More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1579 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1579  response regulator receiver  100 
 
 		 225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.410227  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1458  two component transcriptional regulator  54.13 
 
 		 218 aa  235  3e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1477  response regulator receiver  46.34 
 
 		 222 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.932866  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0257  response regulator receiver  36.99 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1806  two-component response regulator  35.62 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1272  response regulator receiver  38.71 
 
 		 216 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0272  response regulator receiver  40.45 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1917  DNA-binding response regulator  33.94 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0386  two component transcriptional regulator  32.57 
 
 		 222 aa  136  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0258  two component transcriptional regulator  35.78 
 
 		 217 aa  136  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0200742  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0884  two component transcriptional regulator  35.48 
 
 		 218 aa  134  8e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.68851  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1773  two component transcriptional regulator  35.19 
 
 		 217 aa  132  5e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0097  response regulator receiver  34.56 
 
 		 222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1089  DNA-binding response regulator RprY  32.13 
 
 		 245 aa  121  8e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.414682 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1365  two component transcriptional regulator  38.07 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00130586  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1280  DNA-binding response regulator  32.87 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000547046  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2004  response regulator receiver  35.48 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0693  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.11 
 
 		 229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0377  DNA-binding response regulator  32.72 
 
 		 226 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.306284  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0743  response regulator receiver  35.32 
 
 		 218 aa  118  7e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.38 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1324  extracellular solute-binding protein  31.94 
 
 		 220 aa  116  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0120  response regulator receiver  30 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0203  response regulator receiver  32.3 
 
 		 231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1180  response regulator receiver  32.87 
 
 		 214 aa  112  5e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  30.7 
 
 		 250 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  30.7 
 
 		 247 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  30.7 
 
 		 247 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2671  DNA-binding response regulator  30.7 
 
 		 247 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84234  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1358  DNA-binding response regulator  33.83 
 
 		 221 aa  111  9e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0519481  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  30.28 
 
 		 222 aa  111  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1236  DNA-binding response regulator  33.83 
 
 		 221 aa  111  9e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000188808  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2524  DNA-binding response regulator  30.88 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185339  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0776  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.74 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0107208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  30.22 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3651  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.28 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0435949 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  30.22 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0851  two component transcriptional regulator  28.84 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3209  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory proteinphoP  31.36 
 
 		 220 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1483  DNA-binding response regulator  34.11 
 
 		 226 aa  110  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1920  response regulator receiver  31.48 
 
 		 226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0649  two component transcriptional regulator  30.63 
 
 		 252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0840  transcriptional activator protein CopR  32.58 
 
 		 222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.048163  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1103  two-component response regulator  34.88 
 
 		 221 aa  108  5e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1802  two component transcriptional regulator  29.39 
 
 		 227 aa  108  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2042  two component transcriptional regulator  30.18 
 
 		 282 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143055  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2682  two component transcriptional regulator  30.18 
 
 		 242 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2653  two component transcriptional regulator  30.18 
 
 		 242 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0504  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000376141  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1664  DNA-binding response regulator  33.64 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0642  DNA-binding response regulator  30.18 
 
 		 291 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.743353  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2700  two component transcriptional regulator  30.18 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.469389  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2574  two component transcriptional regulator  30.18 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0439  two component transcriptional regulator  30.18 
 
 		 253 aa  106  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5980  two component transcriptional regulator  30.18 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  29.55 
 
 		 220 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0465  two component transcriptional regulator  29.44 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1927  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000341688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1920  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000662196  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1189  response regulator  27.15 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2399  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.57 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00272  hitchhiker  0.00893631 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1837  DNA-binding response regulator  33.18 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.591446  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1894  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000765732  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0128  two-component response regulator  35.45 
 
 		 228 aa  105  4e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.4797  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0871  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.41 
 
 		 214 aa  105  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143126  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0575  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.96 
 
 		 224 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.21251 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  28.83 
 
 		 223 aa  105  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0526  two component transcriptional regulator  29 
 
 		 229 aa  105  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0788787  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0670  two component transcriptional regulator  29.73 
 
 		 266 aa  105  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4983  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.9 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308886  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.73 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2083  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.129585  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  29.28 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.57 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519658 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  26.13 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6029  two component transcriptional regulator  27.98 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.167629 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  27.73 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  26.13 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0086  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.77 
 
 		 223 aa  102  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000430601  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.18 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4432  two component transcriptional regulator  30.41 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1631  two component transcriptional regulator  30.53 
 
 		 227 aa  102  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0039171  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0673  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.68 
 
 		 235 aa  102  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.996485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3566  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.6 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.720677 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0722  response regulator receiver domain-containing protein  29.82 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0554017  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0136  transcriptional activator protein CopR  32.41 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5200  DNA-binding response regulator  30.49 
 
 		 223 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0140  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 229 aa  102  6e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.794843  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3317  two component transcriptional regulator  28.18 
 
 		 227 aa  102  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3815  two component transcriptional regulator  29.22 
 
 		 219 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.681737  normal  0.25062 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.96 
 
 		 230 aa  102  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  28.44 
 
 		 243 aa  101  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  28.44 
 
 		 243 aa  101  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  30.14 
 
 		 220 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3794  two component transcriptional regulator  30.94 
 
 		 223 aa  101  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0280755  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  28.44 
 
 		 243 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2721  DNA-binding response regulator  28.83 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1480  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.73 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4638  two component transcriptional regulator  29.6 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1929  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.22 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.541945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>