158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3334 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  100 
 
 		 349 aa  705    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  36.17 
 
 		 353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1435  Beta-lactamase  31.38 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1607  Beta-lactamase  33.11 
 
 		 291 aa  136  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3523  Beta-lactamase  29.11 
 
 		 338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0788  beta-lactamase  33.58 
 
 		 418 aa  123  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0174  Beta-lactamase  33.23 
 
 		 388 aa  122  6e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1460  Beta-lactamase  30.9 
 
 		 334 aa  119  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00829053 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0183  Beta-lactamase  30.93 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2728  Beta-lactamase  29.59 
 
 		 299 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0079236  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  29.77 
 
 		 425 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  30.56 
 
 		 436 aa  99.4  8e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2102  twin-arginine translocation pathway signal  30.24 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0733882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2148  Beta-lactamase  30.24 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748404  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  29.77 
 
 		 425 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2085  Beta-lactamase  30.12 
 
 		 296 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11921 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  26.3 
 
 		 424 aa  97.4  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1390  Beta-lactamase  27.76 
 
 		 289 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585114  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4360  Beta-lactamase  28.52 
 
 		 297 aa  96.3  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000108699  unclonable  0.00000562292 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1080  Beta-lactamase  25.91 
 
 		 301 aa  96.3  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0392714  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5358  Beta-lactamase  27.03 
 
 		 312 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000938331  normal  0.124933 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2552  Beta-lactamase  25.67 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802917  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4929  Beta-lactamase  27.03 
 
 		 312 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432948  normal  0.0487719 
 
 
 
NC_010814  Glov_2580  Beta-lactamase  25 
 
 		 300 aa  94.4  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000559373  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4877  Beta-lactamase  27.18 
 
 		 297 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00066031  hitchhiker  0.000000000265752 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2352  Beta-lactamase  27.2 
 
 		 297 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445844 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  27.14 
 
 		 442 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0762  Beta-lactamase  27.82 
 
 		 315 aa  92.8  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0608621  hitchhiker  0.000417556 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4574  Beta-lactamase  29.04 
 
 		 303 aa  92.8  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1011  beta-lactamase  26.67 
 
 		 290 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0978  Beta-lactamase  26.32 
 
 		 304 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2749  Beta-lactamase  24.24 
 
 		 281 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2827  Beta-lactamase  24.24 
 
 		 281 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.940774  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2328  Beta-lactamase  30.09 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1529  Beta-lactamase  30.09 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2820  Beta-lactamase  26.42 
 
 		 289 aa  90.1  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.893397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0594  Beta-lactamase  25.76 
 
 		 296 aa  89.4  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.272363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0446  Beta-lactamase  26.6 
 
 		 297 aa  89  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  25.91 
 
 		 440 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0003  beta-lactamase  23.91 
 
 		 281 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000347481  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4439  putative Beta-lactamase  26.01 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0855  Beta-lactamase  25.98 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689397  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  27.83 
 
 		 300 aa  87  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4021  Beta-lactamase  28.08 
 
 		 296 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06370  beta-lactamase  22.92 
 
 		 283 aa  86.7  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4082  Beta-lactamase  34.58 
 
 		 292 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0136649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  25.41 
 
 		 468 aa  86.3  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  26.53 
 
 		 375 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  28.85 
 
 		 296 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001392  beta-lactamase  23.84 
 
 		 283 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000730239  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3438  Beta-lactamase  25.68 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000252783  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  27 
 
 		 576 aa  85.1  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0366  Beta-lactamase  26.12 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0385843  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  27.11 
 
 		 423 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  25.77 
 
 		 508 aa  82.8  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0228  twin-arginine translocation pathway signal  26.71 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1684  Beta-lactamase  25.67 
 
 		 312 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132046  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0351  beta-lactamase  25.34 
 
 		 296 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.154712 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3104  beta-lactamase  26.04 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156614  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3231  Beta-lactamase  25.44 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4009  Beta-lactamase  27.92 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1169  Beta-lactamase class A-like protein  25.99 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  23.92 
 
 		 504 aa  77  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  25.16 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0997  Beta-lactamase  26.65 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2553  beta-lactamase  25.43 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1381  class A beta-lactamase  25.43 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0489957  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1435  Beta-lactamase  25.99 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1450  class A beta-lactamase precursor  24.72 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1301  class A beta-lactamase  25.43 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0195  Beta-lactamase  24.05 
 
 		 288 aa  75.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.210334  normal  0.167544 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3689  Beta-lactamase  25.62 
 
 		 302 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248785  normal  0.574937 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1164  Beta-lactamase  25.34 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590965  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1461  beta-lactamase  23.1 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000606935  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1283  class A beta-lactamase  25.09 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.162345  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0257  class A beta-lactamase  25.09 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0527  class A beta-lactamase  25.09 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.29059  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1040  class A beta-lactamase  25.09 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.257126  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2215  beta-lactamase  25.58 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296886  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6176  beta-lactamase  26.26 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0566092 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1931  Beta-lactamase  27.11 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0088  Beta-lactamase  23.74 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.748085 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0046  beta-lactamase TEM  26.04 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00171312  normal  0.356541 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1580  beta-lactamase TEM  26.04 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.262835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0130  beta-lactamase TEM  26.04 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3136  Beta-lactamase  28.74 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570574  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5163  Beta-lactamase  24.91 
 
 		 322 aa  67  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0157119 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  28.46 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  26.72 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5713  beta-lactamase  28 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1457  Beta-lactamase  25 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.249297 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12104  class A beta-lactamase blaC  24.75 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0108435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0725  Beta-lactamase class A-like protein  31.07 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.725916  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2862  beta-lactamase  22.71 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0320845 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2229  Beta-lactamase  25.63 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0753416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1418  Beta-lactamase  24.64 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732214  hitchhiker  0.0000172267 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  25.08 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5706  Beta-lactamase  22.9 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338924  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2328  beta-lactamase  22.92 
 
 		 301 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.641353  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2507  beta-lactamase  22.92 
 
 		 309 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>