10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1394 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1394  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  248  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3917  hypothetical protein  58.06 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.587105  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1568  hypothetical protein  57.26 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.858282  hitchhiker  0.00451485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3895  hypothetical protein  49.54 
 
 		 113 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4115  hypothetical protein  50.52 
 
 		 112 aa  105  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36490  hypothetical protein  32.5 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00849453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3131  hypothetical protein  32.5 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2191  hypothetical protein  39.62 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0112954  hitchhiker  0.00262939 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2299  hypothetical protein  33.68 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0791934  hitchhiker  0.0000121516 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3666  cyclase/dehydrase  37.1 
 
 		 284 aa  43.5  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470859  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>