125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1398 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1398  hypothetical protein  100 
 
 		 520 aa  1084    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000535244 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  48.44 
 
 		 514 aa  516  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3276  tryptophan halogenase  47.08 
 
 		 520 aa  511  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698237  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  46.3 
 
 		 525 aa  503  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  45.27 
 
 		 528 aa  498  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3178  tryptophan halogenase  45.68 
 
 		 543 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0464622 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1124  tryptophan halogenase  45.57 
 
 		 543 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1179  tryptophan halogenase  45.57 
 
 		 543 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1212  tryptophan halogenase  45.57 
 
 		 543 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  47.95 
 
 		 524 aa  491  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1105  ATPase  46.33 
 
 		 517 aa  483  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  46.55 
 
 		 526 aa  479  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  45.33 
 
 		 517 aa  480  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0239  putative tryptophan halogenase  45.74 
 
 		 537 aa  472  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  44.53 
 
 		 522 aa  473  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  44.61 
 
 		 524 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  45.44 
 
 		 508 aa  467  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  45.85 
 
 		 505 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  44.29 
 
 		 514 aa  445  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1964  tryptophan halogenase  42.5 
 
 		 531 aa  429  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  43.98 
 
 		 513 aa  427  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  39.58 
 
 		 524 aa  402  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  42.48 
 
 		 518 aa  403  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  42.35 
 
 		 527 aa  402  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  37.72 
 
 		 513 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  37.82 
 
 		 513 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  37.72 
 
 		 513 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  38.25 
 
 		 507 aa  361  2e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  38.46 
 
 		 532 aa  356  5e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  37.98 
 
 		 507 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  37.45 
 
 		 508 aa  353  5e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  39 
 
 		 508 aa  352  1e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  38.03 
 
 		 507 aa  349  7e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  38.31 
 
 		 508 aa  343  5e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  36.19 
 
 		 507 aa  342  1e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  38.01 
 
 		 507 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  36.86 
 
 		 524 aa  323  3e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  36.26 
 
 		 522 aa  317  5e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  34.94 
 
 		 515 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  34.38 
 
 		 510 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2293  tryptophan halogenase  34.38 
 
 		 537 aa  306  7e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  34.31 
 
 		 511 aa  300  4e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  31.91 
 
 		 508 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  31.5 
 
 		 508 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  33.33 
 
 		 529 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  32.77 
 
 		 505 aa  233  6e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  33.11 
 
 		 529 aa  233  9e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  33.05 
 
 		 498 aa  230  5e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  31.82 
 
 		 517 aa  230  6e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  32.88 
 
 		 501 aa  223  9e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  31.46 
 
 		 511 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  32.16 
 
 		 502 aa  220  5e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  30.25 
 
 		 503 aa  219  8.999999999999998e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  30.56 
 
 		 501 aa  219  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  32.42 
 
 		 492 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  31.83 
 
 		 501 aa  218  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  30.73 
 
 		 494 aa  216  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  31.09 
 
 		 505 aa  214  4.9999999999999996e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  31.71 
 
 		 505 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  30.34 
 
 		 502 aa  213  7e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  30.17 
 
 		 509 aa  212  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  31.44 
 
 		 507 aa  211  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  33.57 
 
 		 501 aa  210  4e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  33.11 
 
 		 515 aa  210  5e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  28.21 
 
 		 538 aa  209  8e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  28.57 
 
 		 538 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  30.19 
 
 		 497 aa  207  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  28.6 
 
 		 538 aa  206  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  30.8 
 
 		 501 aa  205  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  32.86 
 
 		 496 aa  204  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  27.66 
 
 		 538 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  32.55 
 
 		 506 aa  203  6e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  31.86 
 
 		 499 aa  203  6e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  27.66 
 
 		 538 aa  203  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  27.66 
 
 		 538 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  29.26 
 
 		 495 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  31 
 
 		 504 aa  202  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  31.86 
 
 		 499 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  29.43 
 
 		 504 aa  202  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  31.86 
 
 		 499 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  32.43 
 
 		 507 aa  201  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  31.35 
 
 		 501 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  31.36 
 
 		 503 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  28.95 
 
 		 510 aa  200  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  28.04 
 
 		 537 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  31.28 
 
 		 501 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  29.89 
 
 		 523 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  32.91 
 
 		 502 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  30 
 
 		 497 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  31.04 
 
 		 499 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  32.48 
 
 		 496 aa  196  6e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  32.77 
 
 		 740 aa  196  8.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  31.41 
 
 		 506 aa  196  9e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  30.77 
 
 		 500 aa  195  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  30.95 
 
 		 512 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  29.09 
 
 		 506 aa  194  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  32.55 
 
 		 510 aa  194  4e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  29.38 
 
 		 503 aa  193  7e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  31.33 
 
 		 505 aa  193  8e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  29.19 
 
 		 503 aa  193  8e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>