33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3370 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3370  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 		 263 aa  541  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1970  protein of unknown function DUF1080  69.58 
 
 		 260 aa  382  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0676  protein of unknown function DUF1080  33.54 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  31.3 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  34.62 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  31.13 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  31.79 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  31.58 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1017  protein of unknown function DUF1080  32.77 
 
 		 786 aa  74.7  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0838366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0038  protein of unknown function DUF1080  31.9 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  29.76 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00436  putative multi-domain protein  30.64 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  28.81 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  33.12 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3796  protein of unknown function DUF1080  32.52 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2130  protein of unknown function DUF1080  26.4 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0703426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6272  protein of unknown function DUF1080  28.43 
 
 		 482 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000049717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  29.69 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3945  protein of unknown function DUF1080  28 
 
 		 540 aa  62.4  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3044  hypothetical protein  27.82 
 
 		 352 aa  62  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  29.68 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  26.41 
 
 		 241 aa  54.7  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3235  protein of unknown function DUF1080  29.35 
 
 		 595 aa  52.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0080488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2206  protein of unknown function DUF1080  29 
 
 		 478 aa  51.6  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  30.06 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  27.27 
 
 		 193 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1879  protein of unknown function DUF1080  30.4 
 
 		 629 aa  49.7  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.985217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  24.84 
 
 		 1145 aa  49.3  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  23.32 
 
 		 451 aa  45.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  26.57 
 
 		 230 aa  43.5  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  25.61 
 
 		 1140 aa  43.5  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4772  protein of unknown function DUF1080  27.98 
 
 		 628 aa  42  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  25.28 
 
 		 247 aa  42  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>