More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_19390 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_19390  Excinuclease ATPase subunit  100 
 
 		 837 aa  1709    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000025916 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1467  ABC transporter related  71.08 
 
 		 843 aa  1179    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0686  ABC transporter related  68.03 
 
 		 843 aa  1155    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.409076 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0836  excinuclease ATPase subunit  66.51 
 
 		 862 aa  1108    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1665  excinuclease ATPase subunit  45.64 
 
 		 846 aa  749    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2119  ABC transporter related  61.3 
 
 		 836 aa  986    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0955  ABC transporter related  47.68 
 
 		 837 aa  788    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  36.73 
 
 		 843 aa  529  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  36.83 
 
 		 838 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  36.81 
 
 		 853 aa  526  1e-148  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  35.31 
 
 		 834 aa  525  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  34.84 
 
 		 877 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0906  excinuclease ABC, A subunit  36.54 
 
 		 860 aa  515  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  36.45 
 
 		 861 aa  512  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  36.64 
 
 		 850 aa  512  1e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  36.77 
 
 		 832 aa  507  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  36.65 
 
 		 843 aa  504  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  34.83 
 
 		 844 aa  504  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3073  excinuclease ABC, A subunit  35.68 
 
 		 950 aa  503  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0918  excinuclease ABC subunit A  35.41 
 
 		 899 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  35.81 
 
 		 822 aa  503  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  35.22 
 
 		 838 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5906  excinuclease ABC subunit A  35.09 
 
 		 897 aa  497  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19620  excinuclease ABC, A subunit  36.14 
 
 		 863 aa  496  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  36.49 
 
 		 848 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  36.37 
 
 		 848 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1887  excinuclease ABC, A subunit  38.23 
 
 		 776 aa  494  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.72737 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0616  ABC transporter related  36.37 
 
 		 848 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2085  excinuclease ABC, A subunit  36.61 
 
 		 851 aa  495  9.999999999999999e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.56515 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  34.3 
 
 		 838 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6320  excinuclease ABC, A subunit  35.04 
 
 		 885 aa  487  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.687364  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0102  excinuclease ABC, A subunit  35.07 
 
 		 894 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0151  ABC transporter related  34.18 
 
 		 898 aa  483  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.160582 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2265  ABC transporter related  32.9 
 
 		 820 aa  485  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.285501  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0207  ABC transporter related  33.74 
 
 		 898 aa  479  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328362  normal  0.710281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  34.95 
 
 		 827 aa  482  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2036  Excinuclease ABC subunit A  35.65 
 
 		 944 aa  473  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0663505  hitchhiker  0.000130956 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5800  ABC transporter related  34.29 
 
 		 899 aa  474  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.177592  normal  0.587186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3676  excinuclease ABC subunit A  36.07 
 
 		 880 aa  473  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.090284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2778  excinuclease ABC, A subunit  34.63 
 
 		 838 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0742019  normal  0.349743 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4737  excinuclease ABC, A subunit  35.08 
 
 		 881 aa  475  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0951  ABC transporter related  36.78 
 
 		 833 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.321909 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2882  excinuclease ABC, A subunit  37.54 
 
 		 964 aa  468  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1518  ABC transporter related  32 
 
 		 823 aa  463  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.168965 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2123  excinuclease ABC, A subunit  35.35 
 
 		 944 aa  464  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429692 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0976  excinuclease ABC subunit A  37.32 
 
 		 931 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.177637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1787  ABC transporter related  36.25 
 
 		 845 aa  458  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184754  normal  0.778498 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0252  excinuclease ABC (subunit A)  37.11 
 
 		 942 aa  458  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00117135  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0546  excinuclease ABC, A subunit  35.48 
 
 		 946 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0457921  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1999  excinuclease ABC subunit A  37.52 
 
 		 946 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0576024  normal  0.88061 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  37.84 
 
 		 971 aa  453  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1158  excinuclease ABC subunit A  35.71 
 
 		 941 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  35.38 
 
 		 939 aa  456  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  35.24 
 
 		 939 aa  455  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1322  excinuclease ABC, A subunit  36 
 
 		 934 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0124703  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16220  excinuclease ABC, A subunit  36.19 
 
 		 941 aa  451  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266346  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_487  excinuclease ATPase subunit  35.62 
 
 		 946 aa  452  1e-125  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0328859  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1187  excinuclease ABC, A subunit  38.03 
 
 		 965 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1127  excinuclease ABC subunit A  38.18 
 
 		 966 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1160  excinuclease ABC, A subunit  35.29 
 
 		 953 aa  452  1e-125  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.216625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2991  excinuclease ABC subunit A  36.53 
 
 		 954 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.9416  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0885  excinuclease ABC, A subunit  35.51 
 
 		 947 aa  450  1e-125  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0440  excinuclease ABC subunit A  38.07 
 
 		 916 aa  451  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.674144  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  35.43 
 
 		 942 aa  451  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0522  excinuclease ABC subunit A  34.62 
 
 		 944 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0045705  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0411  excinuclease ABC, A subunit  36.8 
 
 		 957 aa  448  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0374  excinuclease ABC subunit A  36.26 
 
 		 952 aa  446  1.0000000000000001e-124  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1256  excinuclease ABC, A subunit  37.89 
 
 		 966 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145328  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1170  excinuclease ABC, A subunit  36.81 
 
 		 973 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1824  excinuclease ABC, A subunit  37.11 
 
 		 945 aa  442  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00152877  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1104  excinuclease ABC subunit A  33.95 
 
 		 939 aa  444  1e-123  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0800  excinuclease ABC subunit A  36.61 
 
 		 948 aa  443  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0294  excinuclease ABC, A subunit  36.96 
 
 		 946 aa  443  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2009  excinuclease ABC, A subunit  34.3 
 
 		 880 aa  446  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5328  excinuclease ABC subunit A  35.29 
 
 		 958 aa  443  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1792  excinuclease ABC, A subunit  34.74 
 
 		 824 aa  444  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0783  excinuclease ABC subunit A  36.61 
 
 		 948 aa  443  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.686779  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3709  excinuclease ABC subunit A  35.39 
 
 		 956 aa  442  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3325  excinuclease ABC, A subunit  35.29 
 
 		 937 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5271  excinuclease ABC subunit A  35.14 
 
 		 958 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3848  excinuclease ABC, A subunit  37.99 
 
 		 975 aa  440  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00424286  unclonable  0.0000162445 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5015  excinuclease ABC subunit A  35.14 
 
 		 958 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.93666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4844  excinuclease ABC subunit A  35.14 
 
 		 958 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4859  excinuclease ABC subunit A  35.14 
 
 		 958 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0474  excinuclease ABC, A subunit  36.44 
 
 		 946 aa  441  9.999999999999999e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0183853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0853  excinuclease ABC subunit A  34.92 
 
 		 954 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0128  excinuclease ABC subunit A  35.29 
 
 		 937 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5395  excinuclease ABC subunit A  35.14 
 
 		 958 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13060  Excinuclease ABC subunit A  36.94 
 
 		 968 aa  439  9.999999999999999e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5251  excinuclease ABC subunit A  35.14 
 
 		 958 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1422  excinuclease ABC, A subunit  36.79 
 
 		 963 aa  440  9.999999999999999e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0151035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1317  excinuclease ATPase subunit  35.14 
 
 		 953 aa  439  9.999999999999999e-123  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.133455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0554  excinuclease ABC, A subunit  35.01 
 
 		 938 aa  441  9.999999999999999e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0455  excinuclease ABC subunit A  37.64 
 
 		 916 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0811639  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07070  Excinuclease ABC subunit A  36.71 
 
 		 954 aa  438  1e-121  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.478607 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3111  excinuclease ABC subunit A  36.71 
 
 		 987 aa  439  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400929  normal  0.194384 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2823  excinuclease ABC, A subunit  34.74 
 
 		 980 aa  438  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.179729  normal  0.122251 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5672  excinuclease ABC subunit A  35 
 
 		 958 aa  439  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2022  excinuclease ABC subunit A  36.21 
 
 		 973 aa  437  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2119  excinuclease ABC, A subunit  35.84 
 
 		 942 aa  437  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000168396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>