
 
 		 86 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.124535 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37514  predicted protein  28.26 
 
 		 153 aa  51.6  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.458024 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3917  hypothetical protein  36.23 
 
 		 126 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.587105  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1568  hypothetical protein  52.08 
 
 		 126 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.858282  hitchhiker  0.00451485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3895  hypothetical protein  45.45 
 
 		 113 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1315  Polyketide cyclase/dehydrase  29.84 
 
 		 144 aa  49.3  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3131  hypothetical protein  30.16 
 
 		 116 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36490  hypothetical protein  30.97 
 
 		 116 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00849453  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4789  cyclase/dehydrase  29.93 
 
 		 147 aa  48.5  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.799233  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2685  cyclase/dehydrase  29.25 
 
 		 149 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3431  cyclase/dehydrase  29.25 
 
 		 149 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01281  putative integral membrane protein  25.35 
 
 		 156 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.49008  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01311  putative integral membrane protein  26.24 
 
 		 156 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01321  putative integral membrane protein  26.24 
 
 		 156 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0117  putative integral membrane protein  24.82 
 
 		 156 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0678  cyclase/dehydrase  28.57 
 
 		 148 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2355  hypothetical protein  26.85 
 
 		 145 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1394  hypothetical protein  37.1 
 
 		 125 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2865  cyclase/dehydrase  25.33 
 
 		 143 aa  43.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3290  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  25.23 
 
 		 602 aa  42.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>