39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3069 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0510  Ig domain-containing protein  55.02 
 
 		 836 aa  841    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4080  hypothetical protein  56.29 
 
 		 826 aa  873    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0592  Ig domain-containing protein  55.79 
 
 		 840 aa  884    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3807  Ig domain-containing protein  57.09 
 
 		 837 aa  917    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3742  Ig domain-containing protein  52.63 
 
 		 851 aa  781    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3069  hypothetical protein  100 
 
 		 830 aa  1662    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0536  Ig domain protein group 1 domain protein  54.48 
 
 		 836 aa  831    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3457  Ig domain-containing protein  55.3 
 
 		 829 aa  847    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0493  Ig domain-containing protein  54.83 
 
 		 829 aa  844    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4390  Ig domain-containing protein  50.79 
 
 		 843 aa  745    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0531  Ig domain-containing protein  55.96 
 
 		 834 aa  862    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3723  Ig domain-containing protein  59.11 
 
 		 826 aa  926    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00549605  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0570  Ig domain-containing protein  54.82 
 
 		 851 aa  834    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.131384 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3633  Ig domain-containing protein  54.71 
 
 		 829 aa  842    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0191  Ig-like, group 1  36.72 
 
 		 811 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000536098  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1533  Ig domain-containing protein  36.64 
 
 		 807 aa  247  6.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000967383  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1320  Ig-like, group 1  33.48 
 
 		 821 aa  244  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00729266  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4101  Ig domain-containing protein  34.96 
 
 		 676 aa  232  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1853  Ig domain protein group 1 domain protein  33.73 
 
 		 817 aa  218  5e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.498276  hitchhiker  0.000000271075 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2480  Ig domain-containing protein  31.17 
 
 		 820 aa  213  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311981  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2226  Ig domain-containing protein  34.32 
 
 		 819 aa  209  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2843  Ig domain-containing protein  29.82 
 
 		 838 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000356214  decreased coverage  0.00000000529133 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2663  Ig-like, group 1  34.12 
 
 		 638 aa  201  6e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158035 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2252  Ig domain-containing protein  30.77 
 
 		 851 aa  200  7.999999999999999e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124017  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1195  intimin/invasin family protein  33.4 
 
 		 878 aa  199  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2330  Ig-like, group 1  29.56 
 
 		 818 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2498  Ig domain-containing protein  28.22 
 
 		 835 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284109  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1801  Ig domain-containing protein  29.55 
 
 		 837 aa  194  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716764  hitchhiker  0.0000241302 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1949  invasin domain-containing protein  27.48 
 
 		 1237 aa  194  7e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2611  Ig domain-containing protein  27.58 
 
 		 1209 aa  194  8e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062709 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2491  Ig domain-containing protein  27.58 
 
 		 1209 aa  193  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0314  hypothetical protein  31.63 
 
 		 651 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.358502  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1583  Ig domain-containing protein  27.66 
 
 		 1224 aa  170  9e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.61768  normal  0.0651551 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1658  Ig domain-containing protein  27.8 
 
 		 1224 aa  169  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377498  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1727  Ig domain-containing protein  25.95 
 
 		 1224 aa  168  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0783  hypothetical protein  32.16 
 
 		 476 aa  165  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.628796  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0677  hypothetical protein  31.07 
 
 		 638 aa  133  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2695  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit, glutamine-dependent  30.84 
 
 		 366 aa  111  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000319474  decreased coverage  0.000345849 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0935  hypothetical protein  31.71 
 
 		 498 aa  58.5  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.421015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>