85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2050 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2050  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 		 231 aa  484  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.510471 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1654  methyltransferase type 11  48.03 
 
 		 236 aa  240  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.190237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3787  hypothetical protein  46.75 
 
 		 237 aa  240  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206629  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1929  Methyltransferase type 11  37.95 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000245244  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2034  methyltransferase type 11  37.78 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0142527  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3501  methyltransferase type 12  26.37 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1013  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.178018 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1467  putative methyltransferase superfamily  25.89 
 
 		 229 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000625282 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0229  hypothetical protein  25.96 
 
 		 236 aa  90.1  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2149  hypothetical protein  28.73 
 
 		 223 aa  89.7  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5330  Methyltransferase type 12  29.3 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.918078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2578  SAM-dependent methyltransferases  33.55 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2078  methyltransferase type 12  30.16 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0969  methyltransferase type 12  30.05 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.71453 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3745  methyltransferase type 11  28.8 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195128  normal  0.0952192 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6845  Methyltransferase type 12  28.11 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.613911  normal  0.262077 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3655  SAM binding protein  29.41 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2442  hypothetical protein  33.96 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0880  hypothetical protein  33.96 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.480713  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0581  hypothetical protein  34.19 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5571  methyltransferase type 11  28.27 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4897  methyltransferase type 11  30.21 
 
 		 234 aa  72  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107852  hitchhiker  0.000103061 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3848  methyltransferase type 11  27.37 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3679  methyltransferase type 11  27.37 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321356  normal  0.0182124 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2248  hypothetical protein  27.89 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4516  methyltransferase type 11  27.37 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178821  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3652  hypothetical protein  25.21 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282705  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38210  hypothetical protein  27.88 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000336854 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4362  methyltransferase type 12  27.37 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3337  methyltransferase type 12  26.34 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0912  Methyltransferase type 12  23.76 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734519 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3708  methyltransferase type 12  34.92 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.434714  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2164  methyltransferase type 12  24.59 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00394597  normal  0.509385 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4095  methyltransferase type 12  28.25 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3251  hypothetical protein  27.92 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0176618  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3121  methyltransferase type 12  30.56 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1085  methyltransferase type 12  25.63 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  26.15 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0085  Methyltransferase type 11  25.62 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  31.21 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2979  methyltransferase type 12  26.6 
 
 		 237 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7775  hypothetical protein  23.98 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0855  Methyltransferase type 11  21.62 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2106  Methyltransferase type 12  31.19 
 
 		 352 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 355 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  23.98 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 355 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 355 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19651  hypothetical protein  26.13 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0644174 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2488  methyltransferase type 12  28.04 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.363231  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 344 aa  48.1  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  27.22 
 
 		 202 aa  47.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2017  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  22.79 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95818  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  22.93 
 
 		 356 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  27.59 
 
 		 575 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  22.62 
 
 		 356 aa  47  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1465  SAM-dependent methyltransferase  32.86 
 
 		 152 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1662  hypothetical protein  32.86 
 
 		 152 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516086  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 305 aa  45.4  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  25.55 
 
 		 360 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  28.08 
 
 		 310 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3590  hypothetical protein  22.68 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.15692 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 348 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 351 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  23.46 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 351 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  22.9 
 
 		 269 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.57 
 
 		 205 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  26.9 
 
 		 307 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  25.69 
 
 		 264 aa  42.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  24.79 
 
 		 268 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1328  Methyltransferase type 12  26.5 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.877315  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  24.79 
 
 		 268 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1197  methyltransferase type 12  23.53 
 
 		 223 aa  43.1  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.500309 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3607  hypothetical protein  31.51 
 
 		 239 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  27.68 
 
 		 351 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1569  methyltransferase type 11  24.27 
 
 		 268 aa  42.4  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4229  protein of unknown function DUF938  31.33 
 
 		 200 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106543  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4073  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 208 aa  42  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  26.35 
 
 		 248 aa  42  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3600  hypothetical protein  31.51 
 
 		 239 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  24.46 
 
 		 414 aa  42  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2765  methyltransferase type 12  33.04 
 
 		 348 aa  42  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2845  methyltransferase type 11  29.06 
 
 		 348 aa  42  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292154 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>