More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2576 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2576  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
406 aa  827    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.731131  normal  0.452849 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2777  glycosyl transferase group 1  43.92 
 
 
406 aa  322  9.000000000000001e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.176315 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0039  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
399 aa  216  8e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  26.65 
 
 
703 aa  135  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0126  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
699 aa  124  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.699661  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4197  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
846 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.06 
 
 
443 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0310  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.06 
 
 
643 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2403  glycosyl transferase, group 1  25.55 
 
 
828 aa  107  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0259  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 
643 aa  106  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158733  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0340  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.74 
 
 
643 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0325  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.1 
 
 
643 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0347044  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  29.7 
 
 
1247 aa  100  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2306  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
461 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0305  hypothetical protein  34.88 
 
 
423 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  21.78 
 
 
1264 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1502  glycosyltransferase  21.79 
 
 
379 aa  77  0.0000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3551  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.185108  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5687  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
765 aa  73.6  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  25.39 
 
 
398 aa  73.2  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 
361 aa  69.3  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 
374 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2867  glycosyl transferase, group 1  27.55 
 
 
415 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  24.75 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0144  glycosyltransferase-like protein  21.67 
 
 
368 aa  67.4  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 
412 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1374  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase protein  29.32 
 
 
344 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  31.47 
 
 
403 aa  66.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.85 
 
 
419 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 
376 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1503  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  26.21 
 
 
354 aa  65.5  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1453  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  26.21 
 
 
354 aa  65.5  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 
403 aa  65.5  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
373 aa  64.7  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 
412 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 
378 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 
374 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  36.51 
 
 
385 aa  63.9  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0304  putative glycosyl transferase  21.25 
 
 
426 aa  63.5  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  34.13 
 
 
378 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 
386 aa  63.5  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0042  glycosyl transferase, group 1  29.48 
 
 
344 aa  63.2  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5739  putative glycosyl transferase  28.36 
 
 
378 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 
353 aa  62  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0529  glycosyl transferase, group 1  29.81 
 
 
376 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.61936  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  31.33 
 
 
376 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1792  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 
365 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 
385 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 
392 aa  61.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0007  glycosyl transferase, group 1  26.01 
 
 
1236 aa  60.8  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66160  putative glycosyl transferase  27.47 
 
 
378 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266324  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  23.9 
 
 
346 aa  60.1  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4244  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 
407 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1045  group 1 glycosyl transferase  30.41 
 
 
353 aa  59.3  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000151909  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26.53 
 
 
394 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
384 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  26.87 
 
 
364 aa  58.9  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44790  Glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 
386 aa  58.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1661  glycosyl transferase group 1  22.26 
 
 
340 aa  58.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.781616  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3847  glycosyl transferase, group 1  25.1 
 
 
360 aa  57.8  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  25.64 
 
 
387 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 
378 aa  57.8  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2418  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 
396 aa  57  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0392541  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  28.92 
 
 
391 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2117  glycosyl transferase, group 1  25.54 
 
 
362 aa  57.4  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  21.33 
 
 
745 aa  57  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4075  glycosyl transferase, group 1  27.73 
 
 
744 aa  57  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 
364 aa  56.6  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 
390 aa  56.6  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  24.22 
 
 
384 aa  56.6  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0984  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 
403 aa  56.6  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137415 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  30.1 
 
 
401 aa  56.6  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  24.64 
 
 
379 aa  56.6  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1540  glycosyl transferase, group 1  28.68 
 
 
414 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  24.28 
 
 
400 aa  56.2  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 
750 aa  56.2  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4991  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.57 
 
 
376 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  25.51 
 
 
355 aa  55.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  27.55 
 
 
387 aa  55.8  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  32.46 
 
 
389 aa  55.8  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2977  glycosyl transferase group 1  22.85 
 
 
352 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.179436  normal  0.153707 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 
392 aa  55.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  25.19 
 
 
349 aa  55.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.98 
 
 
375 aa  55.5  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.4 
 
 
390 aa  55.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0365  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
387 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1517  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
408 aa  55.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 
468 aa  55.5  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
362 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003535  glycosyltransferase  25.36 
 
 
394 aa  55.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 
411 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0763  glycosyl transferase, group 1  25.97 
 
 
364 aa  55.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0143067 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2716  glycosyl transferase group 1  22.47 
 
 
352 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  32.81 
 
 
388 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  21.92 
 
 
408 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  29.5 
 
 
413 aa  54.3  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1122  glycosyl transferase, group 1  31.15 
 
 
381 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0032  glycosyl transferase, group 1  28.78 
 
 
344 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  33.73 
 
 
803 aa  54.7  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 
377 aa  54.7  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>