More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_20410 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  100 
 
 		 194 aa  391  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  57.84 
 
 		 190 aa  221  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  55.68 
 
 		 189 aa  207  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  47.62 
 
 		 199 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  47.62 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  46.52 
 
 		 194 aa  165  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  44.68 
 
 		 184 aa  157  7e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  45.11 
 
 		 184 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  45.11 
 
 		 181 aa  155  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  42.7 
 
 		 183 aa  155  4e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  46.96 
 
 		 180 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0216  transposon resolvase  40 
 
 		 199 aa  148  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.159168 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  43.17 
 
 		 183 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0222  transposon resolvase  40.54 
 
 		 199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952158 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  40 
 
 		 191 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  44.32 
 
 		 189 aa  141  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  42.39 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  41.88 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  42.08 
 
 		 181 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  42.02 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  40.76 
 
 		 181 aa  135  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  40.11 
 
 		 183 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  40.11 
 
 		 183 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  39.89 
 
 		 198 aa  134  7.000000000000001e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0206  transposon resolvase  40.12 
 
 		 169 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000314886 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  41.05 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  40.51 
 
 		 201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  43.48 
 
 		 185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  39.25 
 
 		 184 aa  131  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  41.3 
 
 		 186 aa  131  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  42.86 
 
 		 191 aa  131  7.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  40.53 
 
 		 190 aa  128  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  43.78 
 
 		 219 aa  128  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  40.88 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 		 184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  38.8 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  37.82 
 
 		 197 aa  124  9e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  40.43 
 
 		 194 aa  121  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  40.43 
 
 		 194 aa  121  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  37.97 
 
 		 205 aa  121  7e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  37.97 
 
 		 205 aa  121  7e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  39.25 
 
 		 186 aa  121  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  40.69 
 
 		 176 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  42.54 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  40.41 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  38.14 
 
 		 197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3338  resolvase domain-containing protein  45.33 
 
 		 186 aa  118  7e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  38.38 
 
 		 198 aa  117  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  39.27 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  36.6 
 
 		 189 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  37.97 
 
 		 182 aa  117  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  36.51 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  39.8 
 
 		 309 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  42.02 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  38.17 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9004  DNA invertase  40.76 
 
 		 313 aa  116  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  41.4 
 
 		 309 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3847  resolvase-like protein  37.37 
 
 		 191 aa  115  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  40 
 
 		 193 aa  115  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  38.42 
 
 		 201 aa  114  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  41.99 
 
 		 189 aa  114  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  37.97 
 
 		 205 aa  113  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3501  resolvase domain-containing protein  42.41 
 
 		 324 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.654072  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  37.63 
 
 		 208 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4244  resolvase  38.66 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  38.92 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  40 
 
 		 194 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  36.65 
 
 		 198 aa  112  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  35.38 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  36.65 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4796  resolvase domain-containing protein  42.57 
 
 		 310 aa  111  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  38.59 
 
 		 214 aa  111  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  36.76 
 
 		 194 aa  111  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0155  resolvase x  35.75 
 
 		 193 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  38.71 
 
 		 197 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  38.71 
 
 		 197 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  39.56 
 
 		 188 aa  111  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  38.71 
 
 		 197 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  36.81 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  40.51 
 
 		 326 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  40.51 
 
 		 293 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  38.89 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  37.97 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0381075 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  46.9 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3876  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.3792 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  37.36 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  38.3 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3680  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2096  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0211835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  41.62 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25710  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  39.79 
 
 		 201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  36.67 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2482  TonB-dependent receptor protein  41.77 
 
 		 294 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  37.3 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  37.3 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  37.3 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  36.76 
 
 		 186 aa  108  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4189  TonB-dependent receptor protein  41.14 
 
 		 294 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2396  resolvase domain-containing protein  48.28 
 
 		 163 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.718289  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>