More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2753 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 309 aa  619  1e-176  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  39.02 
 
 		 313 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  37.7 
 
 		 316 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  37.7 
 
 		 316 aa  168  9e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  38.56 
 
 		 315 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  36.07 
 
 		 316 aa  162  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  34.92 
 
 		 335 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  38.56 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  36.54 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  36.66 
 
 		 310 aa  155  8e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  36.39 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  36.39 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  35.67 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  37.25 
 
 		 323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1855  2-dehydropantoate 2-reductase  33.02 
 
 		 316 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  33.55 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  39.47 
 
 		 307 aa  149  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  31.8 
 
 		 299 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  38.69 
 
 		 302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  36.36 
 
 		 312 aa  146  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  33.22 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  39.55 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2559  2-dehydropantoate 2-reductase  35.43 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.195971 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  32.03 
 
 		 307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  31.15 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  32.89 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  34.19 
 
 		 310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  33.77 
 
 		 313 aa  136  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0839  2-dehydropantoate 2-reductase  32.57 
 
 		 307 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0193  2-dehydropantoate 2-reductase  34.55 
 
 		 285 aa  135  8e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0380974  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  35.18 
 
 		 316 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  31.25 
 
 		 299 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  33.66 
 
 		 345 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  29.77 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  31.6 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  29.61 
 
 		 301 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2605  2-dehydropantoate 2-reductase  34.49 
 
 		 314 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  31.27 
 
 		 309 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  37.31 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  31.8 
 
 		 317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  32.35 
 
 		 295 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  32.59 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  31.82 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  34.32 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0707  2-dehydropantoate 2-reductase  36.86 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102156  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  32.14 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  31.82 
 
 		 305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  33.88 
 
 		 319 aa  126  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  31.48 
 
 		 294 aa  126  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1970  2-dehydropantoate 2-reductase  34.19 
 
 		 314 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181266  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2581  2-dehydropantoate 2-reductase  34.19 
 
 		 314 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.331281  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  31.82 
 
 		 305 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3648  2-dehydropantoate 2-reductase  31.53 
 
 		 319 aa  125  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0849606  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  31.82 
 
 		 305 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5912  2-dehydropantoate 2-reductase  33.54 
 
 		 314 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  31.82 
 
 		 305 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0462  2-dehydropantoate 2-reductase  32.24 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1100  2-dehydropantoate 2-reductase  36.36 
 
 		 302 aa  123  5e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0140808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0889  2-dehydropantoate 2-reductase  36.42 
 
 		 318 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.298016  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2482  2-dehydropantoate 2-reductase  36.42 
 
 		 318 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.386001  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  28.93 
 
 		 318 aa  122  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0095  2-dehydropantoate 2-reductase  36.42 
 
 		 318 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3535  2-dehydropantoate 2-reductase  32.37 
 
 		 311 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40675  hitchhiker  0.0000949952 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0708  2-dehydropantoate 2-reductase  31.53 
 
 		 311 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0348  2-dehydropantoate 2-reductase  36.42 
 
 		 313 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3116  2-dehydropantoate 2-reductase  30.09 
 
 		 343 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3603  2-dehydropantoate 2-reductase  33.64 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0816  2-dehydropantoate 2-reductase  30.1 
 
 		 320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0647  2-dehydropantoate 2-reductase  36.1 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00836625  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3726  2-dehydropantoate 2-reductase  33.02 
 
 		 312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3445  2-dehydropantoate 2-reductase  31.17 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1786  2-dehydropantoate 2-reductase  32.78 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.43842 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0377  2-dehydropantoate 2-reductase  27.3 
 
 		 316 aa  119  6e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2500  2-dehydropantoate 2-reductase  34.18 
 
 		 314 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.637616 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  31.41 
 
 		 301 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  28.75 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  31.79 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  32.05 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  31.86 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002696  2-dehydropantoate 2-reductase  27.83 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2865  2-dehydropantoate 2-reductase  29.05 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1115  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.275273  normal  0.917906 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1051  2-dehydropantoate 2-reductase  36.42 
 
 		 310 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0296  2-dehydropantoate 2-reductase  33.77 
 
 		 309 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.961677  normal  0.11487 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  30.23 
 
 		 302 aa  116  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  31.86 
 
 		 312 aa  116  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  31.6 
 
 		 305 aa  116  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  30.07 
 
 		 306 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  29.24 
 
 		 302 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  30.87 
 
 		 302 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  36.1 
 
 		 318 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1477  ketopantoate reductase  29.22 
 
 		 337 aa  115  7.999999999999999e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2629  2-dehydropantoate 2-reductase  33.02 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1351  2-dehydropantoate 2-reductase  29.61 
 
 		 307 aa  114  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  27.5 
 
 		 309 aa  114  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4088  2-dehydropantoate 2-reductase  28.67 
 
 		 306 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.77552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2895  2-dehydropantoate 2-reductase  30.94 
 
 		 306 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0400281  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3817  2-dehydropantoate 2-reductase  30.99 
 
 		 327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2470  2-dehydropantoate 2-reductase  28.06 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4968  2-dehydropantoate 2-reductase  30.03 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>