80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2889 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2889  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 137 aa  258  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6733  protein of unknown function DUF6 transmembrane  86.03 
 
 		 137 aa  206  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.613409 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  77.37 
 
 		 138 aa  204  5e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0533623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6961  protein of unknown function DUF6 transmembrane  83.82 
 
 		 137 aa  197  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.915321  normal  0.0744442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  69.12 
 
 		 137 aa  189  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  normal  0.349029 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0514  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.62 
 
 		 144 aa  157  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000118881  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1234  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.2 
 
 		 138 aa  156  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1494  hypothetical protein  54.41 
 
 		 137 aa  153  9e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.140947  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2739  hypothetical protein  53.68 
 
 		 138 aa  151  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00174572  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1170  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.08 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1399  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  53.68 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.126576  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  48.15 
 
 		 293 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1410  integral membrane protein  51.47 
 
 		 140 aa  127  5.0000000000000004e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.94 
 
 		 137 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.26 
 
 		 137 aa  121  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0186  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.11 
 
 		 287 aa  120  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405902  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1628  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.67 
 
 		 143 aa  120  8e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000213352  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4312  hypothetical protein  47.76 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2296  hypothetical protein  47.76 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0939818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7598  hypothetical protein  47.01 
 
 		 145 aa  114  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182206 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3005  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.53 
 
 		 145 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0762  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.26 
 
 		 145 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363429  normal  0.0593189 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4036  hypothetical protein  51.49 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513536  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0799  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.26 
 
 		 145 aa  111  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0780249  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0839  hypothetical protein  49.26 
 
 		 145 aa  111  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.168462  normal  0.579461 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1213  hypothetical protein  47.01 
 
 		 142 aa  111  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3491  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.51 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3118  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.32 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2587  hypothetical protein  51.22 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4563  hypothetical protein  50.75 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1266  hypothetical protein  44.44 
 
 		 141 aa  105  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1304  hypothetical protein  44.44 
 
 		 142 aa  105  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5645  hypothetical protein  46.27 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1879  hypothetical protein  44.44 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1192  hypothetical protein  44.03 
 
 		 139 aa  101  4e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0103  hypothetical protein  45.52 
 
 		 144 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.22 
 
 		 160 aa  99.8  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4041  hypothetical protein  45.76 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.579736 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3006  hypothetical protein  45.76 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0319253 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4976  hypothetical protein  45.76 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379016  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0532  transporter, EamA family  41.18 
 
 		 142 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0462  transporter, EamA family  41.18 
 
 		 142 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0531  EamA family protein  41.18 
 
 		 142 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0404  EamA family protein  41.18 
 
 		 142 aa  98.2  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0395  DMT family permease  41.18 
 
 		 142 aa  98.2  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0391  DMT family permease  41.18 
 
 		 142 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0416  eama family protein  41.18 
 
 		 142 aa  98.2  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4058  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.44 
 
 		 145 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0403  hypothetical protein  42.02 
 
 		 142 aa  97.1  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0396  hypothetical protein  40.34 
 
 		 142 aa  97.1  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0481  transporter, EamA family  41.18 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4842  transporter, EamA family  41.18 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3577  hypothetical protein  44.85 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.019406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4283  hypothetical protein  45.95 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0785264 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1565  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.07 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1101  integral membrane protein  44.85 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000297409  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1154  hypothetical protein  44.12 
 
 		 142 aa  94.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104519  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1124  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.27 
 
 		 142 aa  94.4  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00709741  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0476  hypothetical protein  43.7 
 
 		 146 aa  94  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50 
 
 		 145 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.429085  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6234  hypothetical protein  47.46 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4487  hypothetical protein  45.61 
 
 		 145 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.61 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71880  hypothetical protein  46.61 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1757  hypothetical protein  47.66 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0344568  normal  0.0517722 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0568  hypothetical protein  36.44 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.134019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.94 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  29.77 
 
 		 287 aa  44.3  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2052  hypothetical protein  29.73 
 
 		 290 aa  43.5  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00300116  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0999  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.77 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1323  hypothetical protein  26.12 
 
 		 291 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000201955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1359  hypothetical protein  28.8 
 
 		 159 aa  41.6  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.31 
 
 		 293 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  29.46 
 
 		 302 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0359  hypothetical protein  41.27 
 
 		 278 aa  41.6  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  29.46 
 
 		 302 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0225  hypothetical protein  36.92 
 
 		 364 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490189  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2949  hypothetical protein  32.35 
 
 		 290 aa  40.4  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0043  hypothetical protein  31.53 
 
 		 296 aa  40.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.355426  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0229  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.92 
 
 		 285 aa  40  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>