124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1113 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  60.28 
 
 		 507 aa  647    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  100 
 
 		 508 aa  1064    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  66.93 
 
 		 508 aa  727    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  66.54 
 
 		 508 aa  713    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  59.68 
 
 		 507 aa  641    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  58.89 
 
 		 507 aa  632  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  54.53 
 
 		 507 aa  550  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  52.8 
 
 		 511 aa  538  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  54.7 
 
 		 507 aa  533  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  53.08 
 
 		 510 aa  533  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  49.3 
 
 		 515 aa  499  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2293  tryptophan halogenase  47.41 
 
 		 537 aa  496  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  46.18 
 
 		 513 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  46.18 
 
 		 513 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  45.79 
 
 		 513 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  42.5 
 
 		 526 aa  442  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  43.13 
 
 		 524 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  41.36 
 
 		 524 aa  435  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  43.31 
 
 		 508 aa  436  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  41.47 
 
 		 517 aa  434  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  43.36 
 
 		 514 aa  431  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  42.99 
 
 		 524 aa  421  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  40.86 
 
 		 518 aa  422  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  41 
 
 		 522 aa  420  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0239  putative tryptophan halogenase  39.33 
 
 		 537 aa  402  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  42.07 
 
 		 532 aa  403  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  41.13 
 
 		 514 aa  400  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  42.09 
 
 		 524 aa  401  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1105  ATPase  39.09 
 
 		 517 aa  398  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  41.5 
 
 		 527 aa  398  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3276  tryptophan halogenase  40.04 
 
 		 520 aa  392  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698237  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  38.82 
 
 		 513 aa  381  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  38.34 
 
 		 525 aa  381  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  40.64 
 
 		 505 aa  377  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1964  tryptophan halogenase  38.56 
 
 		 531 aa  375  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  39.89 
 
 		 522 aa  374  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  37.28 
 
 		 528 aa  372  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1124  tryptophan halogenase  37.06 
 
 		 543 aa  359  6e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1179  tryptophan halogenase  36.87 
 
 		 543 aa  359  7e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3178  tryptophan halogenase  36.69 
 
 		 543 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0464622 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1398  hypothetical protein  37.45 
 
 		 520 aa  353  5e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000535244 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1212  tryptophan halogenase  36.69 
 
 		 543 aa  352  8e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  35.47 
 
 		 529 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  35.84 
 
 		 508 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  35.24 
 
 		 529 aa  270  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  35.62 
 
 		 505 aa  269  7e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  34.51 
 
 		 508 aa  269  8e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  33.02 
 
 		 538 aa  259  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  33.02 
 
 		 538 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  34.54 
 
 		 538 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  34.33 
 
 		 538 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  34.33 
 
 		 538 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  34.33 
 
 		 538 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  35.81 
 
 		 492 aa  253  6e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  33.85 
 
 		 510 aa  251  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  38.25 
 
 		 507 aa  250  4e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  37.04 
 
 		 501 aa  249  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  37.09 
 
 		 502 aa  249  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  36.24 
 
 		 501 aa  247  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  33.79 
 
 		 498 aa  245  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  34.5 
 
 		 517 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  36.47 
 
 		 501 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  35.66 
 
 		 497 aa  242  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  34.97 
 
 		 537 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  33.4 
 
 		 499 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  33.78 
 
 		 499 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  33.14 
 
 		 499 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  34.69 
 
 		 504 aa  236  5.0000000000000005e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  34 
 
 		 502 aa  236  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  32.6 
 
 		 511 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  35.11 
 
 		 506 aa  235  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  32.94 
 
 		 494 aa  234  3e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  34.3 
 
 		 502 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  32.75 
 
 		 496 aa  234  4.0000000000000004e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  35.96 
 
 		 497 aa  233  5e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  32.49 
 
 		 503 aa  233  6e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  34.5 
 
 		 740 aa  232  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  33.94 
 
 		 515 aa  231  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  33.14 
 
 		 504 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  31.64 
 
 		 496 aa  231  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  31.9 
 
 		 496 aa  231  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  33.14 
 
 		 500 aa  231  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  34.62 
 
 		 506 aa  230  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  34.1 
 
 		 512 aa  229  9e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  34.25 
 
 		 505 aa  228  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  32.2 
 
 		 507 aa  228  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  33.01 
 
 		 501 aa  228  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  35.68 
 
 		 505 aa  227  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  35.02 
 
 		 523 aa  226  8e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  30.75 
 
 		 509 aa  226  8e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  32.36 
 
 		 509 aa  225  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  32.43 
 
 		 500 aa  225  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  35.6 
 
 		 498 aa  225  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  32.98 
 
 		 506 aa  225  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  31.94 
 
 		 505 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  35.21 
 
 		 501 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  31.73 
 
 		 501 aa  222  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  31.71 
 
 		 505 aa  221  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  34.39 
 
 		 501 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  32.43 
 
 		 497 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>