125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1139 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  98.22 
 
 		 505 aa  1042    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  98.43 
 
 		 508 aa  1051    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  100 
 
 		 508 aa  1065    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  36.56 
 
 		 532 aa  317  3e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  35.08 
 
 		 524 aa  295  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  33.6 
 
 		 507 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  32.55 
 
 		 507 aa  282  9e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  33.99 
 
 		 513 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  33.01 
 
 		 522 aa  278  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  33.99 
 
 		 513 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  33.79 
 
 		 513 aa  276  7e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  33.98 
 
 		 508 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  33.33 
 
 		 526 aa  269  8e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  34.51 
 
 		 508 aa  269  8e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  31.5 
 
 		 507 aa  267  4e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  34.05 
 
 		 507 aa  267  4e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  32.23 
 
 		 524 aa  265  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  33.14 
 
 		 503 aa  265  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  33.62 
 
 		 514 aa  265  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  32.54 
 
 		 507 aa  263  4e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  34.36 
 
 		 524 aa  263  6.999999999999999e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  33.79 
 
 		 508 aa  261  3e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  34.11 
 
 		 497 aa  261  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  31.91 
 
 		 492 aa  257  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  35.81 
 
 		 505 aa  256  5e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  34.06 
 
 		 504 aa  255  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  35.33 
 
 		 518 aa  254  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  34.62 
 
 		 501 aa  255  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  32.82 
 
 		 510 aa  253  5.000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  33.79 
 
 		 501 aa  253  6e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  32.56 
 
 		 500 aa  253  8.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  32.57 
 
 		 503 aa  252  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  33.78 
 
 		 740 aa  251  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2293  tryptophan halogenase  32.82 
 
 		 537 aa  251  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  34.21 
 
 		 502 aa  250  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  36.08 
 
 		 498 aa  249  6e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  32.87 
 
 		 515 aa  249  7e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  35.42 
 
 		 498 aa  249  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  33.55 
 
 		 514 aa  248  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  34.76 
 
 		 515 aa  248  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  35.42 
 
 		 505 aa  248  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  33.46 
 
 		 501 aa  248  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  31.63 
 
 		 525 aa  247  4e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  32.35 
 
 		 510 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  30.74 
 
 		 509 aa  246  6.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3276  tryptophan halogenase  30.33 
 
 		 520 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698237  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1964  tryptophan halogenase  32.44 
 
 		 531 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  31.96 
 
 		 503 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  31.21 
 
 		 524 aa  244  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  31.96 
 
 		 503 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  32.48 
 
 		 517 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  31.96 
 
 		 503 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  32.69 
 
 		 510 aa  243  5e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  33.2 
 
 		 496 aa  243  6e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  33.12 
 
 		 511 aa  243  6e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  31.76 
 
 		 503 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  30.81 
 
 		 529 aa  242  9e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  30.13 
 
 		 522 aa  242  1e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  33.78 
 
 		 505 aa  242  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  30.81 
 
 		 529 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  31.63 
 
 		 501 aa  241  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  31.98 
 
 		 508 aa  241  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  31.38 
 
 		 509 aa  241  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  31.24 
 
 		 502 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  32.49 
 
 		 496 aa  240  4e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  33.2 
 
 		 494 aa  239  6.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  32.82 
 
 		 502 aa  239  8e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0239  putative tryptophan halogenase  30.26 
 
 		 537 aa  239  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  32.51 
 
 		 505 aa  239  1e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  34.21 
 
 		 506 aa  238  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  33.78 
 
 		 507 aa  238  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  34.08 
 
 		 499 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  32.54 
 
 		 501 aa  236  6e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  31.14 
 
 		 513 aa  236  8e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1398  hypothetical protein  31.5 
 
 		 520 aa  235  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000535244 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1179  tryptophan halogenase  31.18 
 
 		 543 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  32.6 
 
 		 499 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  34.01 
 
 		 499 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  31.42 
 
 		 500 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  31.21 
 
 		 538 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  30.45 
 
 		 527 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  31.32 
 
 		 495 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  30.83 
 
 		 504 aa  234  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1105  ATPase  30.29 
 
 		 517 aa  234  3e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  31.49 
 
 		 538 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1212  tryptophan halogenase  31.49 
 
 		 543 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  31.51 
 
 		 497 aa  234  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  34.64 
 
 		 518 aa  233  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  32.24 
 
 		 497 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  31.29 
 
 		 538 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  30.34 
 
 		 507 aa  232  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1124  tryptophan halogenase  31.12 
 
 		 543 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  31.19 
 
 		 528 aa  231  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  32.99 
 
 		 517 aa  231  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  34.32 
 
 		 512 aa  230  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3178  tryptophan halogenase  30.55 
 
 		 543 aa  230  5e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0464622 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  32.43 
 
 		 497 aa  229  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  30.67 
 
 		 538 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  33.26 
 
 		 503 aa  228  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  30.64 
 
 		 498 aa  228  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>