40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3457 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3457  Ig domain-containing protein  100 
 
 		 829 aa  1665    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3807  Ig domain-containing protein  68.53 
 
 		 837 aa  1114    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0531  Ig domain-containing protein  71.39 
 
 		 834 aa  1141    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3633  Ig domain-containing protein  95.66 
 
 		 829 aa  1599    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0592  Ig domain-containing protein  73.25 
 
 		 840 aa  1204    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3723  Ig domain-containing protein  54.96 
 
 		 826 aa  828    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00549605  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0510  Ig domain-containing protein  77.92 
 
 		 836 aa  1286    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0570  Ig domain-containing protein  60.42 
 
 		 851 aa  862    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.131384 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0493  Ig domain-containing protein  96.14 
 
 		 829 aa  1603    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4390  Ig domain-containing protein  54 
 
 		 843 aa  753    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3069  hypothetical protein  55.3 
 
 		 830 aa  838    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0536  Ig domain protein group 1 domain protein  77.33 
 
 		 836 aa  1262    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4080  hypothetical protein  80.05 
 
 		 826 aa  1317    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3742  Ig domain-containing protein  54.52 
 
 		 851 aa  796    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0191  Ig-like, group 1  39.92 
 
 		 811 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000536098  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1320  Ig-like, group 1  33.11 
 
 		 821 aa  253  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00729266  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1853  Ig domain protein group 1 domain protein  34.62 
 
 		 817 aa  242  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.498276  hitchhiker  0.000000271075 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1533  Ig domain-containing protein  39.83 
 
 		 807 aa  239  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000967383  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2663  Ig-like, group 1  33.77 
 
 		 638 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158035 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4101  Ig domain-containing protein  35.62 
 
 		 676 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2226  Ig domain-containing protein  37.61 
 
 		 819 aa  231  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2480  Ig domain-containing protein  33.33 
 
 		 820 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311981  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2330  Ig-like, group 1  32.44 
 
 		 818 aa  210  7e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1195  intimin/invasin family protein  31.15 
 
 		 878 aa  210  7e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2252  Ig domain-containing protein  33.75 
 
 		 851 aa  209  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124017  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2843  Ig domain-containing protein  32.62 
 
 		 838 aa  208  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000356214  decreased coverage  0.00000000529133 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1801  Ig domain-containing protein  30.95 
 
 		 837 aa  204  6e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716764  hitchhiker  0.0000241302 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2611  Ig domain-containing protein  28.25 
 
 		 1209 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062709 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2491  Ig domain-containing protein  28.25 
 
 		 1209 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2498  Ig domain-containing protein  33.9 
 
 		 835 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284109  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0314  hypothetical protein  31.17 
 
 		 651 aa  185  3e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.358502  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1949  invasin domain-containing protein  28.4 
 
 		 1237 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0783  hypothetical protein  33.58 
 
 		 476 aa  167  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.628796  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1727  Ig domain-containing protein  26.74 
 
 		 1224 aa  156  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1583  Ig domain-containing protein  26.49 
 
 		 1224 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.61768  normal  0.0651551 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1658  Ig domain-containing protein  26.49 
 
 		 1224 aa  154  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377498  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2695  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit, glutamine-dependent  32.13 
 
 		 366 aa  119  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000319474  decreased coverage  0.000345849 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0677  hypothetical protein  35.97 
 
 		 638 aa  110  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0935  hypothetical protein  33.88 
 
 		 498 aa  61.6  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.421015  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3639  LigA  21.65 
 
 		 948 aa  44.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>