More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_08360 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  54.99 
 
 		 840 aa  885    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08360  collagenase-like protease  100 
 
 		 825 aa  1689    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.593453 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  54.72 
 
 		 828 aa  898    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0995  peptidase U32  37.18 
 
 		 876 aa  466  1e-129  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  35.56 
 
 		 835 aa  402  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  33.52 
 
 		 847 aa  392  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  32.65 
 
 		 839 aa  365  2e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  32.58 
 
 		 836 aa  359  9.999999999999999e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  31.76 
 
 		 835 aa  355  1e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  32.18 
 
 		 872 aa  350  6e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  31.57 
 
 		 848 aa  346  8.999999999999999e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  33.08 
 
 		 862 aa  333  9e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  31.66 
 
 		 810 aa  328  3e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  29.37 
 
 		 783 aa  326  1e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  29.13 
 
 		 783 aa  324  3e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  32.19 
 
 		 783 aa  323  9.999999999999999e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  39.37 
 
 		 838 aa  321  3e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  31.28 
 
 		 835 aa  321  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  30.79 
 
 		 783 aa  313  5.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  35.24 
 
 		 886 aa  303  8.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  30 
 
 		 837 aa  302  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  28.95 
 
 		 817 aa  301  4e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  32.05 
 
 		 852 aa  291  4e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  30.53 
 
 		 835 aa  287  5e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  29.15 
 
 		 826 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  30.94 
 
 		 823 aa  283  1e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0153  peptidase U32  31.76 
 
 		 805 aa  280  5e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3702  protease  29.68 
 
 		 878 aa  280  8e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204118  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1732  peptidase U32  30.85 
 
 		 873 aa  280  9e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1293  peptidase U32  32.25 
 
 		 839 aa  278  3e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.461857  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1028  peptidase U32  29.92 
 
 		 834 aa  278  4e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  28.12 
 
 		 767 aa  268  4e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  29.15 
 
 		 877 aa  262  2e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  29.8 
 
 		 826 aa  257  6e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0699  peptidase U32  25 
 
 		 722 aa  254  7e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0703  peptidase U32  29.44 
 
 		 841 aa  252  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  30.52 
 
 		 851 aa  251  3e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1242  putative peptidase U32 family protein  30.7 
 
 		 843 aa  248  4e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.648851 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2286  peptidase U32  25.15 
 
 		 716 aa  246  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1572  peptidase U32  35.29 
 
 		 832 aa  245  3e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.812702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1796  peptidase U32  32.85 
 
 		 629 aa  245  3e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.191326 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1337  peptidase U32  26.53 
 
 		 736 aa  240  9e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  30.47 
 
 		 723 aa  239  2e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  34.97 
 
 		 822 aa  230  6e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1655  peptidase U32  28.97 
 
 		 833 aa  229  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1278  peptidase U32  28.34 
 
 		 847 aa  230  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.615717 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3754  peptidase U32  27.48 
 
 		 747 aa  228  4e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  33.75 
 
 		 790 aa  228  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0024  peptidase U32  32.9 
 
 		 792 aa  227  7e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000675639  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1301  peptidase U32  27.83 
 
 		 748 aa  226  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.506544  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0071  U32 family peptidase  39.77 
 
 		 746 aa  225  2e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1338  U32 family protease  30.87 
 
 		 621 aa  225  3e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.134167 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2182  peptidase U32  37.24 
 
 		 805 aa  220  7.999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0246456  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1744  peptidase U32  29.89 
 
 		 622 aa  220  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  39.47 
 
 		 411 aa  219  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3618  peptidase U32  32.17 
 
 		 790 aa  217  5.9999999999999996e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3552  peptidase U32  31.96 
 
 		 792 aa  217  7e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  37.82 
 
 		 406 aa  216  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3347  U32 family peptidase  32.68 
 
 		 790 aa  215  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0040  peptidase U32  33.76 
 
 		 790 aa  215  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0753  protease  31.13 
 
 		 635 aa  214  7e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3218  peptidase U32  44.07 
 
 		 757 aa  213  9e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467027 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0677  U32 family peptidase  31.45 
 
 		 639 aa  213  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0370  peptidase U32  36.39 
 
 		 818 aa  211  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  35.39 
 
 		 419 aa  210  7e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18310  Peptidase, U32 family  30.42 
 
 		 666 aa  210  7e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  32.9 
 
 		 408 aa  210  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0726  peptidase U32  31.1 
 
 		 667 aa  209  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1739  U32 family peptidase  30.93 
 
 		 653 aa  207  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00264856  hitchhiker  0.0000000000000113195 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2211  peptidase U32  30.74 
 
 		 653 aa  207  5e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.722535  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2414  peptidase U32  32.14 
 
 		 672 aa  207  5e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215421  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1793  peptidase U32  31.02 
 
 		 655 aa  207  6e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1738  peptidase, U32 family  31.1 
 
 		 654 aa  207  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2502  collagenase-like protein  37.22 
 
 		 746 aa  207  7e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.503721  normal  0.268664 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2040  peptidase, U32 family  30.74 
 
 		 667 aa  207  7e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0020805  hitchhiker  3.90569e-18 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01393  predicted peptidase  30.74 
 
 		 653 aa  207  8e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01403  hypothetical protein  30.74 
 
 		 653 aa  207  8e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2274  peptidase U32  30.53 
 
 		 666 aa  207  8e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.9196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1519  U32 family peptidase  30.74 
 
 		 667 aa  207  9e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1614  U32 family peptidase  30.74 
 
 		 667 aa  207  9e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2224  peptidase U32  30.74 
 
 		 667 aa  207  9e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1557  peptidase, U32 family  31.1 
 
 		 654 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1983  peptidase U32  31.55 
 
 		 654 aa  206  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.156367 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1721  peptidase, U32 family  31.1 
 
 		 654 aa  207  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1782  peptidase, U32 family  31.1 
 
 		 654 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3497  U32 family peptidase  30.37 
 
 		 666 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1718  peptidase, U32 family  31.1 
 
 		 654 aa  206  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.378979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  39.93 
 
 		 406 aa  206  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0818  peptidase U32  37.19 
 
 		 637 aa  205  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2870  peptidase U32  30.55 
 
 		 666 aa  204  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.615102 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3259  peptidase, U32 family  37.57 
 
 		 668 aa  203  9e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104421  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  35.73 
 
 		 407 aa  203  9e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3097  peptidase U32  36.78 
 
 		 668 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  42.14 
 
 		 439 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  42.24 
 
 		 404 aa  202  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0828  peptidase U32  31.91 
 
 		 638 aa  201  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00452719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3138  peptidase U32  36.68 
 
 		 638 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  41.94 
 
 		 412 aa  201  5e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  43.07 
 
 		 404 aa  200  7.999999999999999e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2078  peptidase U32  44.44 
 
 		 746 aa  200  7.999999999999999e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.292848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>