12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3917 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3917  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  251  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.587105  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1568  hypothetical protein  87.3 
 
 		 126 aa  225  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.858282  hitchhiker  0.00451485 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1394  hypothetical protein  58.06 
 
 		 125 aa  130  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3895  hypothetical protein  50 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4115  hypothetical protein  43.27 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36490  hypothetical protein  30.21 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00849453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3131  hypothetical protein  33.75 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2191  hypothetical protein  39.66 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0112954  hitchhiker  0.00262939 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3666  cyclase/dehydrase  36.23 
 
 		 284 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2299  hypothetical protein  30.53 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0791934  hitchhiker  0.0000121516 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3785  cyclase/dehydrase  33.7 
 
 		 223 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.720369  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2623  cyclase/dehydrase  30 
 
 		 244 aa  41.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.502552 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>