More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1153 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1153  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 181 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1224  isochorismatase hydrolase  99.45 
 
 		 181 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1154  isochorismatase hydrolase  97.24 
 
 		 181 aa  367  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.399552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  58.62 
 
 		 194 aa  211  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  58.33 
 
 		 180 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  53.89 
 
 		 180 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  53.89 
 
 		 180 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  53.89 
 
 		 180 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1927  isochorismatase hydrolase  50.88 
 
 		 172 aa  175  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.110403  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  40.7 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  38.95 
 
 		 176 aa  135  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  39.53 
 
 		 176 aa  134  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  38.37 
 
 		 176 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  38.37 
 
 		 176 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  38.37 
 
 		 176 aa  132  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  38.37 
 
 		 174 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  38.37 
 
 		 359 aa  130  9e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  38.37 
 
 		 359 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2701  isochorismatase  38.18 
 
 		 168 aa  122  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1403  isochorismatase hydrolase  40.68 
 
 		 175 aa  122  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0251  isochorismatase family protein  38.6 
 
 		 176 aa  121  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  38.86 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5659  isochorismatase hydrolase  41.24 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.616311  normal  0.236437 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3564  isochorismatase hydrolase  41.32 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2188  isochorismatase hydrolase  38.8 
 
 		 186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  38.8 
 
 		 186 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2135  isochorismatase hydrolase  41.67 
 
 		 177 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3421  isochorismatase hydrolase  39.66 
 
 		 176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1652  isochorismatase hydrolase  36.42 
 
 		 173 aa  108  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1174  isochorismatase hydrolase  37.28 
 
 		 216 aa  105  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.910338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2716  isochorismatase hydrolase  30.17 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1721  isochorismatase hydrolase  38.92 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1847  isochorismatase hydrolase  38.61 
 
 		 177 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.614848  hitchhiker  0.00000933231 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0547  amidase  33.94 
 
 		 161 aa  103  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145331  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2926  isochorismatase family protein  39.49 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0419  isochorismatase hydrolase  36.87 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0445  isochorismatase hydrolase  35.75 
 
 		 183 aa  100  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1656  isochorismatase  36.36 
 
 		 186 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3597  isochorismatase family protein  37.58 
 
 		 237 aa  98.2  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3602  isochorismatase hydrolase  35.8 
 
 		 183 aa  98.2  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.865119 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3689  isochorismatase family protein  36.97 
 
 		 186 aa  97.8  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1711  isochorismatase family protein  36.36 
 
 		 186 aa  97.4  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.08395  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1431  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 164 aa  97.8  8e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1508  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 		 186 aa  97.4  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0670  isochorismatase family protein  37.58 
 
 		 183 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0508  isochorismatase family protein  37.58 
 
 		 183 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.537066  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3608  isochorismatase family protein  37.58 
 
 		 237 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2589  isochorismatase hydrolase  34.08 
 
 		 183 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0966  isochorismatase family protein  37.58 
 
 		 183 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.145103  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1936  isochorismatase family protein  37.58 
 
 		 183 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0515  isochorismatase hydrolase  34.08 
 
 		 183 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0487  isochorismatase hydrolase  34.08 
 
 		 183 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.972949 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1761  isochorismatase family protein  35.76 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3583  isochorismatase family protein  37.58 
 
 		 183 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.46144  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2883  isochorismatase hydrolase  35.75 
 
 		 183 aa  95.1  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226746  normal  0.142757 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1466  isochorismatase  36.36 
 
 		 186 aa  94.7  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1688  isochorismatase family protein  36.36 
 
 		 186 aa  94.4  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1504  isochorismatase family protein  36.36 
 
 		 186 aa  94  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1476  isochorismatase  36.36 
 
 		 186 aa  94  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.731816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1620  isochorismatase family protein  36.36 
 
 		 186 aa  94  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  33.95 
 
 		 231 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  33.95 
 
 		 231 aa  89  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  33.54 
 
 		 231 aa  88.6  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  33.54 
 
 		 231 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1978  isochorismatase hydrolase  32 
 
 		 185 aa  85.1  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  31.46 
 
 		 228 aa  84.7  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2817  isochorismatase hydrolase  35.22 
 
 		 188 aa  84.7  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369083  hitchhiker  0.00306149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  34.64 
 
 		 201 aa  84.7  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0076  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1660  isochorismatase family protein  28.05 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000971288  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4942  isochorismatase hydrolase  30.91 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334336 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2838  isochorismatase hydrolase  34.29 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102988  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1230  isochorismatase hydrolase  35.06 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  31.52 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4338  isochorismatase family protein  27.88 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5030  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0593911  decreased coverage  0.00786893 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3402  hypothetical protein  85.71 
 
 		 42 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  35.04 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4391  isochorismatase family protein  27.27 
 
 		 170 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0812  isochorismatase hydrolase  33.12 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2534  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.70955  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  34.31 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  34.31 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0367  amidase  27.61 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3001  isochorismatase hydrolase  36.43 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0439517  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  32.86 
 
 		 216 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4278  isochorismatase family protein  26.06 
 
 		 169 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0862  isochorismatase family protein  26.67 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3999  isochorismatase family protein  26.06 
 
 		 169 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4009  isochorismatase family protein  26.22 
 
 		 169 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  33.89 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4372  isochorismatase family protein  26.06 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  30.22 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  31.45 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6128  isochorismatase hydrolase  32 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  29.73 
 
 		 234 aa  72  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4084  isochorismatase hydrolase  36.51 
 
 		 219 aa  72  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2678  isochorismatase hydrolase  32.24 
 
 		 184 aa  72  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4196  isochorismatase hydrolase  36.51 
 
 		 219 aa  72  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1332  hypothetical protein  33.72 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>