12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1568 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1568  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  251  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.858282  hitchhiker  0.00451485 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3917  hypothetical protein  87.3 
 
 		 126 aa  225  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.587105  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1394  hypothetical protein  57.26 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3895  hypothetical protein  49 
 
 		 113 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4115  hypothetical protein  42.72 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36490  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00849453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3131  hypothetical protein  35.8 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2191  hypothetical protein  39.66 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0112954  hitchhiker  0.00262939 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3666  cyclase/dehydrase  52.08 
 
 		 284 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2299  hypothetical protein  34.69 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0791934  hitchhiker  0.0000121516 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2623  cyclase/dehydrase  32.33 
 
 		 244 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.502552 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3785  cyclase/dehydrase  37.31 
 
 		 223 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.720369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>