72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1777 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  743    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  99.45 
 
 		 361 aa  739    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  96.68 
 
 		 361 aa  674    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  80.88 
 
 		 346 aa  526  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  72.73 
 
 		 365 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  72.41 
 
 		 365 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  72.41 
 
 		 365 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  72.56 
 
 		 365 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  72.56 
 
 		 365 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  65.38 
 
 		 354 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  54.97 
 
 		 329 aa  334  2e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  50.62 
 
 		 372 aa  328  8e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  55.7 
 
 		 329 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  49.85 
 
 		 417 aa  325  9e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  51.88 
 
 		 338 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  53.8 
 
 		 334 aa  300  3e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  49.09 
 
 		 342 aa  281  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  39.26 
 
 		 318 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  35.24 
 
 		 327 aa  193  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  39.06 
 
 		 317 aa  189  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  33.23 
 
 		 337 aa  189  7e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  40.31 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  34.26 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  34.58 
 
 		 323 aa  182  7e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  36.31 
 
 		 318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  31.87 
 
 		 349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  34.7 
 
 		 326 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  29.63 
 
 		 339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  29.93 
 
 		 353 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1675  hypothetical protein  28.07 
 
 		 353 aa  120  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  33.12 
 
 		 323 aa  113  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  28.98 
 
 		 374 aa  113  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  30.23 
 
 		 321 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  25.75 
 
 		 316 aa  110  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  24.92 
 
 		 316 aa  106  8e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  28.35 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  29.69 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  30.13 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  27.33 
 
 		 357 aa  97.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  27.33 
 
 		 357 aa  97.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  25.48 
 
 		 344 aa  92.8  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  26.83 
 
 		 315 aa  90.5  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  27.3 
 
 		 344 aa  90.1  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  28.66 
 
 		 352 aa  89.7  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  26.89 
 
 		 316 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  27.67 
 
 		 323 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  30.09 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  27.95 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  28.66 
 
 		 355 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  28.27 
 
 		 372 aa  82.8  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  25.33 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  27.11 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  27.11 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  26.59 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  26.59 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  27.17 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  27.78 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  25.68 
 
 		 337 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  27.52 
 
 		 339 aa  72  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  26.69 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  25.5 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  25.61 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  26.56 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2913  hypothetical protein  26.71 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  27.08 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  26.71 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  24.42 
 
 		 428 aa  56.2  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  23.21 
 
 		 412 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  24.47 
 
 		 943 aa  50.4  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2053  hypothetical protein  32.17 
 
 		 263 aa  49.3  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0403432  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  20.07 
 
 		 294 aa  43.5  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  22.75 
 
 		 419 aa  43.1  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>