14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3014 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3014  metallothionein  100 
 
 		 76 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.797789 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2649  metallothionein  76.32 
 
 		 76 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3262  metallothionein, putative  77.63 
 
 		 74 aa  123  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2499  metallothionein family protein  77.63 
 
 		 74 aa  123  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36890  putative metallothionein  53.16 
 
 		 79 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0397496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3171  putative metallothionein  51.9 
 
 		 79 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0861  metallothionein family 14  42 
 
 		 57 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0149  metallothionein, family protein  44 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2545  metallothionein family 14  44 
 
 		 55 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0887  metallothionein family 14  40 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.797466 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3764  metallothionein, putative  39.62 
 
 		 55 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2299  hypothetical protein  76.19 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0791934  hitchhiker  0.0000121516 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5147  metallothionein family protein  45.65 
 
 		 57 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2070  metallothionein family protein  47.83 
 
 		 58 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106237  hitchhiker  0.00805122 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>