More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4707 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  100 
 
 
336 aa  697    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50110  Myo-inositol 2-dehydrogenase  52.08 
 
 
338 aa  363  2e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4658  inositol 2-dehydrogenase  51.49 
 
 
337 aa  360  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2417  Inositol 2-dehydrogenase  50.15 
 
 
337 aa  347  2e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1678  inositol 2-dehydrogenase  49.26 
 
 
336 aa  338  7e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187715  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3494  myo-inositol 2-dehydrogenase  51.19 
 
 
336 aa  334  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0220757  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1246  putative oxidoreductase myo-inositol 2-dehydrogenase signal peptide protein  49.55 
 
 
337 aa  333  4e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.405196  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7807  oxidoreductase domain protein  47.77 
 
 
336 aa  332  6e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3268  myo-inositol 2-dehydrogenase  51.04 
 
 
336 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00502229  normal  0.787324 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2320  inositol 2-dehydrogenase  47.48 
 
 
336 aa  329  3e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1887  inositol 2-dehydrogenase  49.55 
 
 
337 aa  328  7e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.28659 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1406  inositol 2-dehydrogenase  49.26 
 
 
337 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0946  myo-inositol 2-dehydrogenase  49.55 
 
 
337 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1428  inositol 2-dehydrogenase  49.55 
 
 
337 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1308  inositol 2-dehydrogenase  49.55 
 
 
337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4572  myo-inositol 2-dehydrogenase  49.55 
 
 
337 aa  325  6e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707429  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1347  inositol 2-dehydrogenase  48.96 
 
 
337 aa  322  4e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3283  myo-inositol 2-dehydrogenase  47.18 
 
 
341 aa  305  6e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.258069  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0653  oxidoreductase domain-containing protein  44.94 
 
 
334 aa  302  5.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2925  inositol 2-dehydrogenase  46.59 
 
 
337 aa  302  6.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.943398  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4015  inositol 2-dehydrogenase  46.59 
 
 
334 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2766  oxidoreductase domain protein  41.67 
 
 
335 aa  272  5.000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4534  oxidoreductase domain protein  41.49 
 
 
335 aa  272  7e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4051  Inositol 2-dehydrogenase  36.97 
 
 
348 aa  232  7.000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0814011  normal  0.183067 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2747  Inositol 2-dehydrogenase  36.69 
 
 
362 aa  217  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.505904  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0825  inositol 2-dehydrogenase  33.13 
 
 
337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0731  Inositol 2-dehydrogenase  37.69 
 
 
360 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246216  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1809  inositol 2-dehydrogenase  35.31 
 
 
341 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.762246 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0942  Inositol 2-dehydrogenase  32.74 
 
 
337 aa  211  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1723  myo-inositol 2-dehydrogenase  35.2 
 
 
347 aa  196  6e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0387  inositol 2-dehydrogenase  32.83 
 
 
343 aa  195  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3609  Inositol 2-dehydrogenase  32.75 
 
 
367 aa  189  7e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4020  inositol 2-dehydrogenase  32.34 
 
 
342 aa  188  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141873  normal  0.256136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2598  inositol 2-dehydrogenase  32.3 
 
 
349 aa  173  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0652194  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.33 
 
 
350 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  30.21 
 
 
345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  29.48 
 
 
334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  27.78 
 
 
345 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  28.53 
 
 
342 aa  129  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  27.78 
 
 
345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  27.78 
 
 
345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  27.78 
 
 
345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  27.78 
 
 
345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  30.47 
 
 
340 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  28.43 
 
 
349 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  28.74 
 
 
338 aa  122  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  28.86 
 
 
347 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.63 
 
 
349 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.87 
 
 
335 aa  119  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  30.12 
 
 
344 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  28.86 
 
 
337 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4853  Inositol 2-dehydrogenase  28.27 
 
 
339 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156724  normal  0.0403162 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  30.06 
 
 
340 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1850  inositol 2-dehydrogenase  27.18 
 
 
341 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2759  oxidoreductase domain protein  30.03 
 
 
336 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4156  Inositol 2-dehydrogenase  31.38 
 
 
352 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  26.98 
 
 
337 aa  117  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  35.35 
 
 
362 aa  116  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  30.42 
 
 
328 aa  116  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  29.76 
 
 
331 aa  116  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.84 
 
 
335 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  29.38 
 
 
339 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  26.79 
 
 
335 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0833  inositol 2-dehydrogenase  28.86 
 
 
368 aa  113  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000914593  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.97 
 
 
353 aa  113  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  29.41 
 
 
329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1331  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.91 
 
 
342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219827  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3047  myo-inositol 2-dehydrogenase, putative  27.81 
 
 
340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534823  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  29.32 
 
 
328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.32 
 
 
328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  29.32 
 
 
328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  25.15 
 
 
366 aa  109  5e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  29.5 
 
 
342 aa  109  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  25.44 
 
 
366 aa  109  8.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  28.02 
 
 
338 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  28.66 
 
 
331 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2642  myo-inositol dehydrogenase  29.03 
 
 
339 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.48575  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.46 
 
 
329 aa  106  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0918  myo-inositol dehydrogenase  30.12 
 
 
339 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1836  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.12 
 
 
339 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1449  myo-inositol dehydrogenase  30.12 
 
 
339 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0431  myo-inositol dehydrogenase  30.12 
 
 
339 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125174  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1682  putative inositol 2-dehydrogenase  30.12 
 
 
339 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0731  myo-inositol dehydrogenase  30.12 
 
 
339 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824559  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  30.12 
 
 
339 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  28.52 
 
 
328 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
337 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  29.34 
 
 
334 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  25.44 
 
 
336 aa  104  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1848  Inositol 2-dehydrogenase  32.69 
 
 
340 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0363596  normal  0.186986 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  26.45 
 
 
342 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04890  conserved hypothetical protein  27.91 
 
 
365 aa  103  6e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  28.48 
 
 
330 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  28.9 
 
 
330 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  29.97 
 
 
326 aa  102  9e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.67 
 
 
329 aa  102  9e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  28.14 
 
 
331 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.73 
 
 
334 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.51 
 
 
330 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  24.93 
 
 
340 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>