10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2299 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2299  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  240  5e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0791934  hitchhiker  0.0000121516 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36490  hypothetical protein  36.94 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00849453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3131  hypothetical protein  44.58 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3895  hypothetical protein  35.05 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4115  hypothetical protein  36.17 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3917  hypothetical protein  30.53 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.587105  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1568  hypothetical protein  34.69 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.858282  hitchhiker  0.00451485 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1394  hypothetical protein  38.64 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0307  cyclase/dehydrase  39.34 
 
 		 303 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3014  metallothionein  76.19 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.797789 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>