More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2214 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2214  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 		 285 aa  587  1e-167  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3733  MCP methyltransferase, CheR-type  54.48 
 
 		 275 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0499524  normal  0.833336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4392  chemotaxis protein methyltransferase CheR  54.1 
 
 		 275 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1462  protein-glutamate O-methyltransferase  54.1 
 
 		 275 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2851  MCP methyltransferase, CheR-type  55.22 
 
 		 282 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.188729 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3953  MCP methyltransferase, CheR-type  54.1 
 
 		 275 aa  319  3e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20760  putative chemotaxis protein methyltransferase  55.22 
 
 		 274 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4252  MCP methyltransferase, CheR-type  53.73 
 
 		 275 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1782  putative chemotaxis protein methyltransferase  55.22 
 
 		 274 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1928  chemotaxis protein methyltransferase CheR  53.02 
 
 		 280 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3485  protein-glutamate O-methyltransferase  52.67 
 
 		 280 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1216  MCP methyltransferase, CheR-type  50.72 
 
 		 275 aa  293  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.189092  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1177  protein-glutamate O-methyltransferase  51.09 
 
 		 275 aa  293  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0805405  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1302  protein-glutamate O-methyltransferase  47.81 
 
 		 279 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1069  protein-glutamate O-methyltransferase  45.88 
 
 		 278 aa  268  7e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0178115  normal  0.0152511 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1596  MCP methyltransferase, CheR-type  48.72 
 
 		 277 aa  267  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  48.72 
 
 		 279 aa  267  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2319  protein-glutamate O-methyltransferase  49.08 
 
 		 277 aa  268  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.945432  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3251  chemotaxis protein methyltransferase CheR  48.35 
 
 		 279 aa  266  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1258  MCP methyltransferase, CheR-type  48.72 
 
 		 279 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1328  MCP methyltransferase, CheR-type  48.72 
 
 		 279 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1476  chemotaxis protein methyltransferase CheR  46.57 
 
 		 276 aa  266  4e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1344  MCP methyltransferase, CheR-type  48.35 
 
 		 277 aa  265  5e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.841955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1160  MCP methyltransferase, CheR-type  48.72 
 
 		 277 aa  265  7e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1339  MCP methyltransferase, CheR-type  46.76 
 
 		 277 aa  265  8e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3088  protein-glutamate O-methyltransferase  47.27 
 
 		 277 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2598  protein-glutamate O-methyltransferase  47.62 
 
 		 279 aa  264  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3101  protein-glutamate O-methyltransferase  47.62 
 
 		 279 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  47.62 
 
 		 279 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2963  protein-glutamate O-methyltransferase  47.62 
 
 		 279 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.643676  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2948  protein-glutamate O-methyltransferase  47.62 
 
 		 279 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004174  chemotaxis protein methyltransferase CheR  46.1 
 
 		 275 aa  258  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02929  chemotaxis protein methyltransferase CheR  48.3 
 
 		 276 aa  256  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.723494  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01283  chemotaxis methyltransferase CheR  45.72 
 
 		 275 aa  255  5e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2339  chemotaxis protein methyltransferase CheR  44.85 
 
 		 275 aa  252  4.0000000000000004e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0892  MCP methyltransferase, CheR-type  45.22 
 
 		 275 aa  249  3e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1793  chemotaxis protein methyltransferase CheR  44.61 
 
 		 275 aa  248  8e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0521  protein-glutamate O-methyltransferase  44.73 
 
 		 275 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.644079  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0925  MCP methyltransferase, CheR-type  46.32 
 
 		 271 aa  241  7.999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1430  MCP methyltransferase, CheR-type  43.59 
 
 		 267 aa  217  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3101  MCP methyltransferase, CheR-type  43.12 
 
 		 278 aa  216  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0448745  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1533  protein-glutamate O-methyltransferase  41.3 
 
 		 285 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0781767 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1813  MCP methyltransferase, CheR-type  41.3 
 
 		 285 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1710  MCP methyltransferase, CheR-type  40.49 
 
 		 285 aa  206  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4031  MCP methyltransferase, CheR-type  41.3 
 
 		 287 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236096  normal  0.66198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1695  MCP methyltransferase, CheR-type  38.87 
 
 		 289 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4834  MCP methyltransferase, CheR-type  39.27 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162738  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  41.3 
 
 		 289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3582  MCP methyltransferase, CheR-type  38.18 
 
 		 302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0527  MCP methyltransferase, CheR-type  39.27 
 
 		 289 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3855  MCP methyltransferase, CheR-type  38.06 
 
 		 291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2320  MCP methyltransferase, CheR-type  38.01 
 
 		 291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1821  MCP methyltransferase, CheR-type  39.68 
 
 		 292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101872  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1494  protein-glutamate O-methyltransferase  38.87 
 
 		 292 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3372  MCP methyltransferase, CheR-type  39.68 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0662  MCP methyltransferase, CheR-type  37.5 
 
 		 278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.893478 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1874  MCP methyltransferase, CheR-type  38.46 
 
 		 291 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4243  MCP methyltransferase, CheR-type  39.83 
 
 		 290 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3916  MCP methyltransferase, CheR-type  39.68 
 
 		 289 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0524  MCP methyltransferase, CheR-type  38.46 
 
 		 288 aa  181  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3801  MCP methyltransferase, CheR-type  37.25 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3674  protein-glutamate O-methyltransferase  39.68 
 
 		 292 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1533  putative chemotaxis protein methyltransferase cheR  38.46 
 
 		 292 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30900  MCP methyltransferase, CheR-type  39.53 
 
 		 272 aa  178  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5002  MCP methyltransferase, CheR-type  38.25 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  36.25 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.349462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3598  MCP methyltransferase, CheR-type  36.4 
 
 		 278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0123942  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1912  Protein-glutamate O-methyltransferase  35.06 
 
 		 278 aa  172  3.9999999999999995e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0842494  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1788  MCP methyltransferase, CheR-type  34.43 
 
 		 316 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.275448  normal  0.703081 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0322  Protein-glutamate O-methyltransferase  36.9 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.294679 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4228  MCP methyltransferase, CheR-type  35.04 
 
 		 274 aa  167  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  33.71 
 
 		 414 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0215  MCP methyltransferase, CheR-type  34.8 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.177352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  31.8 
 
 		 297 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0524  MCP methyltransferase, CheR-type  34.07 
 
 		 280 aa  162  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  35.77 
 
 		 280 aa  162  6e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1529  MCP methyltransferase, CheR-type  34.06 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  36.05 
 
 		 280 aa  159  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0987  MCP methyltransferase, CheR-type  34.25 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0069  MCP methyltransferase, CheR-type  33.33 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0875  MCP methyltransferase, CheR-type  34.5 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2984  protein-glutamate O-methyltransferase  31.83 
 
 		 285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1595  MCP methyltransferase, CheR-type  31.93 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2618  MCP methyltransferase, CheR-type  32.58 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0089  MCP methyltransferase, CheR-type  32.69 
 
 		 283 aa  149  6e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0783  protein-glutamate O-methyltransferase  35.34 
 
 		 269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.827996  normal  0.901412 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2700  MCP methyltransferase, CheR-type  34.46 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0700  MCP methyltransferase, CheR-type  34.21 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0237  protein-glutamate O-methyltransferase  33.6 
 
 		 307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.291409 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1143  chemotaxis protein methyltransferase CheR  33.94 
 
 		 292 aa  145  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0207024  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0904  MCP methyltransferase, CheR-type  34.51 
 
 		 267 aa  145  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0878  MCP methyltransferase, CheR-type  32.25 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0614  MCP methyltransferase, CheR-type  30.15 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0483798 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0808  MCP methyltransferase, CheR-type  32.14 
 
 		 272 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2710  protein-glutamate O-methyltransferase  32.34 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0579  MCP methyltransferase, CheR-type  30.85 
 
 		 280 aa  143  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3299  protein-glutamate O-methyltransferase  32.16 
 
 		 275 aa  142  5e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0300  MCP methyltransferase, CheR-type  33.07 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000961073  normal  0.256387 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  33.2 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0910  chemotaxis protein methyltransferase CheR  33.33 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>