More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_19130 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_19130  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 110 aa  216  7e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3553  regulatory protein, ArsR  67.27 
 
 		 110 aa  137  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2881  transcriptional regulator, ArsR family  64.36 
 
 		 118 aa  127  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0102206 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3252  regulatory protein ArsR  62.73 
 
 		 110 aa  127  6e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0479  transcriptional regulator, ArsR family  60.55 
 
 		 114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.741609  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0485  putative transcriptional regulator, ArsR family  59.63 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2519  regulatory protein ArsR  60.4 
 
 		 121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3317  regulatory protein, ArsR  59.41 
 
 		 118 aa  113  8.999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0899623 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3039  regulatory protein, ArsR  57.41 
 
 		 119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5359  ArsR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 108 aa  107  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5449  ArsR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 108 aa  107  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5737  ArsR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 108 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812377  normal  0.303432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2780  putative transcriptional regulator, ArsR family  54.13 
 
 		 116 aa  101  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.258272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30170  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 148 aa  90.9  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.758763  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5296  regulatory protein ArsR  41.18 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891098  normal  0.548159 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  38.3 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  34 
 
 		 115 aa  72  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2820  transcriptional regulator, ArsR family  41.58 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  39.6 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  36.27 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  39.77 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  37.25 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  39.77 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  42 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  35.45 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  39.33 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  37.86 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  38.46 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  40.2 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  37.23 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  36.27 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 145 aa  67  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 114 aa  67  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  38.89 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  40.43 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2365  ArsR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291211  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2326  ArsR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.323993  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  38.89 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2373  ArsR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  35.64 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0955  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3704  transcriptional regulator, ArsR family  37 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772956  normal  0.469506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1168  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.590716  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1141  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1158  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1041  MarR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  29.79 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  33.66 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  31.25 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  37.25 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5112  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  50 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  29.79 
 
 		 108 aa  62  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  30.53 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  33.94 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0788  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  29.79 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  34.74 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1019  transcriptional regulator, ArsR family  43.24 
 
 		 250 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736024 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 107 aa  60.1  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  30.3 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  31.91 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0866  transcriptional regulator, ArsR family  40.96 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129477  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  31.18 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0985  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.326764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  33.73 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  33.73 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5370  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  33.73 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  33.73 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0693  regulatory protein, ArsR  35.48 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273557 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>